MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011080	GAT	2	6	661844	661849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444600
12502	NC_011080	CCG	2	6	661886	661891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
12503	NC_011080	CGG	2	6	661966	661971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12504	NC_011080	GC	3	6	661985	661990	0 %	0 %	50 %	50 %	194444600
12505	NC_011080	GGA	2	6	662252	662257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444600
12506	NC_011080	GTG	2	6	662298	662303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444600
12507	NC_011080	ACG	3	9	662314	662322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12508	NC_011080	GGC	2	6	662354	662359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12509	NC_011080	CGCCA	2	10	662372	662381	20 %	0 %	20 %	60 %	194444600
12510	NC_011080	CTG	2	6	662386	662391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12511	NC_011080	CGG	2	6	662417	662422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12512	NC_011080	TAC	2	6	662423	662428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444600
12513	NC_011080	TAC	2	6	662469	662474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444600
12514	NC_011080	GCA	2	6	662485	662490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12515	NC_011080	GAG	2	6	662511	662516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444600
12516	NC_011080	CGC	2	6	662540	662545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
12517	NC_011080	GC	3	6	662572	662577	0 %	0 %	50 %	50 %	194444600
12518	NC_011080	TCTT	2	8	662584	662591	0 %	75 %	0 %	25 %	194444600
12519	NC_011080	GGC	2	6	662769	662774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12520	NC_011080	GC	3	6	662773	662778	0 %	0 %	50 %	50 %	194444600
12521	NC_011080	GCC	2	6	662796	662801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
12522	NC_011080	GCA	2	6	662831	662836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12523	NC_011080	GAC	2	6	662931	662936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12524	NC_011080	GTGG	2	8	662942	662949	0 %	25 %	75 %	0 %	194444600
12525	NC_011080	GCC	2	6	662972	662977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
12526	NC_011080	GTC	2	6	662989	662994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12527	NC_011080	TGA	2	6	662995	663000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444600
12528	NC_011080	CG	3	6	663001	663006	0 %	0 %	50 %	50 %	194444600
12529	NC_011080	GATCT	2	10	663090	663099	20 %	40 %	20 %	20 %	194444600
12530	NC_011080	AGATC	2	10	663143	663152	40 %	20 %	20 %	20 %	194444600
12531	NC_011080	GCG	2	6	663160	663165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12532	NC_011080	AGA	2	6	663166	663171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444600
12533	NC_011080	GCC	2	6	663174	663179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
12534	NC_011080	CGG	2	6	663211	663216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12535	NC_011080	GCG	2	6	663225	663230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
12536	NC_011080	CTG	2	6	663252	663257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
12537	NC_011080	A	6	6	663262	663267	100 %	0 %	0 %	0 %	194444600
12538	NC_011080	TGG	2	6	663280	663285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444600
12539	NC_011080	TGCGT	2	10	663372	663381	0 %	40 %	40 %	20 %	194444600
12540	NC_011080	A	6	6	663414	663419	100 %	0 %	0 %	0 %	194444600
12541	NC_011080	CAA	2	6	663528	663533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446405
12542	NC_011080	GC	3	6	663558	663563	0 %	0 %	50 %	50 %	194446405
12543	NC_011080	GCT	2	6	663567	663572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12544	NC_011080	ATG	2	6	663625	663630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446405
12545	NC_011080	CGC	2	6	663651	663656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446405
12546	NC_011080	CAT	2	6	663679	663684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446405
12547	NC_011080	CG	3	6	663733	663738	0 %	0 %	50 %	50 %	194446405
12548	NC_011080	CAG	2	6	663784	663789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12549	NC_011080	GGT	2	6	663792	663797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446405
12550	NC_011080	CGC	2	6	663866	663871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446405
12551	NC_011080	TCA	2	6	663908	663913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446405
12552	NC_011080	ACC	2	6	663946	663951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446405
12553	NC_011080	TGG	2	6	663989	663994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446405
12554	NC_011080	CGT	2	6	664068	664073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12555	NC_011080	GCT	2	6	664086	664091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12556	NC_011080	GCG	2	6	664117	664122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446405
12557	NC_011080	CGA	2	6	664158	664163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12558	NC_011080	TGAT	2	8	664184	664191	25 %	50 %	25 %	0 %	194446405
12559	NC_011080	ATG	2	6	664213	664218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446405
12560	NC_011080	GGC	2	6	664224	664229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446405
12561	NC_011080	GC	3	6	664228	664233	0 %	0 %	50 %	50 %	194446405
12562	NC_011080	TGG	2	6	664297	664302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446405
12563	NC_011080	GCT	2	6	664305	664310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446405
12564	NC_011080	CGGGG	2	10	664370	664379	0 %	0 %	80 %	20 %	194444090
12565	NC_011080	TTG	2	6	664411	664416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444090
12566	NC_011080	GT	3	6	664531	664536	0 %	50 %	50 %	0 %	194444090
12567	NC_011080	A	6	6	664540	664545	100 %	0 %	0 %	0 %	194444090
