MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_011080	AGC	2	6	4420293	4420298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445565
81502	NC_011080	CCG	2	6	4420524	4420529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445565
81503	NC_011080	GAT	2	6	4420591	4420596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444191
81504	NC_011080	ATA	2	6	4420625	4420630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444191
81505	NC_011080	GAT	2	6	4420651	4420656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444191
81506	NC_011080	GGT	2	6	4420720	4420725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444191
81507	NC_011080	CTC	2	6	4420753	4420758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444569
81508	NC_011080	CGG	3	9	4420766	4420774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444569
81509	NC_011080	CG	3	6	4420814	4420819	0 %	0 %	50 %	50 %	194444569
81510	NC_011080	GCT	2	6	4420866	4420871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444569
81511	NC_011080	GCC	2	6	4420975	4420980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444569
81512	NC_011080	GCT	2	6	4421021	4421026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444569
81513	NC_011080	T	7	7	4421054	4421060	0 %	100 %	0 %	0 %	194444569
81514	NC_011080	CGC	2	6	4421078	4421083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444569
81515	NC_011080	TTTC	2	8	4421087	4421094	0 %	75 %	0 %	25 %	194444569
81516	NC_011080	CTTC	2	8	4421105	4421112	0 %	50 %	0 %	50 %	194444569
81517	NC_011080	T	7	7	4421138	4421144	0 %	100 %	0 %	0 %	194444569
81518	NC_011080	TCA	2	6	4421149	4421154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444569
81519	NC_011080	CATC	2	8	4421171	4421178	25 %	25 %	0 %	50 %	194444569
81520	NC_011080	TCA	2	6	4421216	4421221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444569
81521	NC_011080	GTG	2	6	4421290	4421295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444569
81522	NC_011080	GCC	2	6	4421355	4421360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444569
81523	NC_011080	TGG	2	6	4421395	4421400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444569
81524	NC_011080	GGT	2	6	4421508	4421513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444569
81525	NC_011080	CGA	2	6	4421660	4421665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444569
81526	NC_011080	GTT	2	6	4421719	4421724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445074
81527	NC_011080	TC	3	6	4421747	4421752	0 %	50 %	0 %	50 %	194445074
81528	NC_011080	GTT	2	6	4421780	4421785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445074
81529	NC_011080	GGC	2	6	4421795	4421800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81530	NC_011080	CGC	2	6	4421806	4421811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81531	NC_011080	TGCG	2	8	4421859	4421866	0 %	25 %	50 %	25 %	194445074
81532	NC_011080	CCG	2	6	4421889	4421894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81533	NC_011080	CGG	2	6	4421921	4421926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81534	NC_011080	GGC	2	6	4421930	4421935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81535	NC_011080	GCG	2	6	4421956	4421961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81536	NC_011080	GCG	2	6	4422010	4422015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81537	NC_011080	CGG	3	9	4422058	4422066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81538	NC_011080	GC	3	6	4422097	4422102	0 %	0 %	50 %	50 %	194445074
81539	NC_011080	TCT	2	6	4422133	4422138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445074
81540	NC_011080	AGGAA	2	10	4422153	4422162	60 %	0 %	40 %	0 %	194445074
81541	NC_011080	GCC	2	6	4422203	4422208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81542	NC_011080	CCAGT	2	10	4422245	4422254	20 %	20 %	20 %	40 %	194445074
81543	NC_011080	GCG	2	6	4422286	4422291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81544	NC_011080	GGC	2	6	4422410	4422415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
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81546	NC_011080	CCAG	2	8	4422469	4422476	25 %	0 %	25 %	50 %	194445074
81547	NC_011080	CAG	2	6	4422524	4422529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445074
81548	NC_011080	GC	3	6	4422577	4422582	0 %	0 %	50 %	50 %	194445074
81549	NC_011080	GCC	3	9	4422587	4422595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81550	NC_011080	GCG	2	6	4422784	4422789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445074
81551	NC_011080	TCA	3	9	4422915	4422923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445074
81552	NC_011080	CGC	2	6	4422938	4422943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81553	NC_011080	CGC	2	6	4423075	4423080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81554	NC_011080	GC	3	6	4423079	4423084	0 %	0 %	50 %	50 %	194445074
81555	NC_011080	CAG	2	6	4423211	4423216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445074
81556	NC_011080	GCC	2	6	4423305	4423310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
81557	NC_011080	CTT	2	6	4423372	4423377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445074
81558	NC_011080	GCC	3	9	4423439	4423447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
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81560	NC_011080	GC	3	6	4423549	4423554	0 %	0 %	50 %	50 %	194445074
81561	NC_011080	CGC	2	6	4423624	4423629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445074
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81567	NC_011080	T	6	6	4423849	4423854	0 %	100 %	0 %	0 %	194445074
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81569	NC_011080	TTTG	2	8	4423935	4423942	0 %	75 %	25 %	0 %	194445074
81570	NC_011080	TGAG	2	8	4423975	4423982	25 %	25 %	50 %	0 %	194445074
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81577	NC_011080	GCC	2	6	4424401	4424406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446083
81578	NC_011080	CG	3	6	4424449	4424454	0 %	0 %	50 %	50 %	194446083
81579	NC_011080	GC	3	6	4424455	4424460	0 %	0 %	50 %	50 %	194446083
81580	NC_011080	CGG	3	9	4424510	4424518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446083
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81585	NC_011080	CGT	2	6	4424918	4424923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446547
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81587	NC_011080	TACC	2	8	4424987	4424994	25 %	25 %	0 %	50 %	194446547
81588	NC_011080	CG	3	6	4425054	4425059	0 %	0 %	50 %	50 %	194446547
81589	NC_011080	ATT	2	6	4425069	4425074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446547
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81602	NC_011080	CG	4	8	4425771	4425778	0 %	0 %	50 %	50 %	194442415
81603	NC_011080	CTG	2	6	4425833	4425838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442415
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81607	NC_011080	TGG	2	6	4426057	4426062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442415
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81615	NC_011080	AT	3	6	4426735	4426740	50 %	50 %	0 %	0 %	194443771
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