MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_011080	TCA	2	6	3094994	3094999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443896
57003	NC_011080	GCC	2	6	3095055	3095060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443896
57004	NC_011080	GTTG	2	8	3095090	3095097	0 %	50 %	50 %	0 %	194443896
57005	NC_011080	ATCG	2	8	3095121	3095128	25 %	25 %	25 %	25 %	194443896
57006	NC_011080	GCC	2	6	3095146	3095151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443896
57007	NC_011080	GTT	2	6	3095193	3095198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443896
57008	NC_011080	GTCG	2	8	3095337	3095344	0 %	25 %	50 %	25 %	194443896
57009	NC_011080	TGG	2	6	3095354	3095359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443896
57010	NC_011080	CG	3	6	3095376	3095381	0 %	0 %	50 %	50 %	194443896
57011	NC_011080	TCT	2	6	3095437	3095442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443896
57012	NC_011080	CG	3	6	3095525	3095530	0 %	0 %	50 %	50 %	194443896
57013	NC_011080	CTA	2	6	3095555	3095560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443896
57014	NC_011080	CTT	2	6	3095573	3095578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443896
57015	NC_011080	CGCC	2	8	3095579	3095586	0 %	0 %	25 %	75 %	194443896
57016	NC_011080	CGC	2	6	3095591	3095596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443896
57017	NC_011080	GGCT	2	8	3095716	3095723	0 %	25 %	50 %	25 %	194443896
57018	NC_011080	GCG	2	6	3095735	3095740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443896
57019	NC_011080	CGCTG	2	10	3095789	3095798	0 %	20 %	40 %	40 %	194443896
57020	NC_011080	AGCGA	2	10	3095815	3095824	40 %	0 %	40 %	20 %	194443896
57021	NC_011080	CCGC	2	8	3095926	3095933	0 %	0 %	25 %	75 %	194443896
57022	NC_011080	CGG	2	6	3095960	3095965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443896
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57025	NC_011080	CGC	2	6	3096044	3096049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443896
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57028	NC_011080	GC	3	6	3096125	3096130	0 %	0 %	50 %	50 %	194443896
57029	NC_011080	TCA	2	6	3096140	3096145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443896
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57034	NC_011080	GGC	2	6	3096451	3096456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443156
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57041	NC_011080	T	7	7	3096908	3096914	0 %	100 %	0 %	0 %	194443156
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57117	NC_011080	CTG	2	6	3100966	3100971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443846
57118	NC_011080	GTC	2	6	3100988	3100993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443846
57119	NC_011080	AGA	2	6	3101610	3101615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442559
57120	NC_011080	GGA	2	6	3101763	3101768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442559
57121	NC_011080	GTG	2	6	3101904	3101909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442559
57122	NC_011080	ATA	2	6	3101937	3101942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442559
57123	NC_011080	TTC	2	6	3101972	3101977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442559
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57125	NC_011080	TTC	2	6	3102056	3102061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442559
57126	NC_011080	CGT	2	6	3102110	3102115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442559
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57129	NC_011080	CTG	2	6	3102304	3102309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443165
57130	NC_011080	TTAAT	2	10	3102473	3102482	40 %	60 %	0 %	0 %	194443165
57131	NC_011080	GC	3	6	3102576	3102581	0 %	0 %	50 %	50 %	194443165
57132	NC_011080	GC	3	6	3102584	3102589	0 %	0 %	50 %	50 %	194443165
57133	NC_011080	TGA	2	6	3102621	3102626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443165
57134	NC_011080	TAC	2	6	3102705	3102710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443165
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57136	NC_011080	AGA	2	6	3102750	3102755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443165
57137	NC_011080	CACC	2	8	3102795	3102802	25 %	0 %	0 %	75 %	194443165
57138	NC_011080	CTG	2	6	3102862	3102867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443165
57139	NC_011080	GC	3	6	3102976	3102981	0 %	0 %	50 %	50 %	194443165
57140	NC_011080	CGC	2	6	3102988	3102993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443165
57141	NC_011080	GCA	2	6	3103019	3103024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443165
57142	NC_011080	TGT	2	6	3103218	3103223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445762
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57144	NC_011080	GCT	2	6	3103339	3103344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445762
57145	NC_011080	GCG	2	6	3103389	3103394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445762
57146	NC_011080	TTG	2	6	3103431	3103436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445762
57147	NC_011080	ATT	2	6	3103445	3103450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445762
57148	NC_011080	TGC	2	6	3103479	3103484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445762
57149	NC_011080	TGG	2	6	3103629	3103634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445762
57150	NC_011080	GGC	2	6	3103643	3103648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445762
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57153	NC_011080	ATT	2	6	3103835	3103840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445762
57154	NC_011080	TGAA	2	8	3103866	3103873	50 %	25 %	25 %	0 %	194445762
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57156	NC_011080	ATC	3	9	3103934	3103942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445762
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57201	NC_011080	CAC	2	6	3106183	3106188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446530
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57220	NC_011080	CG	3	6	3107172	3107177	0 %	0 %	50 %	50 %	194443885
57221	NC_011080	GCG	3	9	3107175	3107183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443885
57222	NC_011080	GTCA	2	8	3107199	3107206	25 %	25 %	25 %	25 %	194443885
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57224	NC_011080	GTC	2	6	3107235	3107240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443885
57225	NC_011080	AGT	2	6	3107297	3107302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443885
57226	NC_011080	CGG	2	6	3107338	3107343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443885
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57228	NC_011080	GCT	2	6	3107525	3107530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443885
57229	NC_011080	CGC	2	6	3107558	3107563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443885
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57231	NC_011080	CGC	2	6	3107672	3107677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443885
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57500	NC_011080	TCGT	2	8	3121247	3121254	0 %	50 %	25 %	25 %	194443337

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