MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_010658	CAA	2	6	1130077	1130082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733426
18003	NC_010658	CAGC	2	8	1130114	1130121	25 %	0 %	25 %	50 %	187733426
18004	NC_010658	GCA	2	6	1130724	1130729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733446
18005	NC_010658	ATT	2	6	1130748	1130753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733446
18006	NC_010658	CCA	2	6	1130755	1130760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733446
18007	NC_010658	AAAG	2	8	1130966	1130973	75 %	0 %	25 %	0 %	187731583
18008	NC_010658	TGA	2	6	1130986	1130991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731583
18009	NC_010658	CCG	2	6	1131064	1131069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731583
18010	NC_010658	CGT	2	6	1131089	1131094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731583
18011	NC_010658	GGT	2	6	1131159	1131164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731583
18012	NC_010658	TGA	2	6	1131197	1131202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731583
18013	NC_010658	ATGT	2	8	1131330	1131337	25 %	50 %	25 %	0 %	187731583
18014	NC_010658	TGCG	2	8	1131557	1131564	0 %	25 %	50 %	25 %	187732235
18015	NC_010658	TGG	2	6	1131714	1131719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732235
18016	NC_010658	GCG	2	6	1131863	1131868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732235
18017	NC_010658	TGGC	2	8	1131887	1131894	0 %	25 %	50 %	25 %	187732235
18018	NC_010658	ATTG	2	8	1131922	1131929	25 %	50 %	25 %	0 %	187732235
18019	NC_010658	TTG	2	6	1131945	1131950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732235
18020	NC_010658	GCG	2	6	1131993	1131998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732235
18021	NC_010658	TGT	2	6	1132026	1132031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732235
18022	NC_010658	TAT	2	6	1132115	1132120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732235
18023	NC_010658	CTGC	2	8	1132154	1132161	0 %	25 %	25 %	50 %	187732235
18024	NC_010658	GTC	2	6	1132380	1132385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732061
18025	NC_010658	A	6	6	1132394	1132399	100 %	0 %	0 %	0 %	187732061
18026	NC_010658	GCTG	2	8	1132437	1132444	0 %	25 %	50 %	25 %	187732061
18027	NC_010658	GTCA	2	8	1132543	1132550	25 %	25 %	25 %	25 %	187732061
18028	NC_010658	GC	3	6	1132619	1132624	0 %	0 %	50 %	50 %	187732061
18029	NC_010658	GTC	2	6	1132641	1132646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732061
18030	NC_010658	CG	3	6	1132688	1132693	0 %	0 %	50 %	50 %	187732061
18031	NC_010658	CCA	2	6	1132714	1132719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732061
18032	NC_010658	GAT	2	6	1132862	1132867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732061
18033	NC_010658	CTG	2	6	1132892	1132897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732061
18034	NC_010658	GA	3	6	1132917	1132922	50 %	0 %	50 %	0 %	187732061
18035	NC_010658	CGC	2	6	1132987	1132992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732061
18036	NC_010658	CCA	2	6	1133112	1133117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732061
18037	NC_010658	GGC	2	6	1133155	1133160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732061
18038	NC_010658	GAAAG	2	10	1133170	1133179	60 %	0 %	40 %	0 %	187732061
18039	NC_010658	GAT	2	6	1133194	1133199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732061
18040	NC_010658	GCG	2	6	1133276	1133281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732061
18041	NC_010658	AT	3	6	1133526	1133531	50 %	50 %	0 %	0 %	187731418
18042	NC_010658	ATG	2	6	1133658	1133663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731418
18043	NC_010658	CTG	2	6	1133673	1133678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731418
18044	NC_010658	ACC	2	6	1133779	1133784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731418
18045	NC_010658	TG	3	6	1133822	1133827	0 %	50 %	50 %	0 %	187731418
18046	NC_010658	AAT	2	6	1133893	1133898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731418
18047	NC_010658	CGT	2	6	1134123	1134128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733227
18048	NC_010658	CTG	3	9	1134195	1134203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733227
18049	NC_010658	CAT	2	6	1134257	1134262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733227
18050	NC_010658	CAT	2	6	1134305	1134310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733227
18051	NC_010658	CGC	2	6	1134336	1134341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733227
18052	NC_010658	GCGAA	2	10	1134385	1134394	40 %	0 %	40 %	20 %	187733227
18053	NC_010658	T	6	6	1135170	1135175	0 %	100 %	0 %	0 %	187730509
18054	NC_010658	GTT	2	6	1135191	1135196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730509
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18056	NC_010658	GCAACA	2	12	1135253	1135264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187730509
18057	NC_010658	CGGGG	2	10	1135353	1135362	0 %	0 %	80 %	20 %	187730509
18058	NC_010658	T	6	6	1135377	1135382	0 %	100 %	0 %	0 %	187730509
18059	NC_010658	TGC	2	6	1135473	1135478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730509
18060	NC_010658	TAA	2	6	1135599	1135604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730509
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18063	NC_010658	TGCC	2	8	1135702	1135709	0 %	25 %	25 %	50 %	187730509
18064	NC_010658	TCT	2	6	1135712	1135717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730509
18065	NC_010658	ACG	2	6	1135723	1135728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730509
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18068	NC_010658	ATGCCC	2	12	1135893	1135904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187730509
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18071	NC_010658	CGA	2	6	1136087	1136092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730509
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18084	NC_010658	CCG	2	6	1136919	1136924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730391
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18089	NC_010658	CAGC	2	8	1137890	1137897	25 %	0 %	25 %	50 %	187730869
