MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011080	GCTC	2	8	712611	712618	0 %	25 %	25 %	50 %	194445031
13502	NC_011080	TCAT	2	8	712634	712641	25 %	50 %	0 %	25 %	194445031
13503	NC_011080	GCA	2	6	712671	712676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445031
13504	NC_011080	GTG	2	6	712765	712770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445031
13505	NC_011080	GCC	2	6	712793	712798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445031
13506	NC_011080	GCA	3	9	712824	712832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445031
13507	NC_011080	CGCA	2	8	712861	712868	25 %	0 %	25 %	50 %	194445031
13508	NC_011080	GC	3	6	712884	712889	0 %	0 %	50 %	50 %	194445031
13509	NC_011080	GTT	2	6	712893	712898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445031
13510	NC_011080	GGCG	2	8	712956	712963	0 %	0 %	75 %	25 %	194442518
13511	NC_011080	CCG	2	6	712964	712969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442518
13512	NC_011080	CGG	2	6	712979	712984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442518
13513	NC_011080	CCT	2	6	712988	712993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442518
13514	NC_011080	TCG	2	6	712997	713002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442518
13515	NC_011080	CCG	2	6	713012	713017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442518
13516	NC_011080	CG	3	6	713016	713021	0 %	0 %	50 %	50 %	194442518
13517	NC_011080	GAA	2	6	713127	713132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442518
13518	NC_011080	GATAG	2	10	713154	713163	40 %	20 %	40 %	0 %	194442518
13519	NC_011080	CCG	2	6	713219	713224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442518
13520	NC_011080	ATC	2	6	713398	713403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442518
13521	NC_011080	CGG	2	6	713456	713461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442518
13522	NC_011080	AAC	2	6	713482	713487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442518
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13524	NC_011080	GAG	2	6	713540	713545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446717
13525	NC_011080	CCA	2	6	713599	713604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446717
13526	NC_011080	TTC	2	6	713636	713641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446717
13527	NC_011080	GTG	2	6	713706	713711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446717
13528	NC_011080	CCA	2	6	713716	713721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446717
13529	NC_011080	TCG	2	6	713730	713735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446717
13530	NC_011080	GCG	2	6	713806	713811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446717
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13533	NC_011080	CGC	2	6	713921	713926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446717
13534	NC_011080	CGG	2	6	713949	713954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446717
13535	NC_011080	ATC	2	6	713960	713965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446717
13536	NC_011080	GT	3	6	714063	714068	0 %	50 %	50 %	0 %	194446717
13537	NC_011080	TAA	2	6	714094	714099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446717
13538	NC_011080	CCG	2	6	714148	714153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446717
13539	NC_011080	CAT	2	6	714164	714169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446717
13540	NC_011080	TCG	2	6	714315	714320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446717
13541	NC_011080	CGA	2	6	714325	714330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446717
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13543	NC_011080	GAA	2	6	714473	714478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446717
13544	NC_011080	ATG	2	6	714498	714503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446717
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13548	NC_011080	CG	3	6	714600	714605	0 %	0 %	50 %	50 %	194446717
13549	NC_011080	GGT	2	6	714674	714679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446717
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13552	NC_011080	GC	3	6	714814	714819	0 %	0 %	50 %	50 %	194446717
13553	NC_011080	CGC	2	6	714920	714925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446717
13554	NC_011080	CGG	2	6	715015	715020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446717
13555	NC_011080	GCC	2	6	715137	715142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446717
13556	NC_011080	T	6	6	715202	715207	0 %	100 %	0 %	0 %	194446717
13557	NC_011080	TTCGGC	2	12	715223	715234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446717
13558	NC_011080	TCG	2	6	715254	715259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446717
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13560	NC_011080	GTT	2	6	715280	715285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446717
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13563	NC_011080	CGGG	2	8	715355	715362	0 %	0 %	75 %	25 %	194446717
13564	NC_011080	CAG	3	9	715575	715583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446717
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13567	NC_011080	GAA	2	6	715685	715690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446717
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13588	NC_011080	CAA	2	6	717101	717106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445835
13589	NC_011080	GCA	2	6	717124	717129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445835
13590	NC_011080	GCT	3	9	717145	717153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445835
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13592	NC_011080	GCG	2	6	717240	717245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445835
13593	NC_011080	TTCT	2	8	717255	717262	0 %	75 %	0 %	25 %	194445835
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13599	NC_011080	TAC	2	6	717613	717618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445835
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13606	NC_011080	TGG	2	6	717953	717958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444287
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13742	NC_011080	AACGC	2	10	724046	724055	40 %	0 %	20 %	40 %	194446274
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13980	NC_011080	TAA	2	6	735156	735161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442405
13981	NC_011080	GTATC	2	10	735173	735182	20 %	40 %	20 %	20 %	194442405
13982	NC_011080	T	7	7	735233	735239	0 %	100 %	0 %	0 %	194442405
13983	NC_011080	CGAA	2	8	735259	735266	50 %	0 %	25 %	25 %	194442405
13984	NC_011080	GCT	2	6	735273	735278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442405
13985	NC_011080	GATT	2	8	735279	735286	25 %	50 %	25 %	0 %	194442405
13986	NC_011080	ATA	2	6	735317	735322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442405
13987	NC_011080	GCAAA	2	10	735495	735504	60 %	0 %	20 %	20 %	194442405
13988	NC_011080	CAGC	2	8	735519	735526	25 %	0 %	25 %	50 %	194442405
13989	NC_011080	CAT	2	6	735574	735579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442405
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13991	NC_011080	GCG	2	6	735725	735730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442405
13992	NC_011080	GA	3	6	735803	735808	50 %	0 %	50 %	0 %	194442405
13993	NC_011080	AGC	2	6	735818	735823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442405
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13998	NC_011080	GA	3	6	736020	736025	50 %	0 %	50 %	0 %	194442405
13999	NC_011080	AAT	2	6	736049	736054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442405
14000	NC_011080	CAG	3	9	736060	736068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442405

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