MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011080	GCT	2	6	483630	483635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446549
9002	NC_011080	TCA	3	9	483805	483813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445703
9003	NC_011080	GCA	2	6	483814	483819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445703
9004	NC_011080	CCA	2	6	483829	483834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445703
9005	NC_011080	GCGCC	2	10	483847	483856	0 %	0 %	40 %	60 %	194445703
9006	NC_011080	CGGT	2	8	483873	483880	0 %	25 %	50 %	25 %	194445703
9007	NC_011080	CGT	2	6	483905	483910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445703
9008	NC_011080	CGG	2	6	483917	483922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445703
9009	NC_011080	ATC	3	9	483927	483935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445703
9010	NC_011080	CAGCGC	2	12	483971	483982	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445703
9011	NC_011080	CGACG	2	10	484055	484064	20 %	0 %	40 %	40 %	194445703
9012	NC_011080	CGG	2	6	484075	484080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445703
9013	NC_011080	CAGCGC	2	12	484295	484306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445703
9014	NC_011080	CGC	2	6	484315	484320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445703
9015	NC_011080	AGC	2	6	484323	484328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445703
9016	NC_011080	CTG	2	6	484448	484453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445703
9017	NC_011080	CGCC	2	8	484525	484532	0 %	0 %	25 %	75 %	194445703
9018	NC_011080	TGGC	2	8	484564	484571	0 %	25 %	50 %	25 %	194445703
9019	NC_011080	GCC	2	6	484592	484597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442916
9020	NC_011080	GACAA	2	10	484625	484634	60 %	0 %	20 %	20 %	194442916
9021	NC_011080	CAT	2	6	484699	484704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442916
9022	NC_011080	CCA	2	6	484784	484789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442916
9023	NC_011080	GCC	2	6	484808	484813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442916
9024	NC_011080	CGG	2	6	484987	484992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442916
9025	NC_011080	TCA	2	6	485013	485018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442916
9026	NC_011080	ATAA	2	8	485047	485054	75 %	25 %	0 %	0 %	194442916
9027	NC_011080	CGA	2	6	485103	485108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442916
9028	NC_011080	CAG	3	9	485173	485181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442916
9029	NC_011080	CGG	2	6	485187	485192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442916
9030	NC_011080	ACC	2	6	485252	485257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442916
9031	NC_011080	CCAGCA	2	12	485346	485357	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194442916
9032	NC_011080	AGC	3	9	485363	485371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442916
9033	NC_011080	CAG	2	6	485374	485379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442916
9034	NC_011080	CAT	2	6	485450	485455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442326
9035	NC_011080	CG	3	6	485489	485494	0 %	0 %	50 %	50 %	194442326
9036	NC_011080	CA	3	6	485546	485551	50 %	0 %	0 %	50 %	194442326
9037	NC_011080	CAG	2	6	485658	485663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442326
9038	NC_011080	TGT	2	6	485666	485671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442326
9039	NC_011080	GTG	2	6	485676	485681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442326
9040	NC_011080	CG	3	6	485697	485702	0 %	0 %	50 %	50 %	194442326
9041	NC_011080	CACCG	2	10	485706	485715	20 %	0 %	20 %	60 %	194442326
9042	NC_011080	CCA	2	6	485729	485734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442326
9043	NC_011080	GA	3	6	485770	485775	50 %	0 %	50 %	0 %	194442326
9044	NC_011080	CGG	2	6	485798	485803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442326
9045	NC_011080	GC	3	6	485831	485836	0 %	0 %	50 %	50 %	194442326
9046	NC_011080	CCA	2	6	485975	485980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442326
9047	NC_011080	TAT	2	6	485981	485986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442326
9048	NC_011080	CG	3	6	486035	486040	0 %	0 %	50 %	50 %	194442326
9049	NC_011080	CG	3	6	486054	486059	0 %	0 %	50 %	50 %	194442326
9050	NC_011080	TGC	2	6	486076	486081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442326
9051	NC_011080	GCC	2	6	486084	486089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442326
9052	NC_011080	GCG	2	6	486112	486117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442326
9053	NC_011080	ATTA	2	8	486162	486169	50 %	50 %	0 %	0 %	194442326
9054	NC_011080	GCT	2	6	486179	486184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442326
9055	NC_011080	CAC	2	6	486252	486257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442326
9056	NC_011080	CGCA	2	8	486351	486358	25 %	0 %	25 %	50 %	194442326
9057	NC_011080	CGT	2	6	486363	486368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442326
9058	NC_011080	AG	3	6	486426	486431	50 %	0 %	50 %	0 %	194442326
9059	NC_011080	CAC	2	6	486441	486446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442326
9060	NC_011080	TCA	2	6	486530	486535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442326
9061	NC_011080	TCG	2	6	486669	486674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443954
9062	NC_011080	CTT	2	6	486736	486741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443954
9063	NC_011080	CAG	2	6	486746	486751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443954
9064	NC_011080	GCG	2	6	486784	486789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443954
9065	NC_011080	GC	3	6	486826	486831	0 %	0 %	50 %	50 %	194443954
9066	NC_011080	GGCC	2	8	486851	486858	0 %	0 %	50 %	50 %	194443954
