MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70002	NC_011080	CAC	2	6	3798846	3798851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444158
70003	NC_011080	TAT	2	6	3798857	3798862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444158
70004	NC_011080	TGT	2	6	3798865	3798870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444158
70005	NC_011080	TGC	2	6	3798986	3798991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70006	NC_011080	CAG	2	6	3799011	3799016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70007	NC_011080	TCA	2	6	3799067	3799072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444158
70008	NC_011080	CGC	2	6	3799118	3799123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444158
70009	NC_011080	GTT	2	6	3799167	3799172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444158
70010	NC_011080	GTAAG	2	10	3799216	3799225	40 %	20 %	40 %	0 %	194444158
70011	NC_011080	CAC	2	6	3799259	3799264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444158
70012	NC_011080	GTT	2	6	3799266	3799271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444158
70013	NC_011080	GC	3	6	3799280	3799285	0 %	0 %	50 %	50 %	194444158
70014	NC_011080	CG	4	8	3799286	3799293	0 %	0 %	50 %	50 %	194444158
70015	NC_011080	CCG	2	6	3799369	3799374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444158
70016	NC_011080	CTG	2	6	3799392	3799397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70017	NC_011080	GTTGTA	2	12	3799407	3799418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	194444158
70018	NC_011080	CGC	2	6	3799439	3799444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444158
70019	NC_011080	TGC	2	6	3799487	3799492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70020	NC_011080	CTG	2	6	3799557	3799562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70021	NC_011080	GGT	2	6	3799592	3799597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444158
70022	NC_011080	AGT	2	6	3799766	3799771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444158
70023	NC_011080	CTG	2	6	3799773	3799778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70024	NC_011080	TGC	2	6	3799816	3799821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70025	NC_011080	CAG	2	6	3799941	3799946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70026	NC_011080	GCTT	2	8	3800027	3800034	0 %	50 %	25 %	25 %	194444158
70027	NC_011080	TCC	2	6	3800091	3800096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444158
70028	NC_011080	GTC	2	6	3800112	3800117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
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70030	NC_011080	CAC	2	6	3800129	3800134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444158
70031	NC_011080	TCGGC	2	10	3800189	3800198	0 %	20 %	40 %	40 %	194444158
70032	NC_011080	CGG	2	6	3800228	3800233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444158
70033	NC_011080	GGA	2	6	3800264	3800269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444158
70034	NC_011080	GAG	2	6	3800278	3800283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444158
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70036	NC_011080	CGC	2	6	3800342	3800347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444158
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70038	NC_011080	GCTG	2	8	3800486	3800493	0 %	25 %	50 %	25 %	194444158
70039	NC_011080	GCA	2	6	3800498	3800503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70040	NC_011080	TCG	2	6	3800509	3800514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70041	NC_011080	CGG	2	6	3800561	3800566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444158
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70043	NC_011080	CGT	2	6	3800654	3800659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70044	NC_011080	TAG	2	6	3800728	3800733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444158
70045	NC_011080	TGT	2	6	3800741	3800746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444158
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70047	NC_011080	CCA	2	6	3800804	3800809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444158
70048	NC_011080	CG	3	6	3800855	3800860	0 %	0 %	50 %	50 %	194444158
70049	NC_011080	GTCTG	2	10	3800902	3800911	0 %	40 %	40 %	20 %	194444158
70050	NC_011080	TGGC	2	8	3800923	3800930	0 %	25 %	50 %	25 %	194444158
70051	NC_011080	AAT	2	6	3800940	3800945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444158
70052	NC_011080	GTC	2	6	3800946	3800951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444158
70053	NC_011080	ACGC	2	8	3801006	3801013	25 %	0 %	25 %	50 %	194444158
70054	NC_011080	GC	3	6	3801070	3801075	0 %	0 %	50 %	50 %	194444158
70055	NC_011080	T	9	9	3801119	3801127	0 %	100 %	0 %	0 %	194444158
70056	NC_011080	ACC	3	9	3801133	3801141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444158
70057	NC_011080	TCC	2	6	3801226	3801231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444158
70058	NC_011080	ATC	2	6	3801280	3801285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444158
70059	NC_011080	AGCGCA	2	12	3801286	3801297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444158
