MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010658	GC	3	6	198871	198876	0 %	0 %	50 %	50 %	187730676
3502	NC_010658	CCG	2	6	198943	198948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730676
3503	NC_010658	TGA	2	6	199002	199007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730676
3504	NC_010658	CTT	2	6	199095	199100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730676
3505	NC_010658	CAT	2	6	199204	199209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730131
3506	NC_010658	GCG	2	6	199266	199271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
3507	NC_010658	CTG	2	6	199289	199294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3508	NC_010658	CGGA	2	8	199313	199320	25 %	0 %	50 %	25 %	187730131
3509	NC_010658	GC	3	6	199339	199344	0 %	0 %	50 %	50 %	187730131
3510	NC_010658	TGG	2	6	199431	199436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730131
3511	NC_010658	CGA	2	6	199558	199563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3512	NC_010658	CTG	2	6	199580	199585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3513	NC_010658	TTGC	2	8	199670	199677	0 %	50 %	25 %	25 %	187730131
3514	NC_010658	G	6	6	199686	199691	0 %	0 %	100 %	0 %	187730131
3515	NC_010658	GAC	2	6	199751	199756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3516	NC_010658	CTGCGC	2	12	199775	199786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187730131
3517	NC_010658	GCA	2	6	199801	199806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3518	NC_010658	AG	3	6	199864	199869	50 %	0 %	50 %	0 %	187730131
3519	NC_010658	CTG	2	6	199883	199888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3520	NC_010658	GAT	2	6	199892	199897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730131
3521	NC_010658	CGC	2	6	199964	199969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730131
3522	NC_010658	GCG	2	6	199970	199975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
3523	NC_010658	GCTG	2	8	199986	199993	0 %	25 %	50 %	25 %	187730131
3524	NC_010658	TGGCGC	2	12	200052	200063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187730131
3525	NC_010658	CCG	2	6	200107	200112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730131
3526	NC_010658	TGG	2	6	200129	200134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730131
3527	NC_010658	CGG	2	6	200205	200210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
3528	NC_010658	GCGT	2	8	200277	200284	0 %	25 %	50 %	25 %	187730131
3529	NC_010658	TGC	2	6	200301	200306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3530	NC_010658	CGG	2	6	200323	200328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
3531	NC_010658	GAA	2	6	200338	200343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730131
3532	NC_010658	GCC	2	6	200365	200370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730131
3533	NC_010658	CTG	2	6	200393	200398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
3534	NC_010658	GCG	2	6	200420	200425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
3535	NC_010658	AAG	2	6	200445	200450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730131
3536	NC_010658	CAC	3	9	200567	200575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731844
3537	NC_010658	CGA	2	6	200647	200652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731844
3538	NC_010658	ATG	2	6	200741	200746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731844
3539	NC_010658	ATC	2	6	200774	200779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731844
3540	NC_010658	ATTG	2	8	200783	200790	25 %	50 %	25 %	0 %	187731844
3541	NC_010658	TCAT	2	8	200802	200809	25 %	50 %	0 %	25 %	187731844
3542	NC_010658	TGC	2	6	200847	200852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731251
3543	NC_010658	CGT	2	6	200879	200884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731251
3544	NC_010658	TTCA	2	8	200895	200902	25 %	50 %	0 %	25 %	187731251
3545	NC_010658	CT	3	6	201242	201247	0 %	50 %	0 %	50 %	187732986
3546	NC_010658	GC	3	6	201255	201260	0 %	0 %	50 %	50 %	187732986
3547	NC_010658	ATG	2	6	201285	201290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732986
3548	NC_010658	CTG	2	6	201297	201302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732986
3549	NC_010658	TGA	2	6	201320	201325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732986
3550	NC_010658	TG	3	6	201349	201354	0 %	50 %	50 %	0 %	187732986
3551	NC_010658	GAT	2	6	201357	201362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732986
3552	NC_010658	GCG	2	6	201434	201439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732986
3553	NC_010658	GCG	2	6	201498	201503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732986
3554	NC_010658	TGG	2	6	201510	201515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732986
3555	NC_010658	TG	3	6	201534	201539	0 %	50 %	50 %	0 %	187732986
3556	NC_010658	AAC	2	6	201577	201582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732986
3557	NC_010658	AAT	2	6	201669	201674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732986
3558	NC_010658	TTAAC	2	10	201682	201691	40 %	40 %	0 %	20 %	187732986
3559	NC_010658	CAA	2	6	201699	201704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732986
3560	NC_010658	GCGG	2	8	201782	201789	0 %	0 %	75 %	25 %	187732441
3561	NC_010658	GCA	2	6	201790	201795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732441
3562	NC_010658	TAA	2	6	201799	201804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732441
3563	NC_010658	CGC	2	6	201880	201885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732441
3564	NC_010658	CAT	2	6	201890	201895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732441
3565	NC_010658	CAG	2	6	201901	201906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732441
3566	NC_010658	TGG	2	6	201981	201986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732441
3567	NC_010658	AAC	2	6	202003	202008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732441
