MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011080	TGC	2	6	457038	457043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442327
8502	NC_011080	GGC	2	6	457108	457113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442327
8503	NC_011080	GCC	2	6	457163	457168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442327
8504	NC_011080	TGC	2	6	457214	457219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442327
8505	NC_011080	TTC	2	6	457534	457539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444781
8506	NC_011080	A	6	6	457578	457583	100 %	0 %	0 %	0 %	194444781
8507	NC_011080	CGC	2	6	457584	457589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444781
8508	NC_011080	TCC	2	6	457597	457602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444781
8509	NC_011080	CG	3	6	457679	457684	0 %	0 %	50 %	50 %	194445513
8510	NC_011080	ATC	2	6	457687	457692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445513
8511	NC_011080	TCC	2	6	457746	457751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445513
8512	NC_011080	CCG	2	6	457811	457816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445513
8513	NC_011080	TGT	2	6	457836	457841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445513
8514	NC_011080	CGG	3	9	457857	457865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8515	NC_011080	CTG	2	6	457909	457914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445513
8516	NC_011080	CGC	2	6	457955	457960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445513
8517	NC_011080	GCT	2	6	458085	458090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445513
8518	NC_011080	ATT	2	6	458125	458130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445513
8519	NC_011080	GCG	2	6	458306	458311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8520	NC_011080	GC	3	6	458320	458325	0 %	0 %	50 %	50 %	194445513
8521	NC_011080	GGCC	2	8	458349	458356	0 %	0 %	50 %	50 %	194445513
8522	NC_011080	GGCG	2	8	458361	458368	0 %	0 %	75 %	25 %	194445513
8523	NC_011080	GCT	2	6	458379	458384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445513
8524	NC_011080	CCTTG	2	10	458388	458397	0 %	40 %	20 %	40 %	194445513
8525	NC_011080	TCAG	2	8	458433	458440	25 %	25 %	25 %	25 %	194445513
8526	NC_011080	CGGCG	2	10	458445	458454	0 %	0 %	60 %	40 %	194445513
8527	NC_011080	TTC	2	6	458456	458461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445513
8528	NC_011080	GGC	2	6	458485	458490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8529	NC_011080	CTG	2	6	458503	458508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445513
8530	NC_011080	GCG	2	6	458509	458514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8531	NC_011080	CGG	2	6	458540	458545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8532	NC_011080	CCTGCG	2	12	458555	458566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194445513
8533	NC_011080	CGG	2	6	458622	458627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445513
8534	NC_011080	TGG	2	6	458636	458641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445513
8535	NC_011080	CTAT	2	8	458696	458703	25 %	50 %	0 %	25 %	194445513
8536	NC_011080	TGG	2	6	458746	458751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445513
8537	NC_011080	ATC	2	6	458767	458772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445513
8538	NC_011080	TGC	2	6	458843	458848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445513
8539	NC_011080	GGT	2	6	458907	458912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445513
8540	NC_011080	CG	3	6	458941	458946	0 %	0 %	50 %	50 %	194445513
8541	NC_011080	T	6	6	459024	459029	0 %	100 %	0 %	0 %	194444302
8542	NC_011080	AAT	2	6	459063	459068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444302
8543	NC_011080	CGG	2	6	459151	459156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444302
8544	NC_011080	TAT	2	6	459197	459202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444302
8545	NC_011080	AT	3	6	459218	459223	50 %	50 %	0 %	0 %	194444302
8546	NC_011080	GC	3	6	459230	459235	0 %	0 %	50 %	50 %	194444302
8547	NC_011080	GCC	2	6	459264	459269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444302
8548	NC_011080	TCG	2	6	459355	459360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444302
8549	NC_011080	CCG	2	6	459409	459414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444302
8550	NC_011080	GTG	2	6	459441	459446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444302
8551	NC_011080	TGA	2	6	459469	459474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444302
8552	NC_011080	CTT	2	6	459512	459517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444302
8553	NC_011080	CCA	2	6	459526	459531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444302
