MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_010658	TCA	2	6	170727	170732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730763
3003	NC_010658	CTT	2	6	170767	170772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730763
3004	NC_010658	CGA	2	6	170797	170802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730763
3005	NC_010658	GTT	2	6	170891	170896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730763
3006	NC_010658	TTC	2	6	170927	170932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730763
3007	NC_010658	GGC	2	6	171162	171167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730533
3008	NC_010658	CCACG	2	10	171195	171204	20 %	0 %	20 %	60 %	187730533
3009	NC_010658	ACCA	2	8	171283	171290	50 %	0 %	0 %	50 %	187730533
3010	NC_010658	CCG	2	6	171308	171313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730533
3011	NC_010658	TCA	2	6	171347	171352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730533
3012	NC_010658	CTT	2	6	171360	171365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730533
3013	NC_010658	GGT	2	6	171422	171427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730533
3014	NC_010658	ACA	2	6	171510	171515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730533
3015	NC_010658	T	7	7	171557	171563	0 %	100 %	0 %	0 %	187730533
3016	NC_010658	G	6	6	171624	171629	0 %	0 %	100 %	0 %	187730533
3017	NC_010658	ATA	2	6	171672	171677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730533
3018	NC_010658	CGC	2	6	171684	171689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730533
3019	NC_010658	TGC	2	6	171805	171810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730533
3020	NC_010658	A	6	6	171820	171825	100 %	0 %	0 %	0 %	187730533
3021	NC_010658	GCA	2	6	172014	172019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3022	NC_010658	AAC	2	6	172123	172128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730436
3023	NC_010658	CCG	2	6	172137	172142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3024	NC_010658	CTT	2	6	172230	172235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730436
3025	NC_010658	ACT	2	6	172253	172258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730436
3026	NC_010658	ATG	2	6	172292	172297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730436
3027	NC_010658	CGC	2	6	172326	172331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3028	NC_010658	TCA	2	6	172418	172423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730436
3029	NC_010658	CCG	2	6	172494	172499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3030	NC_010658	TGG	2	6	172501	172506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730436
3031	NC_010658	CTT	2	6	172521	172526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730436
3032	NC_010658	TCG	2	6	172541	172546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3033	NC_010658	AG	3	6	172627	172632	50 %	0 %	50 %	0 %	187730436
3034	NC_010658	T	6	6	172642	172647	0 %	100 %	0 %	0 %	187730436
3035	NC_010658	T	6	6	172680	172685	0 %	100 %	0 %	0 %	187730436
3036	NC_010658	CAG	2	6	172711	172716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3037	NC_010658	TGGC	2	8	172761	172768	0 %	25 %	50 %	25 %	187730436
3038	NC_010658	AAT	2	6	172801	172806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730436
3039	NC_010658	CTG	2	6	172816	172821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3040	NC_010658	CTG	2	6	172906	172911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3041	NC_010658	TTA	2	6	172919	172924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731963
3042	NC_010658	TCT	2	6	172961	172966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3043	NC_010658	CTCG	2	8	172968	172975	0 %	25 %	25 %	50 %	187731963
3044	NC_010658	CAG	2	6	173044	173049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3045	NC_010658	CTGG	2	8	173052	173059	0 %	25 %	50 %	25 %	187731963
3046	NC_010658	CGGT	2	8	173090	173097	0 %	25 %	50 %	25 %	187731963
3047	NC_010658	GTG	2	6	173300	173305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3048	NC_010658	CGT	2	6	173316	173321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
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3050	NC_010658	CGG	2	6	173358	173363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731963
3051	NC_010658	TAA	2	6	173464	173469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731963
3052	NC_010658	GCCAG	2	10	173481	173490	20 %	0 %	40 %	40 %	187731963
3053	NC_010658	TCG	2	6	173558	173563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3054	NC_010658	AGT	2	6	173579	173584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731963
3055	NC_010658	CGT	2	6	173648	173653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3056	NC_010658	GCT	2	6	173655	173660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3057	NC_010658	TGG	2	6	173724	173729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3058	NC_010658	CTT	2	6	173787	173792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3059	NC_010658	TGA	2	6	173805	173810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731963
3060	NC_010658	CCAG	2	8	173871	173878	25 %	0 %	25 %	50 %	187731963
3061	NC_010658	CGC	3	9	173961	173969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731963
3062	NC_010658	GCG	2	6	173996	174001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731963
3063	NC_010658	CA	4	8	174043	174050	50 %	0 %	0 %	50 %	187731963
3064	NC_010658	TGGCGC	2	12	174056	174067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187731963
3065	NC_010658	TTC	2	6	174070	174075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3066	NC_010658	CGA	2	6	174162	174167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3067	NC_010658	CGC	2	6	174230	174235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731963
