MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_011080	CGG	2	6	638896	638901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
12003	NC_011080	CGA	2	6	638950	638955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12004	NC_011080	CGA	2	6	638965	638970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12005	NC_011080	GGT	2	6	639029	639034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442991
12006	NC_011080	CCCG	2	8	639036	639043	0 %	0 %	25 %	75 %	194442991
12007	NC_011080	TGC	2	6	639124	639129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12008	NC_011080	CTG	2	6	639131	639136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12009	NC_011080	CGG	2	6	639157	639162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
12010	NC_011080	TCC	3	9	639279	639287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442991
12011	NC_011080	GCG	2	6	639325	639330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
12012	NC_011080	GC	3	6	639363	639368	0 %	0 %	50 %	50 %	194442991
12013	NC_011080	CGG	2	6	639376	639381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
12014	NC_011080	TGC	2	6	639435	639440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12015	NC_011080	CGT	2	6	639544	639549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12016	NC_011080	TCACT	2	10	639565	639574	20 %	40 %	0 %	40 %	194442991
12017	NC_011080	CCT	2	6	639585	639590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442496
12018	NC_011080	CAC	2	6	639631	639636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442496
12019	NC_011080	GCGATG	2	12	639647	639658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194442496
12020	NC_011080	GCG	2	6	639677	639682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442496
12021	NC_011080	AGCCC	2	10	639690	639699	20 %	0 %	20 %	60 %	194442496
12022	NC_011080	TGC	2	6	639717	639722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442496
12023	NC_011080	CAT	2	6	639727	639732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442496
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12028	NC_011080	GAC	2	6	640105	640110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442496
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12033	NC_011080	CTG	2	6	640467	640472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444410
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12039	NC_011080	CCG	2	6	640613	640618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444410
12040	NC_011080	CGG	2	6	640697	640702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444410
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12049	NC_011080	GTGACG	2	12	640978	640989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194443911
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12051	NC_011080	TGC	2	6	641019	641024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443911
12052	NC_011080	ACC	2	6	641045	641050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443911
12053	NC_011080	CTT	2	6	641052	641057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443911
12054	NC_011080	GCT	2	6	641100	641105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443911
12055	NC_011080	GTG	2	6	641108	641113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443911
12056	NC_011080	TCG	2	6	641156	641161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443911
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12062	NC_011080	TTTC	2	8	641548	641555	0 %	75 %	0 %	25 %	194443894
12063	NC_011080	CAG	2	6	641633	641638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443894
12064	NC_011080	TGG	2	6	641679	641684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443894
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12086	NC_011080	CG	4	8	642630	642637	0 %	0 %	50 %	50 %	194446317
12087	NC_011080	TTG	2	6	642648	642653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446317
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12106	NC_011080	AAACA	2	10	643849	643858	80 %	0 %	0 %	20 %	194443494
12107	NC_011080	GCA	3	9	643943	643951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443494
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12116	NC_011080	TA	3	6	644363	644368	50 %	50 %	0 %	0 %	194442962
12117	NC_011080	CAG	2	6	644409	644414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442962
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12119	NC_011080	ATC	2	6	644554	644559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442962
12120	NC_011080	GTG	2	6	644560	644565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442962
12121	NC_011080	AGAC	2	8	644568	644575	50 %	0 %	25 %	25 %	194442962
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12123	NC_011080	GC	4	8	644658	644665	0 %	0 %	50 %	50 %	194442962
12124	NC_011080	CGG	2	6	644705	644710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442962
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12239	NC_011080	ACG	2	6	650846	650851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446023
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12475	NC_011080	ACCA	2	8	660310	660317	50 %	0 %	0 %	50 %	194446134
12476	NC_011080	AGC	2	6	660323	660328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446134
12477	NC_011080	GATATG	2	12	660660	660671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443319
12478	NC_011080	TTC	2	6	660726	660731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443319
12479	NC_011080	CAG	2	6	660822	660827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12480	NC_011080	CAG	2	6	660837	660842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12481	NC_011080	TGG	2	6	660883	660888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443319
12482	NC_011080	CGT	2	6	660916	660921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12483	NC_011080	AGC	2	6	660967	660972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12484	NC_011080	TGACGG	2	12	661006	661017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194443319
12485	NC_011080	CG	3	6	661065	661070	0 %	0 %	50 %	50 %	194443319
12486	NC_011080	CGCCA	2	10	661082	661091	20 %	0 %	20 %	60 %	194443319
12487	NC_011080	GTG	2	6	661104	661109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443319
12488	NC_011080	GATA	2	8	661121	661128	50 %	25 %	25 %	0 %	194443319
12489	NC_011080	CAC	2	6	661130	661135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443319
12490	NC_011080	AGTT	2	8	661190	661197	25 %	50 %	25 %	0 %	194443319
12491	NC_011080	GGC	2	6	661224	661229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443319
12492	NC_011080	CTG	2	6	661233	661238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12493	NC_011080	TGC	2	6	661255	661260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12494	NC_011080	CTG	2	6	661356	661361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
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12497	NC_011080	CTG	2	6	661551	661556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
12498	NC_011080	TCA	2	6	661586	661591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443319
12499	NC_011080	GGC	2	6	661644	661649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443319
12500	NC_011080	CT	3	6	661803	661808	0 %	50 %	0 %	50 %	194443319

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