MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010660	CAG	2	6	107563	107568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734498
1502	NC_010660	TCAA	2	8	107664	107671	50 %	25 %	0 %	25 %	187734498
1503	NC_010660	CTG	2	6	107686	107691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734498
1504	NC_010660	T	6	6	107696	107701	0 %	100 %	0 %	0 %	187734498
1505	NC_010660	TTC	2	6	107717	107722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734498
1506	NC_010660	T	6	6	107732	107737	0 %	100 %	0 %	0 %	187734498
1507	NC_010660	ATTTT	2	10	107790	107799	20 %	80 %	0 %	0 %	187734498
1508	NC_010660	TTTTA	2	10	107807	107816	20 %	80 %	0 %	0 %	187734498
1509	NC_010660	T	6	6	107826	107831	0 %	100 %	0 %	0 %	187734498
1510	NC_010660	TTA	2	6	107835	107840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734498
1511	NC_010660	AGA	2	6	107883	107888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734498
1512	NC_010660	T	7	7	107916	107922	0 %	100 %	0 %	0 %	187734498
1513	NC_010660	AT	3	6	108076	108081	50 %	50 %	0 %	0 %	187734498
1514	NC_010660	AAT	2	6	108150	108155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734498
1515	NC_010660	CAT	2	6	108166	108171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734498
1516	NC_010660	ATA	2	6	108261	108266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734498
1517	NC_010660	TCA	2	6	108326	108331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734515
1518	NC_010660	T	6	6	108431	108436	0 %	100 %	0 %	0 %	187734515
1519	NC_010660	CTG	2	6	108465	108470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734515
1520	NC_010660	TTG	2	6	108472	108477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734515
1521	NC_010660	TA	3	6	108542	108547	50 %	50 %	0 %	0 %	187734515
1522	NC_010660	GAA	2	6	108559	108564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734515
1523	NC_010660	TTC	2	6	108582	108587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734515
1524	NC_010660	TGT	2	6	108591	108596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734515
1525	NC_010660	CATC	2	8	108624	108631	25 %	25 %	0 %	50 %	187734515
1526	NC_010660	ATC	2	6	108634	108639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734515
1527	NC_010660	TTG	2	6	108861	108866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734448
1528	NC_010660	TG	3	6	108926	108931	0 %	50 %	50 %	0 %	187734448
1529	NC_010660	TCA	2	6	109040	109045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734448
1530	NC_010660	T	8	8	109063	109070	0 %	100 %	0 %	0 %	187734448
1531	NC_010660	T	8	8	109088	109095	0 %	100 %	0 %	0 %	187734448
1532	NC_010660	AAC	2	6	109111	109116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734448
1533	NC_010660	CAA	2	6	109193	109198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734448
1534	NC_010660	TTTA	2	8	109255	109262	25 %	75 %	0 %	0 %	187734448
1535	NC_010660	TTC	2	6	109283	109288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734448
1536	NC_010660	GTT	2	6	109299	109304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734448
1537	NC_010660	ATA	2	6	109320	109325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734448
1538	NC_010660	ATG	2	6	109362	109367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734448
1539	NC_010660	TCA	2	6	109511	109516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734307
1540	NC_010660	T	6	6	109528	109533	0 %	100 %	0 %	0 %	187734307
1541	NC_010660	TGA	2	6	109559	109564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734307
1542	NC_010660	AGA	2	6	109585	109590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734307
1543	NC_010660	AGT	2	6	109611	109616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734307
1544	NC_010660	TAA	2	6	109641	109646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734307
1545	NC_010660	GTTCAT	2	12	109662	109673	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187734307
1546	NC_010660	AAG	2	6	109675	109680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734307
1547	NC_010660	TCA	2	6	109700	109705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734307
1548	NC_010660	TTC	2	6	109732	109737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734307
1549	NC_010660	TA	3	6	109838	109843	50 %	50 %	0 %	0 %	187734507
1550	NC_010660	TAA	2	6	109882	109887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734507
1551	NC_010660	TAA	2	6	109937	109942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734507
1552	NC_010660	TCT	2	6	109973	109978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734507
1553	NC_010660	T	6	6	109978	109983	0 %	100 %	0 %	0 %	187734507
1554	NC_010660	TGA	2	6	110067	110072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734507
1555	NC_010660	TCT	2	6	110084	110089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734507
1556	NC_010660	CGT	2	6	110195	110200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734507
1557	NC_010660	CTTT	2	8	110460	110467	0 %	75 %	0 %	25 %	187734507
1558	NC_010660	TGTT	2	8	110487	110494	0 %	75 %	25 %	0 %	187734507
1559	NC_010660	TCA	2	6	110495	110500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734507
1560	NC_010660	TAT	2	6	110541	110546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734507
1561	NC_010660	C	6	6	110583	110588	0 %	0 %	0 %	100 %	187734507
1562	NC_010660	T	8	8	110605	110612	0 %	100 %	0 %	0 %	187734507
1563	NC_010660	A	6	6	110626	110631	100 %	0 %	0 %	0 %	187734507
1564	NC_010660	T	7	7	110634	110640	0 %	100 %	0 %	0 %	187734507
1565	NC_010660	GTT	2	6	110641	110646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734507
