MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011080	T	6	6	535264	535269	0 %	100 %	0 %	0 %	194446686
10002	NC_011080	TCG	2	6	535308	535313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10003	NC_011080	GCC	2	6	535411	535416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446686
10004	NC_011080	AAG	2	6	535418	535423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446686
10005	NC_011080	AATA	2	8	535432	535439	75 %	25 %	0 %	0 %	194446686
10006	NC_011080	CCG	2	6	535440	535445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446686
10007	NC_011080	CCA	2	6	535464	535469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446686
10008	NC_011080	CTTC	2	8	535506	535513	0 %	50 %	0 %	50 %	194446686
10009	NC_011080	CTT	2	6	535524	535529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446686
10010	NC_011080	ACC	2	6	535556	535561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446686
10011	NC_011080	CCA	2	6	535575	535580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446686
10012	NC_011080	CAA	2	6	535663	535668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446686
10013	NC_011080	CAC	2	6	535669	535674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446686
10014	NC_011080	CG	3	6	535702	535707	0 %	0 %	50 %	50 %	194446686
10015	NC_011080	GTG	2	6	535805	535810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446686
10016	NC_011080	GAA	2	6	535843	535848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446686
10017	NC_011080	T	7	7	535857	535863	0 %	100 %	0 %	0 %	194446686
10018	NC_011080	TAGCGG	2	12	535878	535889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446686
10019	NC_011080	GCTG	2	8	535937	535944	0 %	25 %	50 %	25 %	194446686
10020	NC_011080	CGT	2	6	535965	535970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10021	NC_011080	CGC	2	6	535977	535982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446686
10022	NC_011080	CAG	2	6	536041	536046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10023	NC_011080	AAT	2	6	536089	536094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446686
10024	NC_011080	GCT	2	6	536106	536111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10025	NC_011080	CGG	2	6	536122	536127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446686
10026	NC_011080	ACC	2	6	536131	536136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446686
10027	NC_011080	CGCAT	2	10	536240	536249	20 %	20 %	20 %	40 %	194446686
10028	NC_011080	GGC	2	6	536314	536319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446686
10029	NC_011080	TCC	2	6	536336	536341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446686
10030	NC_011080	CTGAAC	2	12	536470	536481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194446686
10031	NC_011080	GGA	2	6	536554	536559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446686
10032	NC_011080	CTG	2	6	536667	536672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10033	NC_011080	TCG	2	6	536682	536687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10034	NC_011080	C	6	6	536722	536727	0 %	0 %	0 %	100 %	194446686
10035	NC_011080	ATG	4	12	536735	536746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446686
10036	NC_011080	CGAT	2	8	536771	536778	25 %	25 %	25 %	25 %	194446686
10037	NC_011080	TTAAG	2	10	536811	536820	40 %	40 %	20 %	0 %	194444901
10038	NC_011080	TGTT	2	8	536859	536866	0 %	75 %	25 %	0 %	194444901
10039	NC_011080	GAC	2	6	536927	536932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10040	NC_011080	GTCA	2	8	536957	536964	25 %	25 %	25 %	25 %	194444901
10041	NC_011080	CGA	2	6	536995	537000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10042	NC_011080	ACC	2	6	537033	537038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444901
10043	NC_011080	CGC	2	6	537052	537057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444901
10044	NC_011080	TGT	2	6	537078	537083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444901
10045	NC_011080	CGAA	2	8	537129	537136	50 %	0 %	25 %	25 %	194444901
10046	NC_011080	GC	3	6	537177	537182	0 %	0 %	50 %	50 %	194444901
10047	NC_011080	GGT	2	6	537197	537202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444901
10048	NC_011080	GCT	2	6	537385	537390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10049	NC_011080	GC	3	6	537430	537435	0 %	0 %	50 %	50 %	194444901
10050	NC_011080	GAC	2	6	537447	537452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10051	NC_011080	CGG	2	6	537520	537525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444901
10052	NC_011080	TGC	2	6	537530	537535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10053	NC_011080	CGG	2	6	537541	537546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444901
10054	NC_011080	TTG	2	6	537554	537559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444901
10055	NC_011080	CAGC	2	8	537565	537572	25 %	0 %	25 %	50 %	194444901
10056	NC_011080	CAG	2	6	537611	537616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10057	NC_011080	CGG	2	6	537655	537660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444901
10058	NC_011080	AG	4	8	537730	537737	50 %	0 %	50 %	0 %	194444901
10059	NC_011080	CTG	2	6	537902	537907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444901
10060	NC_011080	GCC	2	6	537908	537913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444901
10061	NC_011080	GTC	2	6	537929	537934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444901
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10063	NC_011080	ACA	2	6	538189	538194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443145
10064	NC_011080	GCA	2	6	538225	538230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10065	NC_011080	GCT	2	6	538268	538273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10066	NC_011080	CG	3	6	538281	538286	0 %	0 %	50 %	50 %	194443145
10067	NC_011080	CGA	2	6	538396	538401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443145
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10069	NC_011080	ACG	2	6	538462	538467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10070	NC_011080	TGC	2	6	538608	538613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10071	NC_011080	CTG	2	6	538622	538627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10072	NC_011080	TCG	2	6	538630	538635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443145
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10075	NC_011080	CTG	2	6	538742	538747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443145
10076	NC_011080	GC	3	6	538774	538779	0 %	0 %	50 %	50 %	194443145
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10079	NC_011080	TTA	2	6	538984	538989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446103
10080	NC_011080	CTGTC	2	10	538995	539004	0 %	40 %	20 %	40 %	194446103
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10082	NC_011080	CAG	2	6	539124	539129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
