MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011080	CAG	2	6	611559	611564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442998
11502	NC_011080	GCCT	2	8	611602	611609	0 %	25 %	25 %	50 %	194442998
11503	NC_011080	GGT	2	6	611628	611633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442998
11504	NC_011080	CCGTG	2	10	611654	611663	0 %	20 %	40 %	40 %	194442998
11505	NC_011080	CGGGG	2	10	611669	611678	0 %	0 %	80 %	20 %	194442998
11506	NC_011080	GTCG	2	8	611705	611712	0 %	25 %	50 %	25 %	194442998
11507	NC_011080	CA	3	6	611717	611722	50 %	0 %	0 %	50 %	194442998
11508	NC_011080	AAT	2	6	611796	611801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442998
11509	NC_011080	CG	3	6	611842	611847	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
11510	NC_011080	GAT	2	6	611862	611867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442998
11511	NC_011080	GACG	2	8	611913	611920	25 %	0 %	50 %	25 %	194442998
11512	NC_011080	A	6	6	611970	611975	100 %	0 %	0 %	0 %	194442998
11513	NC_011080	CAA	2	6	612042	612047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442998
11514	NC_011080	TCCGT	2	10	612192	612201	0 %	40 %	20 %	40 %	194442998
11515	NC_011080	GC	3	6	612228	612233	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
11516	NC_011080	CAACCG	2	12	612272	612283	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194442998
11517	NC_011080	GGC	2	6	612315	612320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11518	NC_011080	CAGCGC	2	12	612392	612403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194442998
11519	NC_011080	CGG	2	6	612485	612490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11520	NC_011080	GGTC	2	8	612494	612501	0 %	25 %	50 %	25 %	194442998
11521	NC_011080	CGCGT	2	10	612660	612669	0 %	20 %	40 %	40 %	194442998
11522	NC_011080	CAG	2	6	612716	612721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442998
11523	NC_011080	GTG	2	6	612723	612728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442998
11524	NC_011080	GC	3	6	612739	612744	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
11525	NC_011080	GCT	2	6	612753	612758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442998
11526	NC_011080	CG	3	6	612947	612952	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
11527	NC_011080	GGA	2	6	612977	612982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442998
11528	NC_011080	TCCG	2	8	613024	613031	0 %	25 %	25 %	50 %	194442998
11529	NC_011080	AAT	2	6	613193	613198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442424
11530	NC_011080	GGT	2	6	613210	613215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442424
11531	NC_011080	CGG	2	6	613263	613268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442424
11532	NC_011080	TACC	2	8	613285	613292	25 %	25 %	0 %	50 %	194442424
11533	NC_011080	GCA	2	6	613456	613461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442424
11534	NC_011080	TTAAA	2	10	613497	613506	60 %	40 %	0 %	0 %	194442424
11535	NC_011080	TTA	2	6	613521	613526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442424
11536	NC_011080	GAC	2	6	613570	613575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442424
11537	NC_011080	TA	3	6	613605	613610	50 %	50 %	0 %	0 %	194442424
11538	NC_011080	CGT	2	6	613701	613706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442424
11539	NC_011080	GGCGGG	2	12	613717	613728	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	194442424
11540	NC_011080	CGC	2	6	613749	613754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
11541	NC_011080	CGC	2	6	613899	613904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
11542	NC_011080	AAT	2	6	613913	613918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442424
11543	NC_011080	TGA	2	6	613945	613950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442424
11544	NC_011080	CGC	3	9	613954	613962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
11545	NC_011080	GC	3	6	614030	614035	0 %	0 %	50 %	50 %	194442424
11546	NC_011080	AGG	2	6	614062	614067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442424
11547	NC_011080	GTG	2	6	614177	614182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446058
11548	NC_011080	CGC	2	6	614260	614265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446058
11549	NC_011080	CCG	2	6	614315	614320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446058
11550	NC_011080	CGGCA	2	10	614359	614368	20 %	0 %	40 %	40 %	194446058
11551	NC_011080	ACA	2	6	614478	614483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446058
11552	NC_011080	CAATTA	2	12	614578	614589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194446058
11553	NC_011080	AAT	2	6	614640	614645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445419
11554	NC_011080	AT	3	6	614704	614709	50 %	50 %	0 %	0 %	194445419
11555	NC_011080	GC	3	6	614719	614724	0 %	0 %	50 %	50 %	194445419
11556	NC_011080	GCA	2	6	614794	614799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445419
11557	NC_011080	G	6	6	614846	614851	0 %	0 %	100 %	0 %	194445419
11558	NC_011080	TGA	2	6	614863	614868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445419
11559	NC_011080	A	6	6	614889	614894	100 %	0 %	0 %	0 %	194445419
11560	NC_011080	TTAC	2	8	614952	614959	25 %	50 %	0 %	25 %	194445419
11561	NC_011080	CGA	2	6	615014	615019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445419
11562	NC_011080	A	7	7	615021	615027	100 %	0 %	0 %	0 %	194445419
11563	NC_011080	TAAG	2	8	615064	615071	50 %	25 %	25 %	0 %	194445419
11564	NC_011080	ATC	2	6	615158	615163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445419
11565	NC_011080	TCGA	2	8	615210	615217	25 %	25 %	25 %	25 %	194445419
11566	NC_011080	TTG	2	6	615268	615273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445419
11567	NC_011080	A	6	6	615874	615879	100 %	0 %	0 %	0 %	194443570
11568	NC_011080	GCT	2	6	615901	615906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
11569	NC_011080	AGC	2	6	615909	615914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443570
11570	NC_011080	GAA	2	6	615916	615921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443570
11571	NC_011080	AGG	2	6	615945	615950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443570
11572	NC_011080	GTT	2	6	615958	615963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443570
11573	NC_011080	GAT	2	6	615982	615987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443570