12568	NC_011080	CGC	2	6	664546	664551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444090
12569	NC_011080	CGA	2	6	664616	664621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444090
12570	NC_011080	GCA	2	6	664625	664630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444090
12571	NC_011080	CAG	2	6	664698	664703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444090
12572	NC_011080	GCG	2	6	664734	664739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444090
12573	NC_011080	CGC	2	6	664744	664749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444090
12574	NC_011080	GCG	2	6	664782	664787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444090
12575	NC_011080	CGAC	2	8	664864	664871	25 %	0 %	25 %	50 %	194444090
12576	NC_011080	GTGA	2	8	664896	664903	25 %	25 %	50 %	0 %	194444090
12577	NC_011080	CAG	2	6	664914	664919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444090
12578	NC_011080	GCCA	2	8	665025	665032	25 %	0 %	25 %	50 %	194444090
12579	NC_011080	GTG	2	6	665052	665057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444090
12580	NC_011080	CGG	2	6	665060	665065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444090
12581	NC_011080	GAT	2	6	665086	665091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442334
12582	NC_011080	TGG	2	6	665145	665150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442334
12583	NC_011080	TCA	2	6	665224	665229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442334
12584	NC_011080	CGG	2	6	665248	665253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442334
12585	NC_011080	TGA	2	6	665301	665306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442334
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12587	NC_011080	TGCC	2	8	665390	665397	0 %	25 %	25 %	50 %	194442334
12588	NC_011080	GGC	2	6	665409	665414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442334
12589	NC_011080	GCT	2	6	665460	665465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442334
12590	NC_011080	CGG	2	6	665484	665489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442334
12591	NC_011080	GTG	2	6	665793	665798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443275
12592	NC_011080	A	6	6	665853	665858	100 %	0 %	0 %	0 %	194443275
12593	NC_011080	ATG	2	6	665905	665910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443275
12594	NC_011080	A	6	6	665934	665939	100 %	0 %	0 %	0 %	194443275
12595	NC_011080	GGC	2	6	666002	666007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
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12597	NC_011080	GCT	2	6	666038	666043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443275
12598	NC_011080	GGCG	2	8	666044	666051	0 %	0 %	75 %	25 %	194443275
12599	NC_011080	GAT	2	6	666218	666223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443275
12600	NC_011080	GTG	2	6	666225	666230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443275
12601	NC_011080	TAT	2	6	666377	666382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443275
12602	NC_011080	CGG	2	6	666386	666391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
12603	NC_011080	GGC	2	6	666398	666403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
12604	NC_011080	TGG	2	6	666460	666465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443275
12605	NC_011080	CGG	2	6	666481	666486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
12606	NC_011080	GCT	3	9	666500	666508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443275
12607	NC_011080	CGC	2	6	666511	666516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443275
12608	NC_011080	CT	3	6	666525	666530	0 %	50 %	0 %	50 %	194443275
12609	NC_011080	TTG	2	6	666619	666624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443275
12610	NC_011080	ACCGG	2	10	666630	666639	20 %	0 %	40 %	40 %	194443275
12611	NC_011080	TTA	2	6	666670	666675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443275
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12614	NC_011080	AGGCC	2	10	666752	666761	20 %	0 %	40 %	40 %	194443275
12615	NC_011080	CGG	2	6	666776	666781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
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12617	NC_011080	TAT	2	6	666830	666835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443275
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12980	NC_011080	CAA	2	6	686742	686747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443541
12981	NC_011080	AT	3	6	686753	686758	50 %	50 %	0 %	0 %	194443541
12982	NC_011080	CAG	2	6	686860	686865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442851
12983	NC_011080	GCC	2	6	686953	686958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442851
12984	NC_011080	CTG	2	6	686959	686964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442851
12985	NC_011080	TAA	2	6	686965	686970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442851
12986	NC_011080	CCG	2	6	686973	686978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442851
12987	NC_011080	CTG	3	9	686980	686988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442851
12988	NC_011080	CCGCC	2	10	687006	687015	0 %	0 %	20 %	80 %	194442851
12989	NC_011080	GCGAC	2	10	687018	687027	20 %	0 %	40 %	40 %	194442851
12990	NC_011080	CAG	3	9	687052	687060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442851
12991	NC_011080	AGC	2	6	687071	687076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442851
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12996	NC_011080	CGG	3	9	687270	687278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442851
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12998	NC_011080	GGC	2	6	687334	687339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442851
12999	NC_011080	TGC	2	6	687363	687368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442851
13000	NC_011080	CGCC	2	8	687384	687391	0 %	0 %	25 %	75 %	194442851

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