3568	NC_010658	CGA	2	6	202022	202027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732441
3569	NC_010658	A	6	6	202152	202157	100 %	0 %	0 %	0 %	187734266
3570	NC_010658	TAA	2	6	202208	202213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734266
3571	NC_010658	GCG	2	6	202282	202287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734266
3572	NC_010658	TGC	2	6	202288	202293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734266
3573	NC_010658	CT	3	6	202322	202327	0 %	50 %	0 %	50 %	187734266
3574	NC_010658	TGA	2	6	202354	202359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734266
3575	NC_010658	GAA	2	6	202383	202388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734266
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3577	NC_010658	GCG	2	6	202620	202625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734266
3578	NC_010658	GC	3	6	202701	202706	0 %	0 %	50 %	50 %	187734266
3579	NC_010658	CCAA	2	8	202782	202789	50 %	0 %	0 %	50 %	187734266
3580	NC_010658	CGG	2	6	202807	202812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734266
3581	NC_010658	AGT	2	6	202839	202844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734266
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3583	NC_010658	TTG	2	6	203467	203472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733832
3584	NC_010658	T	6	6	203527	203532	0 %	100 %	0 %	0 %	187733832
3585	NC_010658	TTA	2	6	203576	203581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733832
3586	NC_010658	GAG	2	6	203660	203665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733832
3587	NC_010658	ATTG	2	8	203711	203718	25 %	50 %	25 %	0 %	187733832
3588	NC_010658	CTG	2	6	203778	203783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733832
3589	NC_010658	CTGG	2	8	203796	203803	0 %	25 %	50 %	25 %	187733832
3590	NC_010658	AAAG	2	8	203832	203839	75 %	0 %	25 %	0 %	187733832
3591	NC_010658	GGC	2	6	203853	203858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733832
3592	NC_010658	CGA	2	6	203962	203967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3593	NC_010658	TTAA	2	8	203979	203986	50 %	50 %	0 %	0 %	187730943
3594	NC_010658	CGA	2	6	204003	204008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3595	NC_010658	TCG	2	6	204024	204029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3596	NC_010658	CAG	2	6	204125	204130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3597	NC_010658	TCG	2	6	204267	204272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730943
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3599	NC_010658	CAG	2	6	204440	204445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3600	NC_010658	GCCA	2	8	204473	204480	25 %	0 %	25 %	50 %	187730943
3601	NC_010658	AGT	2	6	204541	204546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730943
3602	NC_010658	CAG	2	6	204568	204573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3603	NC_010658	CGC	2	6	204587	204592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730943
3604	NC_010658	ACGGT	2	10	204594	204603	20 %	20 %	40 %	20 %	187730943
3605	NC_010658	CAC	2	6	204608	204613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730943
3606	NC_010658	TCT	2	6	204675	204680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730943
3607	NC_010658	CAG	2	6	204761	204766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3608	NC_010658	GCT	2	6	204782	204787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3609	NC_010658	CAG	2	6	204806	204811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3610	NC_010658	AGC	3	9	204908	204916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3611	NC_010658	GC	3	6	204915	204920	0 %	0 %	50 %	50 %	187730943
3612	NC_010658	GCC	2	6	205040	205045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730943
3613	NC_010658	TCA	2	6	205180	205185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730943
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3617	NC_010658	GCA	2	6	205369	205374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730943
3618	NC_010658	CT	3	6	205404	205409	0 %	50 %	0 %	50 %	187730943
3619	NC_010658	GGCT	2	8	205421	205428	0 %	25 %	50 %	25 %	187730943
3620	NC_010658	ACC	2	6	205431	205436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730943
3621	NC_010658	GTT	2	6	205463	205468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730943
3622	NC_010658	CACG	2	8	205477	205484	25 %	0 %	25 %	50 %	187730943
3623	NC_010658	T	6	6	205496	205501	0 %	100 %	0 %	0 %	187730943
3624	NC_010658	TA	3	6	205531	205536	50 %	50 %	0 %	0 %	187730943
3625	NC_010658	ATC	2	6	205557	205562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730943
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3744	NC_010658	CCG	2	6	218056	218061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731404
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3746	NC_010658	GCC	2	6	218275	218280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731404
3747	NC_010658	TGC	2	6	218300	218305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731404
3748	NC_010658	CGG	2	6	218336	218341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731404
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3774	NC_010658	GCT	2	6	220030	220035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730415
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3985	NC_010658	TTA	2	6	232498	232503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732220
3986	NC_010658	A	6	6	232525	232530	100 %	0 %	0 %	0 %	187732220
3987	NC_010658	CAG	2	6	232686	232691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732220
3988	NC_010658	ACC	2	6	232694	232699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732220
3989	NC_010658	ATA	2	6	232703	232708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732220
3990	NC_010658	GGC	2	6	232765	232770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732220
3991	NC_010658	T	6	6	232808	232813	0 %	100 %	0 %	0 %	187732220
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