MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011080	GAA	2	6	509434	509439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445635
9502	NC_011080	TCG	2	6	509603	509608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445635
9503	NC_011080	GCG	2	6	509611	509616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445635
9504	NC_011080	CTG	2	6	509617	509622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445635
9505	NC_011080	GTG	2	6	509665	509670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445635
9506	NC_011080	CGA	2	6	509673	509678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445635
9507	NC_011080	AAT	2	6	509747	509752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445635
9508	NC_011080	TGG	2	6	509992	509997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446124
9509	NC_011080	A	7	7	510078	510084	100 %	0 %	0 %	0 %	194446124
9510	NC_011080	GAAG	2	8	510101	510108	50 %	0 %	50 %	0 %	194446124
9511	NC_011080	GC	4	8	510224	510231	0 %	0 %	50 %	50 %	194446124
9512	NC_011080	GCCA	2	8	510293	510300	25 %	0 %	25 %	50 %	194446124
9513	NC_011080	TGA	2	6	510302	510307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446124
9514	NC_011080	AAG	2	6	510316	510321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446124
9515	NC_011080	A	7	7	510372	510378	100 %	0 %	0 %	0 %	194446124
9516	NC_011080	CCG	2	6	510381	510386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446124
9517	NC_011080	GAC	2	6	510414	510419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9518	NC_011080	CGC	2	6	510443	510448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446124
9519	NC_011080	AACG	2	8	510504	510511	50 %	0 %	25 %	25 %	194446124
9520	NC_011080	GAT	2	6	510530	510535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446124
9521	NC_011080	CTG	2	6	510552	510557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9522	NC_011080	GAC	2	6	510669	510674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9523	NC_011080	AGCGGA	2	12	510746	510757	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	194446124
9524	NC_011080	ATG	2	6	510774	510779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446124
9525	NC_011080	CGG	2	6	510790	510795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9526	NC_011080	GTG	2	6	510804	510809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446124
9527	NC_011080	A	6	6	510864	510869	100 %	0 %	0 %	0 %	194446124
9528	NC_011080	TAAA	2	8	510967	510974	75 %	25 %	0 %	0 %	194446124
9529	NC_011080	TGG	2	6	510997	511002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446124
9530	NC_011080	GCC	2	6	511004	511009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446124
9531	NC_011080	GGTA	2	8	511013	511020	25 %	25 %	50 %	0 %	194446124
9532	NC_011080	GCG	2	6	511084	511089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9533	NC_011080	TGA	2	6	511094	511099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446124
9534	NC_011080	A	6	6	511159	511164	100 %	0 %	0 %	0 %	194446124
9535	NC_011080	TCT	2	6	511221	511226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446124
9536	NC_011080	GCG	2	6	511234	511239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9537	NC_011080	CTG	2	6	511254	511259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9538	NC_011080	GATGT	2	10	511329	511338	20 %	40 %	40 %	0 %	194446124
9539	NC_011080	TCG	2	6	511339	511344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9540	NC_011080	GCT	2	6	511376	511381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9541	NC_011080	CTG	2	6	511452	511457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9542	NC_011080	GAA	2	6	511484	511489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446124
9543	NC_011080	CGA	2	6	511505	511510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446124
9544	NC_011080	TAT	2	6	511526	511531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446124
9545	NC_011080	AAC	2	6	511606	511611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446124
9546	NC_011080	CG	3	6	511698	511703	0 %	0 %	50 %	50 %	194446124
9547	NC_011080	GCG	2	6	511756	511761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9548	NC_011080	GCTC	2	8	511819	511826	0 %	25 %	25 %	50 %	194446124
9549	NC_011080	GGC	2	6	511853	511858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
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9551	NC_011080	GC	4	8	511875	511882	0 %	0 %	50 %	50 %	194446124
9552	NC_011080	CCTG	2	8	512005	512012	0 %	25 %	25 %	50 %	194446124
9553	NC_011080	GC	3	6	512027	512032	0 %	0 %	50 %	50 %	194446124
9554	NC_011080	CGG	2	6	512084	512089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9555	NC_011080	GAAA	2	8	512093	512100	75 %	0 %	25 %	0 %	194446124
9556	NC_011080	GGC	2	6	512108	512113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9557	NC_011080	CGG	2	6	512120	512125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446124
9558	NC_011080	GGA	2	6	512168	512173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446124
9559	NC_011080	A	6	6	512522	512527	100 %	0 %	0 %	0 %	194446645
9560	NC_011080	TGC	2	6	512529	512534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446645
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9564	NC_011080	CGC	2	6	512712	512717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446645
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9574	NC_011080	CGA	2	6	513602	513607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9581	NC_011080	CGA	2	6	513784	513789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9588	NC_011080	GTC	2	6	514091	514096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9591	NC_011080	CGA	2	6	514166	514171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
9592	NC_011080	GCA	2	6	514223	514228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
9593	NC_011080	GCAA	2	8	514245	514252	50 %	0 %	25 %	25 %	194442454
9594	NC_011080	TGT	2	6	514454	514459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442454
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9599	NC_011080	CGA	2	6	514711	514716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9601	NC_011080	CGT	2	6	514760	514765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9603	NC_011080	A	6	6	514815	514820	100 %	0 %	0 %	0 %	194442454
9604	NC_011080	TGA	2	6	514873	514878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442454
9605	NC_011080	AAAATC	2	12	514899	514910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194442454
9606	NC_011080	CAG	2	6	514926	514931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442454
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9608	NC_011080	CTTT	2	8	515117	515124	0 %	75 %	0 %	25 %	194446699
9609	NC_011080	GC	3	6	515148	515153	0 %	0 %	50 %	50 %	194446699
9610	NC_011080	GGC	2	6	515155	515160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446699
9611	NC_011080	A	6	6	515173	515178	100 %	0 %	0 %	0 %	194446699
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9617	NC_011080	A	6	6	515330	515335	100 %	0 %	0 %	0 %	194446699
9618	NC_011080	GAG	2	6	515360	515365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446699
9619	NC_011080	GAT	2	6	515387	515392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446699
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9621	NC_011080	TGG	2	6	515424	515429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446699
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9986	NC_011080	GCC	2	6	534526	534531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446686
9987	NC_011080	TGC	2	6	534535	534540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686
9988	NC_011080	GCG	2	6	534618	534623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446686
9989	NC_011080	CAG	2	6	534655	534660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446686
9990	NC_011080	AAC	2	6	534686	534691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446686
9991	NC_011080	TCAA	2	8	534737	534744	50 %	25 %	0 %	25 %	194446686
9992	NC_011080	CAA	2	6	534777	534782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446686
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9994	NC_011080	TGCG	2	8	535031	535038	0 %	25 %	50 %	25 %	194446686
9995	NC_011080	CGG	2	6	535053	535058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446686
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9998	NC_011080	CGA	3	9	535143	535151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446686
9999	NC_011080	AGC	2	6	535163	535168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446686
10000	NC_011080	TGC	2	6	535182	535187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446686

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