MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_011080	AGCGA	2	10	372064	372073	40 %	0 %	40 %	20 %	194443082
7003	NC_011080	CGG	2	6	372174	372179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
7004	NC_011080	CTG	2	6	372181	372186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443082
7005	NC_011080	GCC	2	6	372209	372214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443082
7006	NC_011080	CTT	2	6	372278	372283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443082
7007	NC_011080	GGC	2	6	372399	372404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
7008	NC_011080	TGC	2	6	372449	372454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443082
7009	NC_011080	CG	3	6	372485	372490	0 %	0 %	50 %	50 %	194443082
7010	NC_011080	GCG	3	9	372488	372496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
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7012	NC_011080	CGG	2	6	372546	372551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
7013	NC_011080	AGC	2	6	372580	372585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443082
7014	NC_011080	ATT	2	6	372610	372615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443082
7015	NC_011080	AGCA	2	8	372709	372716	50 %	0 %	25 %	25 %	194443082
7016	NC_011080	GCG	2	6	372728	372733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
7017	NC_011080	TGG	2	6	372848	372853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443082
7018	NC_011080	ATGG	2	8	372862	372869	25 %	25 %	50 %	0 %	194443082
7019	NC_011080	TGC	2	6	372939	372944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443082
7020	NC_011080	CGG	2	6	373008	373013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443082
7021	NC_011080	ACC	2	6	373093	373098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443082
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7023	NC_011080	TGG	2	6	375368	375373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446639
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7028	NC_011080	ATA	2	6	375876	375881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967502
7029	NC_011080	CTT	2	6	375951	375956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967502
7030	NC_011080	TTA	2	6	375974	375979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967502
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7032	NC_011080	CTG	2	6	376035	376040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967502
7033	NC_011080	T	6	6	376113	376118	0 %	100 %	0 %	0 %	448967502
7034	NC_011080	AGG	2	6	376132	376137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448967502
7035	NC_011080	CAT	3	9	376164	376172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967502
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7037	NC_011080	CGG	2	6	376227	376232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967502
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7040	NC_011080	ATTTT	2	10	376293	376302	20 %	80 %	0 %	0 %	448967502
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7042	NC_011080	TGA	2	6	376347	376352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967502
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7044	NC_011080	GTT	2	6	376426	376431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448967502
7045	NC_011080	CATC	2	8	376569	376576	25 %	25 %	0 %	50 %	448967502
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7047	NC_011080	T	7	7	376666	376672	0 %	100 %	0 %	0 %	448967502
7048	NC_011080	TGC	2	6	376684	376689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967502
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7051	NC_011080	TTTCA	2	10	376792	376801	20 %	60 %	0 %	20 %	448967502
7052	NC_011080	CTA	2	6	376915	376920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967502
7053	NC_011080	CAT	2	6	376992	376997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967502
7054	NC_011080	TGA	2	6	377001	377006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967502
7055	NC_011080	ATT	2	6	377020	377025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967502
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7057	NC_011080	A	6	6	377072	377077	100 %	0 %	0 %	0 %	448967502
7058	NC_011080	CAGT	2	8	377078	377085	25 %	25 %	25 %	25 %	448967502
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7065	NC_011080	CTG	2	6	377695	377700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442218
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7107	NC_011080	GCT	2	6	379751	379756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445346
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7109	NC_011080	GCA	2	6	379782	379787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445346
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7122	NC_011080	TGT	2	6	380577	380582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443448
7123	NC_011080	CGA	2	6	380608	380613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443448
7124	NC_011080	TGG	2	6	380655	380660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443448
7125	NC_011080	GAT	2	6	380696	380701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443448
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7127	NC_011080	GAT	2	6	380816	380821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443448
7128	NC_011080	GCT	2	6	380847	380852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443448
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7137	NC_011080	TGGG	2	8	381367	381374	0 %	25 %	75 %	0 %	194444233
7138	NC_011080	GTC	2	6	381384	381389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444233
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7140	NC_011080	GTC	2	6	381503	381508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444233
7141	NC_011080	TGG	2	6	381571	381576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444233
7142	NC_011080	GAT	2	6	381609	381614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444233
7143	NC_011080	TG	3	6	381664	381669	0 %	50 %	50 %	0 %	194444233
7144	NC_011080	GCA	2	6	381725	381730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444233
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7146	NC_011080	ACGG	2	8	381783	381790	25 %	0 %	50 %	25 %	194444233
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7150	NC_011080	TA	3	6	381979	381984	50 %	50 %	0 %	0 %	194444233
7151	NC_011080	TCA	2	6	381993	381998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444233
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7164	NC_011080	GCT	2	6	383878	383883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446037
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7200	NC_011080	GTA	2	6	386518	386523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446287
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7225	NC_011080	GCGG	2	8	387714	387721	0 %	0 %	75 %	25 %	194446287
7226	NC_011080	GTCG	2	8	387736	387743	0 %	25 %	50 %	25 %	194446287
7227	NC_011080	TCA	2	6	387771	387776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446287
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7232	NC_011080	TAACAA	2	12	388258	388269	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194445521
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7234	NC_011080	GCA	2	6	388378	388383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445521
7235	NC_011080	ATTTT	2	10	388392	388401	20 %	80 %	0 %	0 %	194445521
7236	NC_011080	TGG	2	6	388427	388432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445521
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7238	NC_011080	GTT	2	6	388490	388495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445521
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7240	NC_011080	CGG	2	6	388544	388549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445521
7241	NC_011080	GCT	2	6	388571	388576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445521
7242	NC_011080	CAT	2	6	388639	388644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445521
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7489	NC_011080	GAT	2	6	403883	403888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442931
7490	NC_011080	GGT	2	6	403931	403936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
7491	NC_011080	GC	3	6	403960	403965	0 %	0 %	50 %	50 %	194442931
7492	NC_011080	CCG	2	6	403981	403986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
7493	NC_011080	CGG	2	6	403988	403993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
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