MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010658	TGA	2	6	1022440	1022445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733269
16002	NC_010658	AC	3	6	1022543	1022548	50 %	0 %	0 %	50 %	187733038
16003	NC_010658	ACA	2	6	1022557	1022562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733038
16004	NC_010658	CGA	2	6	1022568	1022573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733038
16005	NC_010658	TGG	2	6	1022590	1022595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733038
16006	NC_010658	AGG	2	6	1022642	1022647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733038
16007	NC_010658	ACC	2	6	1022714	1022719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733038
16008	NC_010658	GCT	2	6	1022736	1022741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733038
16009	NC_010658	AAC	2	6	1022747	1022752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733038
16010	NC_010658	CAG	2	6	1022847	1022852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733038
16011	NC_010658	GGC	2	6	1023022	1023027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732465
16012	NC_010658	CTG	2	6	1023065	1023070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732465
16013	NC_010658	CTG	2	6	1023077	1023082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732465
16014	NC_010658	AC	3	6	1023111	1023116	50 %	0 %	0 %	50 %	187732465
16015	NC_010658	AGC	2	6	1023141	1023146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732465
16016	NC_010658	AGGC	2	8	1023153	1023160	25 %	0 %	50 %	25 %	187732465
16017	NC_010658	TG	3	6	1023168	1023173	0 %	50 %	50 %	0 %	187732465
16018	NC_010658	TAA	2	6	1023255	1023260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732465
16019	NC_010658	TCC	2	6	1023273	1023278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187732465
16020	NC_010658	TGA	2	6	1023300	1023305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732465
16021	NC_010658	ATG	2	6	1023364	1023369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732465
16022	NC_010658	CCA	2	6	1024056	1024061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733728
16023	NC_010658	AAC	2	6	1024076	1024081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733728
16024	NC_010658	TCG	2	6	1024282	1024287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733728
16025	NC_010658	A	6	6	1024340	1024345	100 %	0 %	0 %	0 %	187733728
16026	NC_010658	CTG	2	6	1024419	1024424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733728
16027	NC_010658	GGGCAT	2	12	1024470	1024481	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187733728
16028	NC_010658	GAT	2	6	1024490	1024495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733728
16029	NC_010658	TCT	2	6	1024528	1024533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733728
16030	NC_010658	CGT	2	6	1024646	1024651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733728
16031	NC_010658	AGA	2	6	1024657	1024662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733728
16032	NC_010658	GGCA	2	8	1024665	1024672	25 %	0 %	50 %	25 %	187733728
16033	NC_010658	AGG	2	6	1024701	1024706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733728
16034	NC_010658	GTA	2	6	1024733	1024738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733728
16035	NC_010658	TTA	2	6	1024770	1024775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733728
16036	NC_010658	GCA	2	6	1024896	1024901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733728
16037	NC_010658	A	6	6	1024992	1024997	100 %	0 %	0 %	0 %	187733728
16038	NC_010658	CCCCG	2	10	1025012	1025021	0 %	0 %	20 %	80 %	187733728
16039	NC_010658	TTG	2	6	1025109	1025114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733728
16040	NC_010658	TGTC	2	8	1025166	1025173	0 %	50 %	25 %	25 %	187733728
16041	NC_010658	CAA	2	6	1025177	1025182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733728
16042	NC_010658	A	6	6	1025199	1025204	100 %	0 %	0 %	0 %	187733728
16043	NC_010658	ACC	2	6	1025507	1025512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731795
16044	NC_010658	TGC	2	6	1025530	1025535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731795
16045	NC_010658	GAT	2	6	1025578	1025583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731795
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16050	NC_010658	CGA	2	6	1025914	1025919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730171
16051	NC_010658	ACA	2	6	1025944	1025949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730171
16052	NC_010658	TGC	2	6	1025953	1025958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730171
16053	NC_010658	GAA	2	6	1026050	1026055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730171
16054	NC_010658	AT	3	6	1026088	1026093	50 %	50 %	0 %	0 %	187730171
16055	NC_010658	AAT	2	6	1026096	1026101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730171
16056	NC_010658	CTG	2	6	1026335	1026340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730778
16057	NC_010658	CAGT	2	8	1026493	1026500	25 %	25 %	25 %	25 %	187730778
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16060	NC_010658	GGTG	2	8	1026628	1026635	0 %	25 %	75 %	0 %	187730778
16061	NC_010658	CGC	2	6	1026647	1026652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730778
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16082	NC_010658	CG	3	6	1027560	1027565	0 %	0 %	50 %	50 %	187733579
16083	NC_010658	GGT	2	6	1027636	1027641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733579
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16087	NC_010658	CT	3	6	1027750	1027755	0 %	50 %	0 %	50 %	187733579
16088	NC_010658	GCG	2	6	1027756	1027761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733579
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16104	NC_010658	ATT	2	6	1028549	1028554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730678
16105	NC_010658	T	6	6	1028568	1028573	0 %	100 %	0 %	0 %	187730678
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16114	NC_010658	A	6	6	1028938	1028943	100 %	0 %	0 %	0 %	187733544
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16233	NC_010658	TACG	2	8	1035877	1035884	25 %	25 %	25 %	25 %	187731954
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16464	NC_010658	TCA	2	6	1049223	1049228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733235
16465	NC_010658	GCA	2	6	1049244	1049249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733235
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