MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_010658	GAAA	2	8	803610	803617	75 %	0 %	25 %	0 %	187732521
13003	NC_010658	TTA	2	6	803624	803629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732521
13004	NC_010658	TC	3	6	803642	803647	0 %	50 %	0 %	50 %	187732521
13005	NC_010658	GCG	2	6	803753	803758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732521
13006	NC_010658	GGT	2	6	803796	803801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732521
13007	NC_010658	CTT	3	9	803838	803846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732521
13008	NC_010658	GCG	2	6	804083	804088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732521
13009	NC_010658	GAA	2	6	804114	804119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732521
13010	NC_010658	CCG	2	6	804128	804133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732521
13011	NC_010658	GCA	2	6	804203	804208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732521
13012	NC_010658	TGTT	2	8	804230	804237	0 %	75 %	25 %	0 %	187732521
13013	NC_010658	TTA	2	6	804290	804295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732521
13014	NC_010658	TAC	3	9	804340	804348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732521
13015	NC_010658	CT	3	6	804358	804363	0 %	50 %	0 %	50 %	187732521
13016	NC_010658	TGA	2	6	804372	804377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732521
13017	NC_010658	CAA	2	6	804471	804476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732521
13018	NC_010658	GCTG	2	8	804609	804616	0 %	25 %	50 %	25 %	187732521
13019	NC_010658	GTGG	2	8	804651	804658	0 %	25 %	75 %	0 %	187732521
13020	NC_010658	TGA	2	6	804731	804736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732521
13021	NC_010658	GC	3	6	804771	804776	0 %	0 %	50 %	50 %	187732521
13022	NC_010658	GCT	2	6	804825	804830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732521
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13024	NC_010658	AGA	2	6	804912	804917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732521
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13029	NC_010658	CGG	2	6	805083	805088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732521
13030	NC_010658	TCT	2	6	805103	805108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732521
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13032	NC_010658	TGG	2	6	805166	805171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732521
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13040	NC_010658	C	7	7	805664	805670	0 %	0 %	0 %	100 %	187730531
13041	NC_010658	CTGG	2	8	805727	805734	0 %	25 %	50 %	25 %	187730531
13042	NC_010658	TGA	2	6	805736	805741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730531
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13052	NC_010658	TCG	2	6	807029	807034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733917
13053	NC_010658	GCT	2	6	807044	807049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733917
13054	NC_010658	CTG	2	6	807145	807150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733917
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13057	NC_010658	CTG	2	6	807233	807238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733917
13058	NC_010658	GA	4	8	807247	807254	50 %	0 %	50 %	0 %	187733917
13059	NC_010658	CTG	2	6	807278	807283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733917
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13112	NC_010658	A	6	6	811464	811469	100 %	0 %	0 %	0 %	187733161
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13118	NC_010658	GCGCC	2	10	812050	812059	0 %	0 %	40 %	60 %	187733161
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13120	NC_010658	GCA	2	6	812085	812090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733161
13121	NC_010658	GAT	2	6	812141	812146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733161
13122	NC_010658	CGA	2	6	812167	812172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733161
13123	NC_010658	CGG	2	6	812185	812190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733161
13124	NC_010658	GCC	2	6	812249	812254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733161
13125	NC_010658	C	6	6	812304	812309	0 %	0 %	0 %	100 %	187733161
13126	NC_010658	CCG	2	6	812328	812333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733161
13127	NC_010658	CGA	2	6	812353	812358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733161
13128	NC_010658	CCG	2	6	812364	812369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733161
13129	NC_010658	GCC	2	6	812375	812380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733161
13130	NC_010658	ATG	2	6	812448	812453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733161
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13132	NC_010658	AAT	2	6	812526	812531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733161
13133	NC_010658	A	7	7	812562	812568	100 %	0 %	0 %	0 %	187733161
13134	NC_010658	CTG	2	6	812576	812581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733161
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13138	NC_010658	A	6	6	813934	813939	100 %	0 %	0 %	0 %	187731311