9067	NC_011080	AGA	2	6	486859	486864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443954
9068	NC_011080	TTA	2	6	486939	486944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443954
9069	NC_011080	GCA	2	6	487054	487059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443954
9070	NC_011080	CCG	2	6	487063	487068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443954
9071	NC_011080	CAG	2	6	487160	487165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443954
9072	NC_011080	TGT	2	6	487171	487176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443954
9073	NC_011080	GCG	2	6	487204	487209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443954
9074	NC_011080	GTT	2	6	487217	487222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443954
9075	NC_011080	GCG	2	6	487242	487247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443954
9076	NC_011080	CAG	2	6	487265	487270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443954
9077	NC_011080	CGG	3	9	487276	487284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443954
9078	NC_011080	TGAA	2	8	487290	487297	50 %	25 %	25 %	0 %	194443954
9079	NC_011080	GGC	2	6	487299	487304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443954
9080	NC_011080	CCA	2	6	487368	487373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443954
9081	NC_011080	ACC	2	6	487485	487490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443954
9082	NC_011080	AGAC	2	8	487525	487532	50 %	0 %	25 %	25 %	194443954
9083	NC_011080	ATCCAG	2	12	487807	487818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194445645
9084	NC_011080	GCA	2	6	487851	487856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445645
9085	NC_011080	ATGC	2	8	487933	487940	25 %	25 %	25 %	25 %	194445645
9086	NC_011080	GCA	2	6	488004	488009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445645
9087	NC_011080	CGGG	2	8	488021	488028	0 %	0 %	75 %	25 %	194445645
9088	NC_011080	CAG	2	6	488086	488091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445645
9089	NC_011080	GCTGGA	2	12	488109	488120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194445645
9090	NC_011080	GGT	2	6	488146	488151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445645
9091	NC_011080	CGC	2	6	488157	488162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445645
9092	NC_011080	AACC	2	8	488261	488268	50 %	0 %	0 %	50 %	194445645
9093	NC_011080	CGA	2	6	488270	488275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445645
9094	NC_011080	GC	3	6	488279	488284	0 %	0 %	50 %	50 %	194445645
9095	NC_011080	GTG	2	6	488339	488344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445645
9096	NC_011080	CAC	2	6	488656	488661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445212
9097	NC_011080	AAG	2	6	488676	488681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445212
9098	NC_011080	TGT	2	6	488685	488690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445212
9099	NC_011080	GAT	3	9	488708	488716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445212
9100	NC_011080	GTG	2	6	488729	488734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445212
9101	NC_011080	CAG	2	6	488747	488752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445212
9102	NC_011080	TAC	2	6	488793	488798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445212
9103	NC_011080	GGCC	2	8	488911	488918	0 %	0 %	50 %	50 %	194445212
9104	NC_011080	GCG	2	6	488949	488954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445212
9105	NC_011080	GC	3	6	488960	488965	0 %	0 %	50 %	50 %	194445212
9106	NC_011080	CCGAC	2	10	489000	489009	20 %	0 %	20 %	60 %	194445212
9107	NC_011080	ACC	2	6	489044	489049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445212
9108	NC_011080	TGA	2	6	489067	489072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445212
9109	NC_011080	AGC	2	6	489125	489130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445212
9110	NC_011080	CGG	2	6	489133	489138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445212
9111	NC_011080	GCA	2	6	489155	489160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445212
9112	NC_011080	CGCT	2	8	489272	489279	0 %	25 %	25 %	50 %	194445212
9113	NC_011080	GGA	2	6	489313	489318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445212
9114	NC_011080	CA	3	6	489349	489354	50 %	0 %	0 %	50 %	194445212
9115	NC_011080	GTGGC	2	10	489402	489411	0 %	20 %	60 %	20 %	194445212
9116	NC_011080	TCA	2	6	489418	489423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445212
9117	NC_011080	TGG	2	6	489450	489455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445212
9118	NC_011080	GCT	2	6	489484	489489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445212
9119	NC_011080	CGC	2	6	489569	489574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445212
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9121	NC_011080	GCC	2	6	489659	489664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445212
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9246	NC_011080	GCAA	2	8	496395	496402	50 %	0 %	25 %	25 %	194445524
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9249	NC_011080	GTGA	2	8	496573	496580	25 %	25 %	50 %	0 %	194445524
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9485	NC_011080	CGC	2	6	508676	508681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445635
9486	NC_011080	A	6	6	508732	508737	100 %	0 %	0 %	0 %	194445635
9487	NC_011080	TGGCGG	2	12	508742	508753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194445635
9488	NC_011080	CTG	2	6	508825	508830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445635
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9490	NC_011080	GCT	2	6	508857	508862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445635
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