MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSL254_3

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011079	GAA	2	6	310	315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442200
2	NC_011079	GC	3	6	372	377	0 %	0 %	50 %	50 %	194442200
3	NC_011079	CATG	2	8	383	390	25 %	25 %	25 %	25 %	194442200
4	NC_011079	CTGG	2	8	416	423	0 %	25 %	50 %	25 %	194442200
5	NC_011079	GGT	2	6	430	435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442200
6	NC_011079	TTG	2	6	436	441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442200
7	NC_011079	A	7	7	539	545	100 %	0 %	0 %	0 %	194442200
8	NC_011079	AAT	2	6	581	586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442200
9	NC_011079	A	7	7	747	753	100 %	0 %	0 %	0 %	194442199
10	NC_011079	GTT	2	6	756	761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442199
11	NC_011079	AG	3	6	809	814	50 %	0 %	50 %	0 %	194442199
12	NC_011079	GAT	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
13	NC_011079	TAA	2	6	1027	1032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442199
14	NC_011079	ATAA	2	8	1191	1198	75 %	25 %	0 %	0 %	194442199
15	NC_011079	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	194442199
16	NC_011079	ATG	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
17	NC_011079	GGGA	2	8	1339	1346	25 %	0 %	75 %	0 %	194442199
18	NC_011079	CGG	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442199
19	NC_011079	TC	3	6	1458	1463	0 %	50 %	0 %	50 %	194442199
20	NC_011079	TGA	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
21	NC_011079	TAC	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442199
22	NC_011079	GCA	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442199
23	NC_011079	TCT	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442199
24	NC_011079	CGAG	2	8	1539	1546	25 %	0 %	50 %	25 %	194442199
25	NC_011079	TGTT	2	8	1558	1565	0 %	75 %	25 %	0 %	194442199
26	NC_011079	TAA	2	6	1652	1657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442199
27	NC_011079	TGA	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
28	NC_011079	GGT	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442199
29	NC_011079	GA	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	194442199
30	NC_011079	AG	3	6	1860	1865	50 %	0 %	50 %	0 %	194442199
31	NC_011079	TGT	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442199
32	NC_011079	AGT	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
33	NC_011079	TA	3	6	1926	1931	50 %	50 %	0 %	0 %	194442199
34	NC_011079	GAAA	2	8	1985	1992	75 %	0 %	25 %	0 %	194442199
35	NC_011079	ATAA	2	8	2022	2029	75 %	25 %	0 %	0 %	194442199
36	NC_011079	A	7	7	2035	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	194442199
37	NC_011079	CCA	2	6	2048	2053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442199
38	NC_011079	ACA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442199
39	NC_011079	AAT	3	9	2115	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442199
40	NC_011079	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442199
41	NC_011079	GAT	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442199
42	NC_011079	TA	3	6	2200	2205	50 %	50 %	0 %	0 %	194442199
43	NC_011079	A	6	6	2229	2234	100 %	0 %	0 %	0 %	194442199
44	NC_011079	T	6	6	2267	2272	0 %	100 %	0 %	0 %	194442199
45	NC_011079	ATG	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442201
46	NC_011079	AAC	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442201
47	NC_011079	GCC	2	6	3304	3309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442201

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.