MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 111918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010943	GC	3	6	136416	136421	0 %	0 %	50 %	50 %	190572207
3002	NC_010943	CATC	2	8	136504	136511	25 %	25 %	0 %	50 %	190572207
3003	NC_010943	CCG	2	6	136536	136541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572207
3004	NC_010943	CTC	2	6	136565	136570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572207
3005	NC_010943	CCA	2	6	136588	136593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572207
3006	NC_010943	GCA	2	6	136600	136605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3007	NC_010943	GAA	2	6	136679	136684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572207
3008	NC_010943	GGT	2	6	136703	136708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572207
3009	NC_010943	CAG	2	6	136745	136750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3010	NC_010943	TGGG	2	8	136765	136772	0 %	25 %	75 %	0 %	190572207
3011	NC_010943	CAGC	2	8	136789	136796	25 %	0 %	25 %	50 %	190572207
3012	NC_010943	GGTG	2	8	136801	136808	0 %	25 %	75 %	0 %	190572207
3013	NC_010943	CTG	2	6	136820	136825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3014	NC_010943	TCC	2	6	136860	136865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572207
3015	NC_010943	AGC	2	6	136866	136871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3016	NC_010943	CGAG	2	8	136948	136955	25 %	0 %	50 %	25 %	190572207
3017	NC_010943	CAG	2	6	136994	136999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3018	NC_010943	GCC	2	6	137006	137011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572207
3019	NC_010943	CAG	2	6	137015	137020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3020	NC_010943	CAG	2	6	137027	137032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3021	NC_010943	CAC	2	6	137057	137062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572207
3022	NC_010943	GCGCG	2	10	137074	137083	0 %	0 %	60 %	40 %	190572207
3023	NC_010943	GCA	2	6	137101	137106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572207
3024	NC_010943	GTT	2	6	137151	137156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572208
3025	NC_010943	TTG	2	6	137215	137220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572208
3026	NC_010943	TTG	2	6	137254	137259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572208
3027	NC_010943	CAG	2	6	137265	137270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572208
3028	NC_010943	GGC	2	6	137276	137281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572208
3029	NC_010943	GTC	2	6	137319	137324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572208
3030	NC_010943	TGG	2	6	137348	137353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572208
3031	NC_010943	GAA	2	6	137376	137381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572208
3032	NC_010943	GTC	2	6	137496	137501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572208
3033	NC_010943	GACGAA	2	12	137502	137513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190572208
3034	NC_010943	GCC	2	6	137514	137519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572208
3035	NC_010943	CGG	2	6	137552	137557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572208
3036	NC_010943	CCA	2	6	137567	137572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572208
3037	NC_010943	CCA	2	6	137630	137635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572208
3038	NC_010943	GC	3	6	137703	137708	0 %	0 %	50 %	50 %	190572208
3039	NC_010943	GCCT	2	8	137778	137785	0 %	25 %	25 %	50 %	190572208
3040	NC_010943	GCC	3	9	137803	137811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572208
3041	NC_010943	AGCGGC	2	12	137814	137825	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190572208
3042	NC_010943	GCAG	2	8	137834	137841	25 %	0 %	50 %	25 %	190572208
3043	NC_010943	CGG	2	6	137903	137908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572209
3044	NC_010943	ATC	3	9	137910	137918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572209
3045	NC_010943	TCA	2	6	137931	137936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572209
3046	NC_010943	TGT	2	6	137971	137976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572209
3047	NC_010943	TTC	2	6	138012	138017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572209
3048	NC_010943	CAG	2	6	138077	138082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572209
3049	NC_010943	CGG	2	6	138160	138165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572209
3050	NC_010943	TCA	2	6	138184	138189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572209
3051	NC_010943	AGT	2	6	138247	138252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572209
3052	NC_010943	GAT	2	6	138278	138283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572209
3053	NC_010943	GCA	2	6	138322	138327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572209
3054	NC_010943	CG	3	6	138367	138372	0 %	0 %	50 %	50 %	190572209
3055	NC_010943	TTG	2	6	138396	138401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572209
3056	NC_010943	CCG	2	6	138402	138407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572209
3057	NC_010943	CTT	2	6	138410	138415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572209
3058	NC_010943	GAA	2	6	138455	138460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572209
3059	NC_010943	TCA	2	6	138463	138468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572209
3060	NC_010943	GGCC	2	8	138481	138488	0 %	0 %	50 %	50 %	190572209
3061	NC_010943	TGG	2	6	138682	138687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572209
3062	NC_010943	CGG	2	6	138757	138762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572209
3063	NC_010943	CACGG	2	10	138778	138787	20 %	0 %	40 %	40 %	190572209