1566	NC_010660	TAA	2	6	110668	110673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734507
1567	NC_010660	CCG	2	6	110816	110821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734507
1568	NC_010660	GTA	2	6	110856	110861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734507
1569	NC_010660	T	6	6	110867	110872	0 %	100 %	0 %	0 %	187734507
1570	NC_010660	ATACTG	2	12	110873	110884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187734507
1571	NC_010660	CT	3	6	110975	110980	0 %	50 %	0 %	50 %	187734507
1572	NC_010660	TTGAA	2	10	111025	111034	40 %	40 %	20 %	0 %	187734507
1573	NC_010660	GGC	2	6	111052	111057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734507
1574	NC_010660	GCTA	2	8	111082	111089	25 %	25 %	25 %	25 %	187734507
1575	NC_010660	T	6	6	111137	111142	0 %	100 %	0 %	0 %	187734507
1576	NC_010660	GTT	2	6	111144	111149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734507
1577	NC_010660	TTGC	2	8	111284	111291	0 %	50 %	25 %	25 %	187734507
1578	NC_010660	TTA	2	6	111325	111330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734363
1579	NC_010660	GTG	2	6	111343	111348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734363
1580	NC_010660	AT	3	6	111374	111379	50 %	50 %	0 %	0 %	187734363
1581	NC_010660	AT	3	6	111381	111386	50 %	50 %	0 %	0 %	187734363
1582	NC_010660	TAA	2	6	111392	111397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734363
1583	NC_010660	TA	3	6	111444	111449	50 %	50 %	0 %	0 %	187734363
1584	NC_010660	TCA	2	6	111483	111488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734363
1585	NC_010660	TTTCA	2	10	111666	111675	20 %	60 %	0 %	20 %	187734497
1586	NC_010660	AGA	2	6	111700	111705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734497
1587	NC_010660	GA	4	8	111759	111766	50 %	0 %	50 %	0 %	187734497
1588	NC_010660	TTTG	2	8	111835	111842	0 %	75 %	25 %	0 %	187734497
1589	NC_010660	T	6	6	111861	111866	0 %	100 %	0 %	0 %	187734497
1590	NC_010660	GGT	2	6	111887	111892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734497
1591	NC_010660	ATG	2	6	111914	111919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734497
1592	NC_010660	TAA	2	6	111976	111981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734497
1593	NC_010660	TAA	2	6	111984	111989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734497
1594	NC_010660	TAAAAA	2	12	112018	112029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187734497
1595	NC_010660	ATT	2	6	112065	112070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734497
1596	NC_010660	ATA	2	6	112074	112079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734497
1597	NC_010660	CAA	2	6	112096	112101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734497
1598	NC_010660	ATTA	2	8	112106	112113	50 %	50 %	0 %	0 %	187734497
1599	NC_010660	AT	3	6	112176	112181	50 %	50 %	0 %	0 %	187734497
1600	NC_010660	TGT	2	6	112211	112216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734497
1601	NC_010660	GA	4	8	112225	112232	50 %	0 %	50 %	0 %	187734497
1602	NC_010660	GTG	2	6	112265	112270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734497
1603	NC_010660	T	6	6	112290	112295	0 %	100 %	0 %	0 %	187734497
1604	NC_010660	A	8	8	112334	112341	100 %	0 %	0 %	0 %	187734497
1605	NC_010660	TAA	2	6	112369	112374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734497
1606	NC_010660	GAG	2	6	112379	112384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734497
1607	NC_010660	GCA	2	6	112394	112399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734497
1608	NC_010660	TA	3	6	112401	112406	50 %	50 %	0 %	0 %	187734497
1609	NC_010660	ATT	2	6	112417	112422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734497
1610	NC_010660	CTTCT	2	10	112470	112479	0 %	60 %	0 %	40 %	187734497
1611	NC_010660	GAGAG	2	10	112503	112512	40 %	0 %	60 %	0 %	187734497
1612	NC_010660	G	6	6	112560	112565	0 %	0 %	100 %	0 %	187734497
1613	NC_010660	ATT	2	6	112576	112581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734497
1614	NC_010660	TCT	2	6	112600	112605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734497
1615	NC_010660	AAG	2	6	112608	112613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734497
1616	NC_010660	GTG	2	6	112631	112636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734497
1617	NC_010660	GGA	2	6	112686	112691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734497
1618	NC_010660	TTG	2	6	112727	112732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734497
1619	NC_010660	A	7	7	112788	112794	100 %	0 %	0 %	0 %	187734497
1620	NC_010660	CCA	2	6	112796	112801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734497
1621	NC_010660	ATG	2	6	112809	112814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734497
1622	NC_010660	AT	3	6	112817	112822	50 %	50 %	0 %	0 %	187734497
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1624	NC_010660	A	7	7	112863	112869	100 %	0 %	0 %	0 %	187734497
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1995	NC_010660	TTTA	2	8	128431	128438	25 %	75 %	0 %	0 %	187734451
1996	NC_010660	TTG	3	9	128452	128460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734451
1997	NC_010660	ATG	4	12	128496	128507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734451
1998	NC_010660	TAT	2	6	128542	128547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734451
1999	NC_010660	TTG	2	6	128548	128553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734451
2000	NC_010660	TGGG	2	8	128561	128568	0 %	25 %	75 %	0 %	187734451

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