MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_011080	ATTT	2	8	586590	586597	25 %	75 %	0 %	0 %	194443146
11003	NC_011080	GTC	2	6	586675	586680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443146
11004	NC_011080	TA	3	6	586685	586690	50 %	50 %	0 %	0 %	194443146
11005	NC_011080	GCAAC	2	10	586699	586708	40 %	0 %	20 %	40 %	194443146
11006	NC_011080	AG	3	6	586833	586838	50 %	0 %	50 %	0 %	194444865
11007	NC_011080	CAG	2	6	586845	586850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444865
11008	NC_011080	TTA	2	6	586869	586874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11009	NC_011080	ATGG	2	8	586925	586932	25 %	25 %	50 %	0 %	194444865
11010	NC_011080	CGG	2	6	586967	586972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444865
11011	NC_011080	T	7	7	586973	586979	0 %	100 %	0 %	0 %	194444865
11012	NC_011080	ATT	2	6	587016	587021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11013	NC_011080	ATT	2	6	587030	587035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11014	NC_011080	GCG	3	9	587040	587048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444865
11015	NC_011080	AATG	2	8	587054	587061	50 %	25 %	25 %	0 %	194444865
11016	NC_011080	GGCA	2	8	587066	587073	25 %	0 %	50 %	25 %	194444865
11017	NC_011080	GC	3	6	587128	587133	0 %	0 %	50 %	50 %	194444865
11018	NC_011080	ATT	2	6	587144	587149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11019	NC_011080	GCT	2	6	587270	587275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444865
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11021	NC_011080	ATT	2	6	587319	587324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11022	NC_011080	GGT	2	6	587346	587351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444865
11023	NC_011080	TAAA	2	8	587359	587366	75 %	25 %	0 %	0 %	194444865
11024	NC_011080	GGC	2	6	587406	587411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444865
11025	NC_011080	TGG	2	6	587509	587514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444865
11026	NC_011080	CATT	2	8	587583	587590	25 %	50 %	0 %	25 %	194444865
11027	NC_011080	TA	3	6	587634	587639	50 %	50 %	0 %	0 %	194444865
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11029	NC_011080	TATGG	2	10	587688	587697	20 %	40 %	40 %	0 %	194444865
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11032	NC_011080	GCG	2	6	587832	587837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444865
11033	NC_011080	TAT	2	6	587885	587890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444865
11034	NC_011080	CGG	2	6	587960	587965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444865
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11036	NC_011080	TGA	2	6	588035	588040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444865
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11041	NC_011080	A	6	6	588258	588263	100 %	0 %	0 %	0 %	194444865
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11045	NC_011080	GCG	3	9	588588	588596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446659
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11050	NC_011080	GAA	2	6	588945	588950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446659
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11053	NC_011080	CG	5	10	589111	589120	0 %	0 %	50 %	50 %	194446659
11054	NC_011080	TCC	2	6	589310	589315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446659
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11056	NC_011080	CGC	2	6	589454	589459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446659
11057	NC_011080	CAG	2	6	589535	589540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446659
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11059	NC_011080	GC	3	6	589609	589614	0 %	0 %	50 %	50 %	194446659
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11061	NC_011080	TTAT	2	8	589645	589652	25 %	75 %	0 %	0 %	194446659
11062	NC_011080	GCC	2	6	589676	589681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446659
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11067	NC_011080	ACC	2	6	589927	589932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443872
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11087	NC_011080	CTG	2	6	590752	590757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443872
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11089	NC_011080	CTTTA	2	10	590843	590852	20 %	60 %	0 %	20 %	194443872
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11091	NC_011080	CG	3	6	590889	590894	0 %	0 %	50 %	50 %	194443872
11092	NC_011080	T	7	7	590933	590939	0 %	100 %	0 %	0 %	194443872
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11098	NC_011080	GC	3	6	591194	591199	0 %	0 %	50 %	50 %	194445092
11099	NC_011080	TGG	2	6	591223	591228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445092
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11110	NC_011080	CGCGG	2	10	591698	591707	0 %	0 %	60 %	40 %	194445092
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11116	NC_011080	GCGTC	2	10	592014	592023	0 %	20 %	40 %	40 %	194445092
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11119	NC_011080	T	6	6	592437	592442	0 %	100 %	0 %	0 %	194445251
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11121	NC_011080	TGGC	2	8	592534	592541	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
11122	NC_011080	CAG	2	6	592605	592610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445251
11123	NC_011080	GCTG	2	8	592649	592656	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
11124	NC_011080	ACCA	2	8	592669	592676	50 %	0 %	0 %	50 %	194445251
11125	NC_011080	GCG	2	6	592704	592709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445251
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11127	NC_011080	GCTG	2	8	592724	592731	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
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11130	NC_011080	CTG	2	6	592887	592892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445251
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11141	NC_011080	TCCA	2	8	593384	593391	25 %	25 %	0 %	50 %	194443732
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11231	NC_011080	TTCCC	2	10	597177	597186	0 %	40 %	0 %	60 %	194442658
11232	NC_011080	CT	4	8	597224	597231	0 %	50 %	0 %	50 %	194442658
11233	NC_011080	CATC	2	8	597238	597245	25 %	25 %	0 %	50 %	194442658
11234	NC_011080	C	6	6	597248	597253	0 %	0 %	0 %	100 %	194442658
11235	NC_011080	GCGGTG	2	12	597265	597276	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194442658
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11238	NC_011080	A	6	6	597370	597375	100 %	0 %	0 %	0 %	194442658
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11240	NC_011080	CTGG	2	8	597480	597487	0 %	25 %	50 %	25 %	194445773
11241	NC_011080	CTT	2	6	597500	597505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445773
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11243	NC_011080	CTT	2	6	597538	597543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445773
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11360	NC_011080	ACCG	2	8	603953	603960	25 %	0 %	25 %	50 %	194442819
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11364	NC_011080	CGAGC	2	10	604085	604094	20 %	0 %	40 %	40 %	194442819
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11479	NC_011080	GGC	2	6	610505	610510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11480	NC_011080	CGG	2	6	610564	610569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11481	NC_011080	ATC	2	6	610612	610617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442998
11482	NC_011080	ACG	2	6	610654	610659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442998
11483	NC_011080	GGCG	2	8	610691	610698	0 %	0 %	75 %	25 %	194442998
11484	NC_011080	CGG	2	6	610721	610726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11485	NC_011080	GC	3	6	610918	610923	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
11486	NC_011080	CCG	2	6	610935	610940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442998
11487	NC_011080	CGC	2	6	610964	610969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442998
11488	NC_011080	ATTA	2	8	610974	610981	50 %	50 %	0 %	0 %	194442998
11489	NC_011080	ACAG	2	8	611004	611011	50 %	0 %	25 %	25 %	194442998
11490	NC_011080	T	6	6	611021	611026	0 %	100 %	0 %	0 %	194442998
11491	NC_011080	CTG	2	6	611031	611036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442998
11492	NC_011080	GGC	2	6	611059	611064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11493	NC_011080	TAA	2	6	611069	611074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442998
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11496	NC_011080	CAT	2	6	611153	611158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442998
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11498	NC_011080	GCG	2	6	611416	611421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442998
11499	NC_011080	CAA	2	6	611457	611462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442998
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