3064	NC_010943	GATC	2	8	138826	138833	25 %	25 %	25 %	25 %	190572209
3065	NC_010943	CAC	2	6	138944	138949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572209
3066	NC_010943	TCG	2	6	138966	138971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572209
3067	NC_010943	CGA	2	6	139039	139044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572209
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3069	NC_010943	CGG	2	6	139108	139113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572209
3070	NC_010943	TCG	2	6	139119	139124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572209
3071	NC_010943	TGGCCT	2	12	139156	139167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572209
3072	NC_010943	TGCG	2	8	139222	139229	0 %	25 %	50 %	25 %	190572210
3073	NC_010943	TGA	2	6	139234	139239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572210
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3075	NC_010943	CCG	2	6	139282	139287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572210
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3079	NC_010943	GCC	2	6	139457	139462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572210
3080	NC_010943	GCT	2	6	139480	139485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572210
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3082	NC_010943	GAAC	2	8	139496	139503	50 %	0 %	25 %	25 %	190572210
3083	NC_010943	GAT	2	6	139511	139516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572210
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3087	NC_010943	TCG	2	6	139749	139754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3088	NC_010943	TCCAGC	2	12	139899	139910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572210
3089	NC_010943	GCCT	2	8	140013	140020	0 %	25 %	25 %	50 %	190572210
3090	NC_010943	GCG	2	6	140025	140030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3091	NC_010943	CTTC	2	8	140038	140045	0 %	50 %	0 %	50 %	190572210
3092	NC_010943	GAA	2	6	140055	140060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572210
3093	NC_010943	ACC	2	6	140088	140093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572210
3094	NC_010943	GCG	3	9	140100	140108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3095	NC_010943	GCG	3	9	140322	140330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3096	NC_010943	CAG	3	9	140339	140347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3097	NC_010943	CGC	3	9	140480	140488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572210
3098	NC_010943	CTG	2	6	140489	140494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3099	NC_010943	TGG	2	6	140530	140535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572210
3100	NC_010943	CAC	2	6	140597	140602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572210
3101	NC_010943	GGCG	2	8	140686	140693	0 %	0 %	75 %	25 %	190572210
3102	NC_010943	CTT	2	6	140720	140725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572210
3103	NC_010943	CGG	2	6	140758	140763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3104	NC_010943	GAA	2	6	140777	140782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572210
3105	NC_010943	GC	3	6	140891	140896	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3106	NC_010943	TGA	2	6	140902	140907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572211
3107	NC_010943	GTG	2	6	140928	140933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572211
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3109	NC_010943	GAA	2	6	140984	140989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572211
3110	NC_010943	GTA	2	6	141113	141118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572211
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3113	NC_010943	TCGA	2	8	141156	141163	25 %	25 %	25 %	25 %	190572211
3114	NC_010943	GCT	2	6	141232	141237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
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3118	NC_010943	TCCAGC	2	12	141567	141578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572211
3119	NC_010943	CG	4	8	141676	141683	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3120	NC_010943	GGCG	2	8	141685	141692	0 %	0 %	75 %	25 %	190572211
3121	NC_010943	GCC	2	6	141743	141748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
3122	NC_010943	CG	3	6	141766	141771	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3123	NC_010943	GCCCAT	2	12	141794	141805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572211
3124	NC_010943	TGGCGG	2	12	141856	141867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190572211
3125	NC_010943	GATG	2	8	141886	141893	25 %	25 %	50 %	0 %	190572211
3126	NC_010943	CAGCG	2	10	141986	141995	20 %	0 %	40 %	40 %	190572211
3127	NC_010943	CAG	3	9	142007	142015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3128	NC_010943	CCGA	2	8	142083	142090	25 %	0 %	25 %	50 %	190572211
3129	NC_010943	CCGG	2	8	142111	142118	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3130	NC_010943	CGC	3	9	142148	142156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
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3132	NC_010943	CGG	2	6	142177	142182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572211
3133	NC_010943	CTG	2	6	142190	142195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
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3137	NC_010943	GGC	2	6	142361	142366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572211
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3154	NC_010943	GCT	2	6	143602	143607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572212
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3243	NC_010943	TTG	2	6	147191	147196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572215
3244	NC_010943	GCA	2	6	147246	147251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572215