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70061	NC_011080	TAA	2	6	3801420	3801425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445517
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70063	NC_011080	TGCCGG	2	12	3801450	3801461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194445517
70064	NC_011080	T	6	6	3801507	3801512	0 %	100 %	0 %	0 %	194445517
70065	NC_011080	TTA	2	6	3801539	3801544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445517
70066	NC_011080	CCG	2	6	3801648	3801653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445517
70067	NC_011080	GTAC	2	8	3801677	3801684	25 %	25 %	25 %	25 %	194445517
70068	NC_011080	TCG	2	6	3801786	3801791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445517
70069	NC_011080	TGA	2	6	3801849	3801854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445517
70070	NC_011080	TTA	2	6	3801869	3801874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445517
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70074	NC_011080	CTA	2	6	3801956	3801961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445517
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70099	NC_011080	AT	3	6	3803796	3803801	50 %	50 %	0 %	0 %	194446755
70100	NC_011080	TTG	2	6	3803804	3803809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446755
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70233	NC_011080	CGC	2	6	3811673	3811678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443639
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70262	NC_011080	CGGT	2	8	3813178	3813185	0 %	25 %	50 %	25 %	194443562
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70334	NC_011080	A	7	7	3816964	3816970	100 %	0 %	0 %	0 %	194444981
70335	NC_011080	CCA	2	6	3817011	3817016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444981
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70339	NC_011080	AC	3	6	3817180	3817185	50 %	0 %	0 %	50 %	194446653
70340	NC_011080	TACT	2	8	3817187	3817194	25 %	50 %	0 %	25 %	194446653
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70464	NC_011080	CTC	2	6	3824560	3824565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445720
70465	NC_011080	GGC	2	6	3824602	3824607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445720
70466	NC_011080	CTG	3	9	3824612	3824620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445720
70467	NC_011080	CAGCCG	2	12	3824745	3824756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445720
70468	NC_011080	CAA	2	6	3824816	3824821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445720
70469	NC_011080	CGA	2	6	3824869	3824874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445720
70470	NC_011080	GTC	2	6	3824885	3824890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445720
70471	NC_011080	GGGC	2	8	3824892	3824899	0 %	0 %	75 %	25 %	194445720
70472	NC_011080	CGC	2	6	3824900	3824905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445720
70473	NC_011080	GGA	2	6	3825141	3825146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443933
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70475	NC_011080	ACGC	2	8	3825162	3825169	25 %	0 %	25 %	50 %	194443933
70476	NC_011080	CAT	2	6	3825177	3825182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443933
70477	NC_011080	GGC	2	6	3825187	3825192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443933
70478	NC_011080	CA	3	6	3825203	3825208	50 %	0 %	0 %	50 %	194443933
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70482	NC_011080	GC	3	6	3825538	3825543	0 %	0 %	50 %	50 %	194443933
70483	NC_011080	CTG	2	6	3825556	3825561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443933
70484	NC_011080	GAA	2	6	3825613	3825618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443933
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70487	NC_011080	CGA	2	6	3825672	3825677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443933
70488	NC_011080	TGA	2	6	3825683	3825688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443933
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70490	NC_011080	GC	3	6	3825778	3825783	0 %	0 %	50 %	50 %	194443933
70491	NC_011080	ATC	2	6	3825859	3825864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443933
70492	NC_011080	CAT	2	6	3825906	3825911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443933
70493	NC_011080	GAT	2	6	3825942	3825947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443933
70494	NC_011080	CTG	2	6	3825973	3825978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443933
70495	NC_011080	CTA	2	6	3826008	3826013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443933
70496	NC_011080	TCG	2	6	3826044	3826049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443933
70497	NC_011080	GAA	2	6	3826060	3826065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443933
70498	NC_011080	ACC	2	6	3826132	3826137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443933
70499	NC_011080	GC	3	6	3826162	3826167	0 %	0 %	50 %	50 %	194443933
70500	NC_011080	TTTC	2	8	3826194	3826201	0 %	75 %	0 %	25 %	194443933

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