3068	NC_010658	GTT	2	6	174300	174305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731963
3069	NC_010658	GTG	2	6	174341	174346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3070	NC_010658	TCA	2	6	174431	174436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731963
3071	NC_010658	TCG	2	6	174473	174478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3072	NC_010658	TCG	2	6	174494	174499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
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3077	NC_010658	CCGC	2	8	174747	174754	0 %	0 %	25 %	75 %	187731963
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3084	NC_010658	TGG	2	6	175047	175052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3085	NC_010658	AGC	2	6	175136	175141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3086	NC_010658	GC	3	6	175336	175341	0 %	0 %	50 %	50 %	187731963
3087	NC_010658	TCAA	2	8	175343	175350	50 %	25 %	0 %	25 %	187731963
3088	NC_010658	TCA	2	6	175439	175444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731963
3089	NC_010658	TCG	2	6	175593	175598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732897
3090	NC_010658	CAC	2	6	175664	175669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732897
3091	NC_010658	T	6	6	175748	175753	0 %	100 %	0 %	0 %	187732897
3092	NC_010658	ACG	2	6	175803	175808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732897
3093	NC_010658	GCA	2	6	175831	175836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732897
3094	NC_010658	TTC	2	6	175844	175849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732897
3095	NC_010658	ACGA	2	8	175886	175893	50 %	0 %	25 %	25 %	187732897
3096	NC_010658	CGC	2	6	175928	175933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732897
3097	NC_010658	ATG	2	6	176022	176027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732897
3098	NC_010658	CGA	2	6	176038	176043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732897
3099	NC_010658	CAG	2	6	176120	176125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732897
3100	NC_010658	CAC	2	6	176153	176158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732897
3101	NC_010658	AGGC	2	8	176205	176212	25 %	0 %	50 %	25 %	187732897
3102	NC_010658	GTT	2	6	176224	176229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732897
3103	NC_010658	ATC	2	6	176301	176306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732897
3104	NC_010658	T	6	6	176344	176349	0 %	100 %	0 %	0 %	187732897
3105	NC_010658	TCT	2	6	176355	176360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732897
3106	NC_010658	TTGA	2	8	176367	176374	25 %	50 %	25 %	0 %	187732897
3107	NC_010658	CAT	2	6	176867	176872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733810
3108	NC_010658	CTGAA	2	10	176914	176923	40 %	20 %	20 %	20 %	187733810
3109	NC_010658	AAGCG	2	10	176978	176987	40 %	0 %	40 %	20 %	187733810
3110	NC_010658	GCT	2	6	176997	177002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733810
3111	NC_010658	TTC	2	6	177018	177023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733810
3112	NC_010658	GCTG	2	8	177034	177041	0 %	25 %	50 %	25 %	187733810
3113	NC_010658	AAGA	2	8	177141	177148	75 %	0 %	25 %	0 %	187733810
3114	NC_010658	AAG	2	6	177271	177276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733810
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3119	NC_010658	TAA	2	6	177474	177479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733810
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3121	NC_010658	GAGC	2	8	177570	177577	25 %	0 %	50 %	25 %	187732288
3122	NC_010658	GCG	2	6	177593	177598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732288
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3243	NC_010658	TTA	2	6	184553	184558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732347
3244	NC_010658	TTA	2	6	184576	184581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732347
3245	NC_010658	CTG	2	6	184638	184643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732347
3246	NC_010658	CTG	2	6	184722	184727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732347
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3255	NC_010658	TTG	2	6	185349	185354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733865
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3262	NC_010658	CTA	2	6	185488	185493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733865
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3270	NC_010658	TCT	2	6	186270	186275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733865
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3273	NC_010658	GAC	2	6	186506	186511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733865
3274	NC_010658	TAC	2	6	186626	186631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733865
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3353	NC_010658	CG	3	6	191583	191588	0 %	0 %	50 %	50 %	187731145
3354	NC_010658	CGA	2	6	191603	191608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731145
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3357	NC_010658	GGC	2	6	191810	191815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731145
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3360	NC_010658	TGGCC	2	10	192059	192068	0 %	20 %	40 %	40 %	187733784
3361	NC_010658	A	6	6	192086	192091	100 %	0 %	0 %	0 %	187733784
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3487	NC_010658	TGC	2	6	197799	197804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730772
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