13139	NC_010658	GAA	2	6	813978	813983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731311
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13142	NC_010658	CTG	2	6	814129	814134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731311
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13144	NC_010658	AT	3	6	814467	814472	50 %	50 %	0 %	0 %	187733561
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13147	NC_010658	TGG	2	6	814591	814596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733561
13148	NC_010658	GTT	2	6	814744	814749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733561
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13151	NC_010658	TGG	2	6	814884	814889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733561
13152	NC_010658	AAT	2	6	814906	814911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733561
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13156	NC_010658	CA	3	6	815008	815013	50 %	0 %	0 %	50 %	187733561
13157	NC_010658	T	6	6	815093	815098	0 %	100 %	0 %	0 %	187733104
13158	NC_010658	CCT	2	6	815119	815124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733104
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13165	NC_010658	AT	3	6	815505	815510	50 %	50 %	0 %	0 %	187733104
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13219	NC_010658	C	6	6	819814	819819	0 %	0 %	0 %	100 %	187733055
13220	NC_010658	AG	3	6	819825	819830	50 %	0 %	50 %	0 %	187733055
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13225	NC_010658	CATT	2	8	819969	819976	25 %	50 %	0 %	25 %	187733055
13226	NC_010658	T	6	6	820060	820065	0 %	100 %	0 %	0 %	187733055
13227	NC_010658	ATC	2	6	820157	820162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733055
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13231	NC_010658	ACT	2	6	820260	820265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733055
13232	NC_010658	TCA	2	6	820397	820402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732605
13233	NC_010658	TGACCG	2	12	820486	820497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187732605
13234	NC_010658	TAT	2	6	820532	820537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732605
13235	NC_010658	GAG	2	6	820594	820599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732605
13236	NC_010658	CCG	2	6	820646	820651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732605
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13238	NC_010658	GCC	2	6	820898	820903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732605
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13241	NC_010658	TGG	2	6	820949	820954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732605
13242	NC_010658	TTCA	2	8	820980	820987	25 %	50 %	0 %	25 %	187732605
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13475	NC_010658	GAC	2	6	833111	833116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733048
13476	NC_010658	CTG	2	6	833172	833177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733048
13477	NC_010658	CAC	2	6	833231	833236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733048
13478	NC_010658	GCC	2	6	833281	833286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733048
13479	NC_010658	CGG	2	6	833347	833352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733048
13480	NC_010658	ACC	2	6	833686	833691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730964
13481	NC_010658	GCT	2	6	833754	833759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730964
13482	NC_010658	CATGG	2	10	833878	833887	20 %	20 %	40 %	20 %	187733678
13483	NC_010658	CTG	2	6	833918	833923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733678
13484	NC_010658	CAGC	2	8	834032	834039	25 %	0 %	25 %	50 %	187733678
13485	NC_010658	TGATC	2	10	834128	834137	20 %	40 %	20 %	20 %	187733678
13486	NC_010658	GTG	2	6	834164	834169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733678
13487	NC_010658	GCC	2	6	834172	834177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733678
13488	NC_010658	CGGG	2	8	834183	834190	0 %	0 %	75 %	25 %	187733678
13489	NC_010658	CGC	2	6	834216	834221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733678
13490	NC_010658	GCC	2	6	834229	834234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733678
13491	NC_010658	GTT	2	6	834236	834241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733678
13492	NC_010658	CTT	2	6	834254	834259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733678
13493	NC_010658	GCT	2	6	834305	834310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733678
13494	NC_010658	GCC	2	6	834316	834321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733678
13495	NC_010658	CGG	2	6	834449	834454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733678
13496	NC_010658	CCT	2	6	834484	834489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733678
13497	NC_010658	ACAG	2	8	834622	834629	50 %	0 %	25 %	25 %	187733678
13498	NC_010658	GC	3	6	834666	834671	0 %	0 %	50 %	50 %	187733678
13499	NC_010658	GCT	2	6	834683	834688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733678
13500	NC_010658	TCA	3	9	834815	834823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733678

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