MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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80002	NC_011080	CAGCGA	2	12	4329139	4329150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443060
80003	NC_011080	T	6	6	4329160	4329165	0 %	100 %	0 %	0 %	194443060
80004	NC_011080	CGT	2	6	4329174	4329179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443060
80005	NC_011080	GGTT	2	8	4329188	4329195	0 %	50 %	50 %	0 %	194443060
80006	NC_011080	GGC	2	6	4329238	4329243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443060
80007	NC_011080	CG	4	8	4329310	4329317	0 %	0 %	50 %	50 %	194443060
80008	NC_011080	GCA	2	6	4329324	4329329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443060
80009	NC_011080	GTG	2	6	4329356	4329361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443060
80010	NC_011080	TAC	2	6	4329501	4329506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443060
80011	NC_011080	GTTC	2	8	4329522	4329529	0 %	50 %	25 %	25 %	194443060
80012	NC_011080	TAC	2	6	4329921	4329926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442464
80013	NC_011080	TAA	2	6	4329953	4329958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442464
80014	NC_011080	CAGTA	2	10	4330055	4330064	40 %	20 %	20 %	20 %	194442464
80015	NC_011080	CAC	2	6	4330068	4330073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442464
80016	NC_011080	CTA	2	6	4330100	4330105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442464
80017	NC_011080	TGG	2	6	4330117	4330122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442464
80018	NC_011080	CGG	2	6	4330149	4330154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442464
80019	NC_011080	CGGCC	2	10	4330177	4330186	0 %	0 %	40 %	60 %	194442464
80020	NC_011080	CGT	2	6	4330211	4330216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442464
80021	NC_011080	GCA	2	6	4330281	4330286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442464
80022	NC_011080	CGC	2	6	4330310	4330315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442464
80023	NC_011080	GC	3	6	4330517	4330522	0 %	0 %	50 %	50 %	194442464
80024	NC_011080	ACG	2	6	4330535	4330540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442464
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80028	NC_011080	CG	3	6	4330772	4330777	0 %	0 %	50 %	50 %	194442464
80029	NC_011080	CGTC	2	8	4330783	4330790	0 %	25 %	25 %	50 %	194442464
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80032	NC_011080	GCAA	2	8	4330933	4330940	50 %	0 %	25 %	25 %	194442464
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80053	NC_011080	ATG	2	6	4332152	4332157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444582
80054	NC_011080	ATTA	2	8	4332163	4332170	50 %	50 %	0 %	0 %	194444582
80055	NC_011080	GGC	2	6	4332278	4332283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444582
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80083	NC_011080	GC	3	6	4333573	4333578	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
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80461	NC_011080	TGG	2	6	4362234	4362239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446147
80462	NC_011080	TCG	2	6	4362273	4362278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
80463	NC_011080	AAC	2	6	4362292	4362297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446147
80464	NC_011080	CTG	2	6	4362310	4362315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
80465	NC_011080	CAT	2	6	4362333	4362338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446147
80466	NC_011080	CGTA	2	8	4362339	4362346	25 %	25 %	25 %	25 %	194446147
80467	NC_011080	TGC	2	6	4362359	4362364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
80468	NC_011080	CTG	2	6	4362382	4362387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
80469	NC_011080	GTC	2	6	4362395	4362400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
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80472	NC_011080	CCA	3	9	4362638	4362646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446147
80473	NC_011080	GAA	2	6	4362657	4362662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446147
80474	NC_011080	GAA	2	6	4362676	4362681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446147
80475	NC_011080	CTG	2	6	4362730	4362735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446147
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80479	NC_011080	ATC	2	6	4362961	4362966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446147
80480	NC_011080	TAC	2	6	4362997	4363002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446147
80481	NC_011080	AAG	2	6	4363058	4363063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446147
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80483	NC_011080	CT	3	6	4363092	4363097	0 %	50 %	0 %	50 %	194446147
80484	NC_011080	GC	3	6	4363102	4363107	0 %	0 %	50 %	50 %	194446147
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80488	NC_011080	A	6	6	4363411	4363416	100 %	0 %	0 %	0 %	194446147
80489	NC_011080	ATC	2	6	4363423	4363428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446147
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80492	NC_011080	GAT	2	6	4363554	4363559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446147
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80494	NC_011080	AGC	2	6	4363607	4363612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446147
80495	NC_011080	ATG	2	6	4363636	4363641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446147
80496	NC_011080	CAT	2	6	4363725	4363730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446147
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80499	NC_011080	TGG	2	6	4363886	4363891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446147
80500	NC_011080	TGA	2	6	4363928	4363933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446147

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