MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011080	GCG	3	9	559244	559252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446357
10502	NC_011080	GGT	2	6	559356	559361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446357
10503	NC_011080	CCG	2	6	559373	559378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446357
10504	NC_011080	GCG	2	6	559535	559540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446357
10505	NC_011080	CAG	2	6	559621	559626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446357
10506	NC_011080	GCG	3	9	559642	559650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446357
10507	NC_011080	GCTG	2	8	559673	559680	0 %	25 %	50 %	25 %	194446357
10508	NC_011080	CG	3	6	559810	559815	0 %	0 %	50 %	50 %	194444718
10509	NC_011080	GGC	2	6	559842	559847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444718
10510	NC_011080	GCC	2	6	559858	559863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444718
10511	NC_011080	ACC	2	6	559887	559892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444718
10512	NC_011080	TCT	2	6	559952	559957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444718
10513	NC_011080	CCG	2	6	559975	559980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444718
10514	NC_011080	GTG	2	6	559993	559998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444718
10515	NC_011080	CCA	2	6	560006	560011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444718
10516	NC_011080	T	6	6	560058	560063	0 %	100 %	0 %	0 %	194444718
10517	NC_011080	CAC	2	6	560178	560183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444718
10518	NC_011080	AGTT	2	8	560195	560202	25 %	50 %	25 %	0 %	194444718
10519	NC_011080	GATCGT	2	12	560210	560221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194444718
10520	NC_011080	T	7	7	560248	560254	0 %	100 %	0 %	0 %	194444718
10521	NC_011080	TAACT	2	10	560259	560268	40 %	40 %	0 %	20 %	194444718
10522	NC_011080	T	7	7	560476	560482	0 %	100 %	0 %	0 %	194446252
10523	NC_011080	CGG	2	6	560553	560558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446252
10524	NC_011080	CAG	2	6	560565	560570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446252
10525	NC_011080	CAT	2	6	560609	560614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446252
10526	NC_011080	GGCT	2	8	560620	560627	0 %	25 %	50 %	25 %	194446252
10527	NC_011080	CGG	2	6	560661	560666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446252
10528	NC_011080	CCA	2	6	560676	560681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446252
10529	NC_011080	ATC	2	6	560686	560691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446252
10530	NC_011080	GTC	2	6	560733	560738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446252
10531	NC_011080	AGC	2	6	560740	560745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446252
10532	NC_011080	AGT	2	6	560773	560778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446252
10533	NC_011080	CGG	2	6	561021	561026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446252
10534	NC_011080	CG	3	6	561140	561145	0 %	0 %	50 %	50 %	194446252
10535	NC_011080	CAGATG	2	12	561168	561179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194446252
10536	NC_011080	ACC	2	6	561183	561188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446252
10537	NC_011080	GA	3	6	561196	561201	50 %	0 %	50 %	0 %	194446252
10538	NC_011080	GC	4	8	561236	561243	0 %	0 %	50 %	50 %	194446252
10539	NC_011080	CTG	2	6	561481	561486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444338
10540	NC_011080	T	6	6	561490	561495	0 %	100 %	0 %	0 %	194444338
10541	NC_011080	TGC	2	6	561598	561603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444338
10542	NC_011080	T	8	8	561623	561630	0 %	100 %	0 %	0 %	194444338
10543	NC_011080	ACA	2	6	561716	561721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444338
10544	NC_011080	TGT	3	9	561729	561737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444338
10545	NC_011080	TTA	2	6	561786	561791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444338
10546	NC_011080	ATAGA	2	10	561814	561823	60 %	20 %	20 %	0 %	194444338
10547	NC_011080	AAT	2	6	561851	561856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444338
10548	NC_011080	GTT	2	6	561966	561971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444338
10549	NC_011080	GAA	2	6	561997	562002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444338
10550	NC_011080	GCC	2	6	562073	562078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444338
10551	NC_011080	CGG	2	6	562143	562148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444338
10552	NC_011080	AAG	2	6	562162	562167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444338
10553	NC_011080	ATAA	2	8	562187	562194	75 %	25 %	0 %	0 %	194444338
10554	NC_011080	GAC	2	6	562384	562389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10555	NC_011080	CTA	2	6	562422	562427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10556	NC_011080	CGG	2	6	562467	562472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445285
10557	NC_011080	TGT	2	6	562491	562496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445285
10558	NC_011080	CG	4	8	562540	562547	0 %	0 %	50 %	50 %	194445285
10559	NC_011080	CGC	2	6	562600	562605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445285
10560	NC_011080	GCC	3	9	562627	562635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445285