8554	NC_011080	TTA	2	6	459532	459537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444302
8555	NC_011080	CAT	2	6	459560	459565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444302
8556	NC_011080	TG	3	6	459566	459571	0 %	50 %	50 %	0 %	194444302
8557	NC_011080	CGG	2	6	459584	459589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444302
8558	NC_011080	CGG	2	6	459623	459628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444302
8559	NC_011080	CTT	2	6	459629	459634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444302
8560	NC_011080	TGGC	2	8	459641	459648	0 %	25 %	50 %	25 %	194444302
8561	NC_011080	CGG	2	6	459689	459694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444302
8562	NC_011080	CCG	2	6	459715	459720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444302
8563	NC_011080	CG	3	6	459751	459756	0 %	0 %	50 %	50 %	194444302
8564	NC_011080	TCTA	2	8	459819	459826	25 %	50 %	0 %	25 %	194444302
8565	NC_011080	GCC	2	6	459897	459902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444302
8566	NC_011080	TGC	2	6	459976	459981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444302
8567	NC_011080	GC	3	6	460003	460008	0 %	0 %	50 %	50 %	194444302
8568	NC_011080	TGA	2	6	460063	460068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444302
8569	NC_011080	GCT	2	6	460076	460081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444302
8570	NC_011080	CAT	2	6	460103	460108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444302
8571	NC_011080	GGTATG	2	12	460157	460168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194444302
8572	NC_011080	CTG	2	6	460179	460184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444302
8573	NC_011080	CGT	3	9	460200	460208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444302
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8575	NC_011080	ACG	2	6	460263	460268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444302
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8583	NC_011080	T	6	6	460956	460961	0 %	100 %	0 %	0 %	194444664
8584	NC_011080	ACC	2	6	461028	461033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444664
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8587	NC_011080	GGCG	2	8	461089	461096	0 %	0 %	75 %	25 %	194444664
8588	NC_011080	CGG	2	6	461110	461115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444664
8589	NC_011080	A	6	6	461153	461158	100 %	0 %	0 %	0 %	194444664
8590	NC_011080	GGC	2	6	461255	461260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444664
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8592	NC_011080	GCG	2	6	461281	461286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444664
8593	NC_011080	GCA	2	6	461376	461381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444664
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8599	NC_011080	TCGT	2	8	461541	461548	0 %	50 %	25 %	25 %	194444664
8600	NC_011080	GGC	2	6	461583	461588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444664
8601	NC_011080	GGCG	2	8	461614	461621	0 %	0 %	75 %	25 %	194444664
8602	NC_011080	GC	3	6	461624	461629	0 %	0 %	50 %	50 %	194444664
8603	NC_011080	GCA	2	6	461638	461643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444664
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8605	NC_011080	GCC	2	6	461750	461755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444664
8606	NC_011080	TGGA	2	8	461855	461862	25 %	25 %	50 %	0 %	194444664
8607	NC_011080	CAA	2	6	461891	461896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444664
8608	NC_011080	GC	3	6	461933	461938	0 %	0 %	50 %	50 %	194444664
8609	NC_011080	CTG	2	6	461948	461953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444664
8610	NC_011080	GC	3	6	461966	461971	0 %	0 %	50 %	50 %	194444664
8611	NC_011080	GGT	2	6	461983	461988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444664
8612	NC_011080	TATT	2	8	462019	462026	25 %	75 %	0 %	0 %	194444664
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8616	NC_011080	CGTTGC	2	12	462291	462302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444664
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8620	NC_011080	TGG	2	6	462659	462664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442811
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8988	NC_011080	ATG	2	6	483073	483078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446549
8989	NC_011080	CG	3	6	483082	483087	0 %	0 %	50 %	50 %	194446549
8990	NC_011080	CCAG	2	8	483155	483162	25 %	0 %	25 %	50 %	194446549
8991	NC_011080	GC	3	6	483256	483261	0 %	0 %	50 %	50 %	194446549
8992	NC_011080	GAA	3	9	483361	483369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446549
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