MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010658	CGC	2	6	873124	873129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731108
14002	NC_010658	GCC	2	6	873132	873137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731108
14003	NC_010658	TCA	2	6	873156	873161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731108
14004	NC_010658	CGG	2	6	873168	873173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731108
14005	NC_010658	T	8	8	873191	873198	0 %	100 %	0 %	0 %	187731108
14006	NC_010658	GCC	2	6	873266	873271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731108
14007	NC_010658	GTT	2	6	873342	873347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731108
14008	NC_010658	AAT	2	6	873397	873402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731108
14009	NC_010658	ATC	2	6	873461	873466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731108
14010	NC_010658	CAC	2	6	873489	873494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731841
14011	NC_010658	GTG	4	12	873500	873511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731841
14012	NC_010658	T	6	6	873534	873539	0 %	100 %	0 %	0 %	187731841
14013	NC_010658	T	6	6	873561	873566	0 %	100 %	0 %	0 %	187731841
14014	NC_010658	T	6	6	873579	873584	0 %	100 %	0 %	0 %	187731841
14015	NC_010658	GT	3	6	873588	873593	0 %	50 %	50 %	0 %	187731841
14016	NC_010658	CCA	2	6	873653	873658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731841
14017	NC_010658	TCC	2	6	873697	873702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187731841
14018	NC_010658	AT	3	6	873703	873708	50 %	50 %	0 %	0 %	187731841
14019	NC_010658	GCC	2	6	873778	873783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731841
14020	NC_010658	TCC	2	6	873802	873807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187731841
14021	NC_010658	T	6	6	873816	873821	0 %	100 %	0 %	0 %	187731841
14022	NC_010658	TCCACC	2	12	873844	873855	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	187731841
14023	NC_010658	CGG	2	6	873947	873952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731841
14024	NC_010658	TGTTT	2	10	873966	873975	0 %	80 %	20 %	0 %	187731841
14025	NC_010658	AAT	2	6	875066	875071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733042
14026	NC_010658	T	7	7	875100	875106	0 %	100 %	0 %	0 %	187733042
14027	NC_010658	TCA	2	6	875168	875173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733042
14028	NC_010658	TA	3	6	875263	875268	50 %	50 %	0 %	0 %	187733042
14029	NC_010658	AGA	2	6	875359	875364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733042
14030	NC_010658	CAA	2	6	875365	875370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733042
14031	NC_010658	AAT	2	6	875371	875376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733042
14032	NC_010658	TTTTCA	2	12	875391	875402	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187733042
14033	NC_010658	GCT	2	6	875780	875785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733622
14034	NC_010658	TCA	2	6	875795	875800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733622
14035	NC_010658	AAT	2	6	875819	875824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733622
14036	NC_010658	CACG	2	8	875891	875898	25 %	0 %	25 %	50 %	187733622
14037	NC_010658	CCAGCT	2	12	876065	876076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187733622
14038	NC_010658	T	6	6	876084	876089	0 %	100 %	0 %	0 %	187733622
14039	NC_010658	GCT	2	6	876095	876100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733622
14040	NC_010658	GAT	2	6	876108	876113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733622
14041	NC_010658	CAC	2	6	876152	876157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733622
14042	NC_010658	CCA	2	6	876161	876166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733622
14043	NC_010658	ATG	2	6	876175	876180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733622
14044	NC_010658	CAC	2	6	876206	876211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734217
14045	NC_010658	CCAGA	2	10	876223	876232	40 %	0 %	20 %	40 %	187734217
14046	NC_010658	CTGG	2	8	876287	876294	0 %	25 %	50 %	25 %	187734217
14047	NC_010658	GC	3	6	876565	876570	0 %	0 %	50 %	50 %	187730788
14048	NC_010658	CGC	2	6	876582	876587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730788
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14050	NC_010658	AT	3	6	876641	876646	50 %	50 %	0 %	0 %	187730788
14051	NC_010658	CGA	2	6	876651	876656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730788
14052	NC_010658	TGT	2	6	876736	876741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730788
14053	NC_010658	GAC	2	6	876881	876886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730788
14054	NC_010658	CCA	2	6	876898	876903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730788
14055	NC_010658	GTG	2	6	876954	876959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730788
14056	NC_010658	CCTT	2	8	876966	876973	0 %	50 %	0 %	50 %	187730788
14057	NC_010658	CAGGCG	2	12	877000	877011	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187730788
14058	NC_010658	AAC	2	6	877356	877361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732457
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14060	NC_010658	CGG	2	6	877425	877430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732457
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14065	NC_010658	A	7	7	877898	877904	100 %	0 %	0 %	0 %	187730366
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14069	NC_010658	TGA	2	6	878035	878040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730366
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14075	NC_010658	GCA	2	6	878772	878777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732867
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14090	NC_010658	CG	3	6	880639	880644	0 %	0 %	50 %	50 %	187732247
14091	NC_010658	CAT	2	6	880682	880687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
14092	NC_010658	GCG	2	6	880699	880704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732247
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14095	NC_010658	ACG	2	6	880787	880792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732247
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14099	NC_010658	TAT	2	6	880960	880965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732247
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14101	NC_010658	TTAA	2	8	881097	881104	50 %	50 %	0 %	0 %	187732045
14102	NC_010658	CGA	2	6	881153	881158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732045
14103	NC_010658	CTG	2	6	881215	881220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
14104	NC_010658	GTG	2	6	881351	881356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732045
14105	NC_010658	ATA	2	6	881383	881388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732045
14106	NC_010658	CTG	2	6	881391	881396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
14107	NC_010658	ACC	2	6	881414	881419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732045
14108	NC_010658	TG	3	6	881481	881486	0 %	50 %	50 %	0 %	187732045
14109	NC_010658	ACG	2	6	881515	881520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732045
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14113	NC_010658	T	6	6	881740	881745	0 %	100 %	0 %	0 %	187732045
14114	NC_010658	CAA	2	6	881832	881837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732045
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14120	NC_010658	TGC	2	6	882099	882104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
14121	NC_010658	ACA	2	6	882125	882130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732045
14122	NC_010658	TCT	2	6	882194	882199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732045
14123	NC_010658	CGAA	2	8	882241	882248	50 %	0 %	25 %	25 %	187732045
14124	NC_010658	GCC	2	6	882312	882317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732045
14125	NC_010658	ATT	2	6	882382	882387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732045
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14158	NC_010658	CGT	2	6	884286	884291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733450
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14225	NC_010658	CAC	2	6	887176	887181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732815
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14227	NC_010658	CAGC	2	8	887287	887294	25 %	0 %	25 %	50 %	187732815
14228	NC_010658	TAA	2	6	888006	888011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730977
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14230	NC_010658	CTG	2	6	888044	888049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730977
14231	NC_010658	TGA	2	6	888088	888093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730977
14232	NC_010658	AT	3	6	888112	888117	50 %	50 %	0 %	0 %	187730977
14233	NC_010658	TGG	2	6	888152	888157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730977
14234	NC_010658	TAA	2	6	888161	888166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730977
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14237	NC_010658	TGA	3	9	888735	888743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730237
14238	NC_010658	CAT	2	6	888763	888768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730237
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