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18091	NC_010658	TGG	2	6	1138411	1138416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732056
18092	NC_010658	CCCG	2	8	1138457	1138464	0 %	0 %	25 %	75 %	187732056
18093	NC_010658	CGTC	2	8	1138468	1138475	0 %	25 %	25 %	50 %	187732056
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18101	NC_010658	GTTG	2	8	1138953	1138960	0 %	50 %	50 %	0 %	187731563
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18105	NC_010658	CGCT	2	8	1139074	1139081	0 %	25 %	25 %	50 %	187731563
18106	NC_010658	AG	3	6	1139112	1139117	50 %	0 %	50 %	0 %	187731563
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18112	NC_010658	TTC	2	6	1139505	1139510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731563
18113	NC_010658	CTT	2	6	1139513	1139518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731563
18114	NC_010658	CTG	2	6	1139519	1139524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731563
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18234	NC_010658	GAT	2	6	1148658	1148663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732840
18235	NC_010658	TTG	2	6	1148733	1148738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732840
18236	NC_010658	TTG	2	6	1148752	1148757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732840
18237	NC_010658	GCT	2	6	1148775	1148780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732840
18238	NC_010658	GGA	2	6	1148795	1148800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732840
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18240	NC_010658	A	7	7	1148873	1148879	100 %	0 %	0 %	0 %	187732840
18241	NC_010658	T	7	7	1149109	1149115	0 %	100 %	0 %	0 %	187730287
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18249	NC_010658	TTG	2	6	1149784	1149789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730287
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18252	NC_010658	TCTG	2	8	1149896	1149903	0 %	50 %	25 %	25 %	187730624
18253	NC_010658	TG	3	6	1149954	1149959	0 %	50 %	50 %	0 %	187730624
18254	NC_010658	TG	3	6	1150256	1150261	0 %	50 %	50 %	0 %	187732524
18255	NC_010658	TTC	2	6	1150322	1150327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732524
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18262	NC_010658	CCTG	2	8	1151638	1151645	0 %	25 %	25 %	50 %	187733734
18263	NC_010658	A	6	6	1151734	1151739	100 %	0 %	0 %	0 %	187733734
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18351	NC_010658	GTG	2	6	1159793	1159798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732889
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18464	NC_010658	CAG	2	6	1168468	1168473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734157
18465	NC_010658	GGTTCG	2	12	1168497	1168508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187734157
18466	NC_010658	GAT	2	6	1168588	1168593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734157
18467	NC_010658	GCC	2	6	1168620	1168625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734157
18468	NC_010658	TCA	2	6	1168685	1168690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734157
18469	NC_010658	TCTG	2	8	1168699	1168706	0 %	50 %	25 %	25 %	187734157
18470	NC_010658	TAA	2	6	1168730	1168735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734157
18471	NC_010658	T	7	7	1168848	1168854	0 %	100 %	0 %	0 %	187732453
18472	NC_010658	AT	3	6	1168856	1168861	50 %	50 %	0 %	0 %	187732453
18473	NC_010658	GGC	2	6	1168962	1168967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732453
18474	NC_010658	T	6	6	1169092	1169097	0 %	100 %	0 %	0 %	187732453
18475	NC_010658	ATT	2	6	1169104	1169109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732453
18476	NC_010658	GTT	2	6	1169219	1169224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732666
18477	NC_010658	CAG	2	6	1169226	1169231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732666
18478	NC_010658	ACG	2	6	1169253	1169258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732666
18479	NC_010658	TCT	2	6	1169338	1169343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732666
18480	NC_010658	TTC	2	6	1169352	1169357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732666
18481	NC_010658	CAG	2	6	1169618	1169623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731171
18482	NC_010658	TCC	2	6	1169641	1169646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187731171
18483	NC_010658	CATCAG	2	12	1169672	1169683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187731171
18484	NC_010658	CGG	2	6	1170340	1170345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730845
18485	NC_010658	T	6	6	1170483	1170488	0 %	100 %	0 %	0 %	187730845
18486	NC_010658	CTG	2	6	1170491	1170496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730845
18487	NC_010658	CTG	2	6	1170511	1170516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730845
18488	NC_010658	GTC	2	6	1170554	1170559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730845
18489	NC_010658	CTT	2	6	1170591	1170596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730845
18490	NC_010658	ATCCAG	2	12	1170629	1170640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187730845
18491	NC_010658	CTC	2	6	1170745	1170750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730845
18492	NC_010658	GCTGAT	2	12	1171746	1171757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187733981
18493	NC_010658	GGA	2	6	1171784	1171789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733981
18494	NC_010658	CTG	2	6	1171807	1171812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733981
18495	NC_010658	GAA	2	6	1172073	1172078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732431
18496	NC_010658	GAA	2	6	1172085	1172090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732431
18497	NC_010658	CGT	2	6	1172172	1172177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732431
18498	NC_010658	CTG	2	6	1172199	1172204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732431
18499	NC_010658	AAC	2	6	1172206	1172211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732431
18500	NC_010658	TCG	2	6	1172288	1172293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732431

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