10561	NC_011080	GAC	2	6	562707	562712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10562	NC_011080	TCA	2	6	562775	562780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10563	NC_011080	CTT	2	6	562788	562793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445285
10564	NC_011080	CGT	2	6	562810	562815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10565	NC_011080	CGC	3	9	562918	562926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445285
10566	NC_011080	CAG	2	6	562942	562947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10567	NC_011080	CCG	2	6	562986	562991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445285
10568	NC_011080	GTTC	2	8	563016	563023	0 %	50 %	25 %	25 %	194445285
10569	NC_011080	TGA	2	6	563051	563056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445285
10570	NC_011080	ATC	2	6	563122	563127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10571	NC_011080	CCA	2	6	563238	563243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445285
10572	NC_011080	AAT	2	6	563371	563376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445285
10573	NC_011080	GGT	2	6	563428	563433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445285
10574	NC_011080	GCG	2	6	563460	563465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445285
10575	NC_011080	GAA	2	6	563473	563478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445285
10576	NC_011080	GCG	2	6	563489	563494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445285
10577	NC_011080	ACG	3	9	563513	563521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10578	NC_011080	AAT	2	6	563599	563604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445285
10579	NC_011080	GAC	2	6	563665	563670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10580	NC_011080	TCGCCT	2	12	563690	563701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194445285
10581	NC_011080	TGC	2	6	563705	563710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10582	NC_011080	TCA	2	6	563738	563743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10583	NC_011080	GCA	3	9	563805	563813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10584	NC_011080	T	6	6	563844	563849	0 %	100 %	0 %	0 %	194445285
10585	NC_011080	TCT	2	6	563855	563860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445285
10586	NC_011080	ACG	2	6	563864	563869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10587	NC_011080	GC	4	8	563930	563937	0 %	0 %	50 %	50 %	194445285
10588	NC_011080	ATC	2	6	563972	563977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10589	NC_011080	CCA	2	6	564078	564083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445285
10590	NC_011080	TCG	2	6	564093	564098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10591	NC_011080	CAG	2	6	564109	564114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10592	NC_011080	CCGC	2	8	564143	564150	0 %	0 %	25 %	75 %	194445285
10593	NC_011080	AGCC	2	8	564184	564191	25 %	0 %	25 %	50 %	194445285
10594	NC_011080	CAT	2	6	564217	564222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10595	NC_011080	ATC	2	6	564233	564238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
10596	NC_011080	ACCG	2	8	564259	564266	25 %	0 %	25 %	50 %	194445285
10597	NC_011080	CGA	2	6	564273	564278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10598	NC_011080	TGG	2	6	564303	564308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445285
10599	NC_011080	CTG	2	6	564322	564327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445285
10600	NC_011080	GCG	2	6	564404	564409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445285
10601	NC_011080	TGT	2	6	564491	564496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445285
10602	NC_011080	TTC	2	6	564550	564555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445285
10603	NC_011080	TGA	2	6	564613	564618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445285
10604	NC_011080	GTT	2	6	564762	564767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445285
10605	NC_011080	CTTT	2	8	564773	564780	0 %	75 %	0 %	25 %	194445285
10606	NC_011080	A	7	7	564974	564980	100 %	0 %	0 %	0 %	194443306
10607	NC_011080	CGC	2	6	565032	565037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443306
10608	NC_011080	TGC	2	6	565098	565103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306
10609	NC_011080	CAAT	2	8	565247	565254	50 %	25 %	0 %	25 %	194443306
10610	NC_011080	CTG	2	6	565265	565270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306
10611	NC_011080	ATT	2	6	565316	565321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443306
10612	NC_011080	GCT	2	6	565335	565340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306
10613	NC_011080	TCA	2	6	565342	565347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443306
10614	NC_011080	GC	3	6	565431	565436	0 %	0 %	50 %	50 %	194442548
10615	NC_011080	TAAC	2	8	565498	565505	50 %	25 %	0 %	25 %	194442548
10616	NC_011080	CGG	2	6	565524	565529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442548
10617	NC_011080	GTT	2	6	565537	565542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442548
10618	NC_011080	GGC	2	6	565558	565563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442548
10619	NC_011080	GTCG	2	8	565565	565572	0 %	25 %	50 %	25 %	194442548
10620	NC_011080	ACGCG	2	10	565587	565596	20 %	0 %	40 %	40 %	194442548
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10979	NC_011080	TCA	2	6	585235	585240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443819
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