11574	NC_011080	ATC	2	6	616047	616052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443570
11575	NC_011080	CAGT	2	8	616056	616063	25 %	25 %	25 %	25 %	194443570
11576	NC_011080	CGG	2	6	616093	616098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
11577	NC_011080	GTC	2	6	616135	616140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
11578	NC_011080	A	7	7	616151	616157	100 %	0 %	0 %	0 %	194443570
11579	NC_011080	CAG	2	6	616208	616213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443570
11580	NC_011080	TTG	2	6	616232	616237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443570
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11582	NC_011080	TGC	2	6	616364	616369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
11583	NC_011080	AGT	2	6	616390	616395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443570
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11585	NC_011080	GCG	2	6	616510	616515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
11586	NC_011080	CGG	2	6	616560	616565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
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11588	NC_011080	TGGC	2	8	616633	616640	0 %	25 %	50 %	25 %	448967505
11589	NC_011080	ATAA	2	8	616642	616649	75 %	25 %	0 %	0 %	448967505
11590	NC_011080	CTG	2	6	616727	616732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967505
11591	NC_011080	A	8	8	616733	616740	100 %	0 %	0 %	0 %	448967505
11592	NC_011080	GA	3	6	616803	616808	50 %	0 %	50 %	0 %	448967505
11593	NC_011080	ATGA	2	8	616849	616856	50 %	25 %	25 %	0 %	448967505
11594	NC_011080	TCCTT	2	10	616891	616900	0 %	60 %	0 %	40 %	448967505
11595	NC_011080	CCA	2	6	616918	616923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967505
11596	NC_011080	TACT	2	8	617087	617094	25 %	50 %	0 %	25 %	194442310
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11598	NC_011080	CTG	2	6	617134	617139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442310
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11601	NC_011080	AGT	2	6	617298	617303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442310
11602	NC_011080	CAT	2	6	617382	617387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442310
11603	NC_011080	GCA	2	6	617406	617411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442310
11604	NC_011080	TTA	2	6	617453	617458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442310
11605	NC_011080	AAT	2	6	617461	617466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442310
11606	NC_011080	ATC	3	9	617524	617532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442310
11607	NC_011080	TATC	2	8	617559	617566	25 %	50 %	0 %	25 %	194442310
11608	NC_011080	TCT	2	6	617567	617572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442310
11609	NC_011080	GGC	2	6	617573	617578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442310
11610	NC_011080	CTG	2	6	617593	617598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442310
11611	NC_011080	ATG	2	6	617621	617626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442310
11612	NC_011080	TAT	2	6	619042	619047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443811
11613	NC_011080	ACAT	2	8	619077	619084	50 %	25 %	0 %	25 %	194443811
11614	NC_011080	TATT	2	8	619165	619172	25 %	75 %	0 %	0 %	194443811
11615	NC_011080	T	8	8	619187	619194	0 %	100 %	0 %	0 %	194443811
11616	NC_011080	TA	3	6	619200	619205	50 %	50 %	0 %	0 %	194443811
11617	NC_011080	A	6	6	619208	619213	100 %	0 %	0 %	0 %	194443811
11618	NC_011080	ACC	2	6	619259	619264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443811
11619	NC_011080	ATT	2	6	619329	619334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443811
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11621	NC_011080	CTTC	2	8	619372	619379	0 %	50 %	0 %	50 %	194443811
11622	NC_011080	CAT	2	6	619388	619393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443811
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11743	NC_011080	TCCGCC	2	12	626271	626282	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	194442914
11744	NC_011080	AT	3	6	626303	626308	50 %	50 %	0 %	0 %	194442914
11745	NC_011080	CGT	3	9	626383	626391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442914
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11859	NC_011080	GCT	2	6	632247	632252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443366
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11981	NC_011080	CAG	2	6	638232	638237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
11982	NC_011080	CGC	2	6	638294	638299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
11983	NC_011080	CCG	2	6	638321	638326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
11984	NC_011080	GCCA	2	8	638352	638359	25 %	0 %	25 %	50 %	194446377
11985	NC_011080	GC	3	6	638389	638394	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
11986	NC_011080	CGC	2	6	638400	638405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
11987	NC_011080	GCC	3	9	638421	638429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
11988	NC_011080	TCG	2	6	638476	638481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446377
11989	NC_011080	CAG	2	6	638497	638502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
11990	NC_011080	CG	3	6	638538	638543	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
11991	NC_011080	GC	3	6	638552	638557	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
11992	NC_011080	AAT	2	6	638586	638591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446377
11993	NC_011080	CGC	2	6	638600	638605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
11994	NC_011080	CG	3	6	638625	638630	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
11995	NC_011080	CAG	2	6	638664	638669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
11996	NC_011080	TCT	2	6	638695	638700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446377
11997	NC_011080	GC	3	6	638737	638742	0 %	0 %	50 %	50 %	194442991
11998	NC_011080	AAG	2	6	638747	638752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442991
11999	NC_011080	AGC	2	6	638832	638837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991
12000	NC_011080	GCA	2	6	638839	638844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991

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