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10087	NC_011080	TTA	2	6	539529	539534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446103
10088	NC_011080	GCT	2	6	539549	539554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
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10091	NC_011080	AGG	2	6	539731	539736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446103
10092	NC_011080	CAGC	2	8	539813	539820	25 %	0 %	25 %	50 %	194446103
10093	NC_011080	GCA	2	6	539858	539863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
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10095	NC_011080	CG	3	6	539892	539897	0 %	0 %	50 %	50 %	194446103
10096	NC_011080	GAAA	2	8	539907	539914	75 %	0 %	25 %	0 %	194446103
10097	NC_011080	CAG	2	6	539976	539981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
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10099	NC_011080	CAG	2	6	540063	540068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10100	NC_011080	GGA	2	6	540110	540115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446103
10101	NC_011080	ATG	2	6	540136	540141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446103
10102	NC_011080	ATG	2	6	540148	540153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446103
10103	NC_011080	GGT	2	6	540164	540169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446103
10104	NC_011080	TAAA	2	8	540199	540206	75 %	25 %	0 %	0 %	194446103
10105	NC_011080	TGA	2	6	540223	540228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446103
10106	NC_011080	CAG	3	9	540252	540260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10107	NC_011080	TGA	2	6	540262	540267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446103
10108	NC_011080	GCA	2	6	540299	540304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10109	NC_011080	T	6	6	540307	540312	0 %	100 %	0 %	0 %	194446103
10110	NC_011080	GGACTG	2	12	540335	540346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446103
10111	NC_011080	TATT	2	8	540430	540437	25 %	75 %	0 %	0 %	194446103
10112	NC_011080	T	6	6	540440	540445	0 %	100 %	0 %	0 %	194446103
10113	NC_011080	GCC	3	9	540525	540533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446103
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10115	NC_011080	CG	3	6	540597	540602	0 %	0 %	50 %	50 %	194446103
10116	NC_011080	CTG	2	6	540642	540647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10117	NC_011080	CTGG	2	8	540707	540714	0 %	25 %	50 %	25 %	194446103
10118	NC_011080	TGC	2	6	540832	540837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10119	NC_011080	TGG	2	6	540856	540861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446103
10120	NC_011080	CGC	2	6	540871	540876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446103
10121	NC_011080	GATG	2	8	540884	540891	25 %	25 %	50 %	0 %	194446103
10122	NC_011080	CTG	2	6	540924	540929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10123	NC_011080	ATT	2	6	541023	541028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446103
10124	NC_011080	ACC	2	6	541071	541076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446103
10125	NC_011080	TGC	2	6	541147	541152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10126	NC_011080	GCG	2	6	541167	541172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446103
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10128	NC_011080	TCG	2	6	541202	541207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
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10131	NC_011080	TGC	2	6	541306	541311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10132	NC_011080	GGT	2	6	541430	541435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446103
10133	NC_011080	ATT	2	6	541470	541475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446103
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10143	NC_011080	ACC	2	6	542049	542054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446103
10144	NC_011080	CGTG	2	8	542093	542100	0 %	25 %	50 %	25 %	194446103
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10147	NC_011080	ATCG	2	8	542145	542152	25 %	25 %	25 %	25 %	194446103
10148	NC_011080	CGA	2	6	542222	542227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446103
10149	NC_011080	TGAAG	2	10	542234	542243	40 %	20 %	40 %	0 %	194446103
10150	NC_011080	CGG	2	6	542255	542260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446103
10151	NC_011080	GC	4	8	542424	542431	0 %	0 %	50 %	50 %	194442277
10152	NC_011080	TTC	2	6	542510	542515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442277
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10156	NC_011080	GCG	2	6	542598	542603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442277
10157	NC_011080	CGTC	2	8	542647	542654	0 %	25 %	25 %	50 %	194442277
10158	NC_011080	CCG	2	6	542750	542755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442277
10159	NC_011080	TGC	2	6	542757	542762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442277
10160	NC_011080	GTC	2	6	542784	542789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442277
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10197	NC_011080	TGGGC	2	10	544866	544875	0 %	20 %	60 %	20 %	194443575
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10209	NC_011080	CTG	2	6	545472	545477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
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10223	NC_011080	GC	3	6	546120	546125	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
10224	NC_011080	GCT	2	6	546143	546148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
10225	NC_011080	CTG	2	6	546165	546170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
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10229	NC_011080	CGG	2	6	546336	546341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
10230	NC_011080	TGCG	2	8	546364	546371	0 %	25 %	50 %	25 %	194442832
10231	NC_011080	CGC	2	6	546412	546417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
10232	NC_011080	CGG	2	6	546445	546450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
10233	NC_011080	CGC	3	9	546457	546465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
10234	NC_011080	GCA	2	6	546470	546475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442832
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10238	NC_011080	GC	4	8	546560	546567	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
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10358	NC_011080	GCA	2	6	552428	552433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446022
10359	NC_011080	TCA	2	6	552442	552447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446022
10360	NC_011080	GGC	2	6	552484	552489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446022
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