MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_011080	CCAG	2	8	3319738	3319745	25 %	0 %	25 %	50 %	194445866
61002	NC_011080	CTT	2	6	3319752	3319757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445866
61003	NC_011080	CCA	2	6	3319833	3319838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445866
61004	NC_011080	ACG	2	6	3319897	3319902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445866
61005	NC_011080	AGT	2	6	3319917	3319922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445866
61006	NC_011080	GCC	2	6	3319957	3319962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445866
61007	NC_011080	CTT	2	6	3319989	3319994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445866
61008	NC_011080	ATC	2	6	3320105	3320110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445866
61009	NC_011080	CGG	2	6	3320124	3320129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445866
61010	NC_011080	GAA	2	6	3320137	3320142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445866
61011	NC_011080	GTC	2	6	3320170	3320175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445866
61012	NC_011080	GAT	2	6	3320200	3320205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445866
61013	NC_011080	AAT	2	6	3320296	3320301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445866
61014	NC_011080	GGC	2	6	3320374	3320379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445866
61015	NC_011080	AC	3	6	3320934	3320939	50 %	0 %	0 %	50 %	194446478
61016	NC_011080	TTCA	2	8	3320941	3320948	25 %	50 %	0 %	25 %	194446478
61017	NC_011080	AACG	2	8	3321143	3321150	50 %	0 %	25 %	25 %	194446478
61018	NC_011080	TGA	2	6	3321165	3321170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446478
61019	NC_011080	ACT	2	6	3321276	3321281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446478
61020	NC_011080	TCC	2	6	3321323	3321328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446478
61021	NC_011080	TCG	2	6	3321342	3321347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61022	NC_011080	ACG	2	6	3321360	3321365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61023	NC_011080	GCG	2	6	3321366	3321371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446478
61024	NC_011080	CGA	2	6	3321409	3321414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61025	NC_011080	GCA	2	6	3321439	3321444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61026	NC_011080	CGG	2	6	3321478	3321483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446478
61027	NC_011080	GGC	2	6	3321545	3321550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446478
61028	NC_011080	AAC	2	6	3321554	3321559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446478
61029	NC_011080	CGA	2	6	3321613	3321618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61030	NC_011080	TCA	2	6	3321645	3321650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446478
61031	NC_011080	TA	3	6	3321696	3321701	50 %	50 %	0 %	0 %	194446478
61032	NC_011080	GCA	2	6	3321721	3321726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446478
61033	NC_011080	CGC	2	6	3321748	3321753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446478
61034	NC_011080	GTT	2	6	3321797	3321802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446478
61035	NC_011080	TGA	2	6	3321847	3321852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446478
61036	NC_011080	TCAG	2	8	3321871	3321878	25 %	25 %	25 %	25 %	194446478
61037	NC_011080	TGC	2	6	3321994	3321999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443527
61038	NC_011080	TAT	2	6	3322002	3322007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443527
61039	NC_011080	GGC	2	6	3322044	3322049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443527
61040	NC_011080	GC	3	6	3322048	3322053	0 %	0 %	50 %	50 %	194443527
61041	NC_011080	AGC	2	6	3322072	3322077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443527
61042	NC_011080	CGA	2	6	3322083	3322088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443527
61043	NC_011080	GAT	2	6	3322113	3322118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443527
61044	NC_011080	GGC	2	6	3322126	3322131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443527
61045	NC_011080	CCG	2	6	3322139	3322144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443527
61046	NC_011080	A	7	7	3322149	3322155	100 %	0 %	0 %	0 %	194443527
61047	NC_011080	CGCC	2	8	3322196	3322203	0 %	0 %	25 %	75 %	194443527
61048	NC_011080	ATT	2	6	3322231	3322236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443527
61049	NC_011080	CGG	2	6	3322266	3322271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443527
61050	NC_011080	ATT	2	6	3322276	3322281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443527
61051	NC_011080	GCG	2	6	3322291	3322296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443527