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3362	NC_010943	CGA	2	6	151572	151577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572217
3363	NC_010943	CGATCA	2	12	151599	151610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190572217
3364	NC_010943	G	6	6	151611	151616	0 %	0 %	100 %	0 %	190572217
3365	NC_010943	GCTC	2	8	151650	151657	0 %	25 %	25 %	50 %	190572217
3366	NC_010943	TGG	2	6	151796	151801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572218
3367	NC_010943	ACC	2	6	151828	151833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572218
3368	NC_010943	CCAC	2	8	151838	151845	25 %	0 %	0 %	75 %	190572218
3369	NC_010943	GCAGG	2	10	151866	151875	20 %	0 %	60 %	20 %	190572218
3370	NC_010943	CGCCGA	2	12	151887	151898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190572218
3371	NC_010943	CGG	2	6	151930	151935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572218
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3373	NC_010943	TCA	2	6	152021	152026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572218
3374	NC_010943	CGG	2	6	152036	152041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572218
3375	NC_010943	CGA	2	6	152052	152057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572218
3376	NC_010943	GGT	3	9	152088	152096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572218
3377	NC_010943	TGC	2	6	152102	152107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572218
3378	NC_010943	TCG	2	6	152132	152137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572218
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3381	NC_010943	GCT	2	6	152388	152393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572218
3382	NC_010943	CTG	2	6	152477	152482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572219
3383	NC_010943	CCATGC	2	12	152485	152496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572219
3384	NC_010943	GCCGAA	2	12	152555	152566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572219
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3386	NC_010943	AAC	2	6	152591	152596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572219
3387	NC_010943	CTG	2	6	152597	152602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572219
3388	NC_010943	GTGCT	2	10	152612	152621	0 %	40 %	40 %	20 %	190572219
3389	NC_010943	CGGCG	2	10	152625	152634	0 %	0 %	60 %	40 %	190572219
3390	NC_010943	GGC	2	6	152728	152733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572219
3391	NC_010943	TGG	2	6	152736	152741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572219
3392	NC_010943	CCG	2	6	152746	152751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572219
3393	NC_010943	TCG	2	6	152772	152777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572219
3394	NC_010943	TGG	2	6	152802	152807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572219
3395	NC_010943	TGA	2	6	152811	152816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572219
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3398	NC_010943	CG	3	6	152880	152885	0 %	0 %	50 %	50 %	190572219
3399	NC_010943	TCGA	2	8	152891	152898	25 %	25 %	25 %	25 %	190572219
3400	NC_010943	TGG	2	6	152927	152932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572219
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3435	NC_010943	GAC	2	6	154187	154192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572221
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3460	NC_010943	GCA	2	6	154962	154967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572221
3461	NC_010943	ACGC	2	8	155010	155017	25 %	0 %	25 %	50 %	190572221
3462	NC_010943	CGC	2	6	155029	155034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572221
3463	NC_010943	CTG	2	6	155057	155062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572221
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3474	NC_010943	GCCCG	2	10	155446	155455	0 %	0 %	40 %	60 %	190572221
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3480	NC_010943	CGG	2	6	155783	155788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572222
3481	NC_010943	GTG	2	6	155796	155801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572222
3482	NC_010943	GCA	2	6	155818	155823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572222
3483	NC_010943	CGTG	2	8	155891	155898	0 %	25 %	50 %	25 %	190572222
3484	NC_010943	CCGC	2	8	155926	155933	0 %	0 %	25 %	75 %	190572222
3485	NC_010943	GC	3	6	155932	155937	0 %	0 %	50 %	50 %	190572222
3486	NC_010943	GCA	2	6	155950	155955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572222
3487	NC_010943	GCC	2	6	155992	155997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572222
3488	NC_010943	GGT	2	6	156026	156031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572222
3489	NC_010943	C	6	6	156189	156194	0 %	0 %	0 %	100 %	190572223
3490	NC_010943	GGC	2	6	156197	156202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572223
3491	NC_010943	GT	3	6	156210	156215	0 %	50 %	50 %	0 %	190572223
3492	NC_010943	GCT	2	6	156238	156243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572223
3493	NC_010943	CAT	2	6	156253	156258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572223
3494	NC_010943	CCG	2	6	156293	156298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572223
3495	NC_010943	GGCGA	2	10	156317	156326	20 %	0 %	60 %	20 %	190572223
3496	NC_010943	GGT	2	6	156340	156345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572223
3497	NC_010943	TGG	2	6	156350	156355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572223
3498	NC_010943	GGGC	2	8	156358	156365	0 %	0 %	75 %	25 %	190572223
3499	NC_010943	GC	3	6	156402	156407	0 %	0 %	50 %	50 %	190572223
3500	NC_010943	CAGC	2	8	156472	156479	25 %	0 %	25 %	50 %	190572223

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