61052	NC_011080	GCG	2	6	3322364	3322369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443527
61053	NC_011080	TAC	2	6	3322381	3322386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443527
61054	NC_011080	ATC	2	6	3322412	3322417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443527
61055	NC_011080	AT	3	6	3322441	3322446	50 %	50 %	0 %	0 %	194444210
61056	NC_011080	AT	3	6	3322456	3322461	50 %	50 %	0 %	0 %	194444210
61057	NC_011080	AAT	2	6	3322468	3322473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444210
61058	NC_011080	A	6	6	3322602	3322607	100 %	0 %	0 %	0 %	194444210
61059	NC_011080	GCT	2	6	3322633	3322638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61060	NC_011080	T	6	6	3322649	3322654	0 %	100 %	0 %	0 %	194444210
61061	NC_011080	GCC	2	6	3322728	3322733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444210
61062	NC_011080	CGGCT	2	10	3322792	3322801	0 %	20 %	40 %	40 %	194444210
61063	NC_011080	CAT	2	6	3322828	3322833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444210
61064	NC_011080	AAG	2	6	3322851	3322856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444210
61065	NC_011080	TGA	2	6	3322911	3322916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444210
61066	NC_011080	GCG	2	6	3322956	3322961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444210
61067	NC_011080	CGC	2	6	3322972	3322977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444210
61068	NC_011080	GCG	2	6	3323036	3323041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444210
61069	NC_011080	CCA	2	6	3323056	3323061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444210
61070	NC_011080	TAT	3	9	3323143	3323151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444210
61071	NC_011080	CGG	2	6	3323152	3323157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444210
61072	NC_011080	CGG	2	6	3323164	3323169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444210
61073	NC_011080	CTGGCG	2	12	3323216	3323227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194444210
61074	NC_011080	CTG	2	6	3323270	3323275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61075	NC_011080	GTA	2	6	3323282	3323287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444210
61076	NC_011080	GCT	2	6	3323316	3323321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61077	NC_011080	AATGA	2	10	3323372	3323381	60 %	20 %	20 %	0 %	194444210
61078	NC_011080	AAAT	2	8	3323398	3323405	75 %	25 %	0 %	0 %	194444210
61079	NC_011080	TCG	2	6	3323442	3323447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61080	NC_011080	TTCC	2	8	3323495	3323502	0 %	50 %	0 %	50 %	194444210
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61082	NC_011080	TCG	2	6	3323604	3323609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61083	NC_011080	GTC	2	6	3323642	3323647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61084	NC_011080	GAT	2	6	3323692	3323697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444210
61085	NC_011080	CTG	2	6	3323720	3323725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444210
61086	NC_011080	TCCT	2	8	3323743	3323750	0 %	50 %	0 %	50 %	194444210
61087	NC_011080	ACG	2	6	3323799	3323804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444971
61088	NC_011080	TTG	2	6	3324070	3324075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444971
61089	NC_011080	TCG	2	6	3324128	3324133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444971
61090	NC_011080	GC	3	6	3324162	3324167	0 %	0 %	50 %	50 %	194444971
61091	NC_011080	GCA	2	6	3324222	3324227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444971
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61095	NC_011080	GC	3	6	3324558	3324563	0 %	0 %	50 %	50 %	194444971
61096	NC_011080	CAG	2	6	3324571	3324576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444971
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61100	NC_011080	CTG	2	6	3324754	3324759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444971
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61110	NC_011080	T	6	6	3325336	3325341	0 %	100 %	0 %	0 %	194445505
61111	NC_011080	GCC	2	6	3325365	3325370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445505
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61113	NC_011080	GTT	2	6	3325442	3325447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445505
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61115	NC_011080	TTA	2	6	3325662	3325667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445505
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61233	NC_011080	CCCTT	2	10	3331292	3331301	0 %	40 %	0 %	60 %	194446725
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61346	NC_011080	T	6	6	3337080	3337085	0 %	100 %	0 %	0 %	194442306
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