MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010658	CAT	2	6	681139	681144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730348
11002	NC_010658	CTT	2	6	681157	681162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730348
11003	NC_010658	GCG	2	6	681183	681188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730348
11004	NC_010658	AGC	2	6	681492	681497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11005	NC_010658	CGT	2	6	681504	681509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11006	NC_010658	CGC	2	6	681523	681528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730348
11007	NC_010658	GAT	2	6	681550	681555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730348
11008	NC_010658	CAG	2	6	681563	681568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11009	NC_010658	GGCA	2	8	681590	681597	25 %	0 %	50 %	25 %	187730348
11010	NC_010658	TCA	2	6	681615	681620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730348
11011	NC_010658	GTT	2	6	681736	681741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730348
11012	NC_010658	CTG	2	6	681839	681844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11013	NC_010658	AAT	2	6	681914	681919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730348
11014	NC_010658	TG	3	6	681927	681932	0 %	50 %	50 %	0 %	187730348
11015	NC_010658	TCG	2	6	681985	681990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11016	NC_010658	AAT	2	6	681995	682000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730348
11017	NC_010658	TGG	2	6	682021	682026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730348
11018	NC_010658	GCA	2	6	682051	682056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11019	NC_010658	CAG	2	6	682112	682117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11020	NC_010658	GCA	2	6	682126	682131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11021	NC_010658	CCG	2	6	682183	682188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730348
11022	NC_010658	CGCCAG	2	12	682250	682261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187730348
11023	NC_010658	CAG	3	9	682274	682282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11024	NC_010658	GCA	2	6	682285	682290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11025	NC_010658	GAG	2	6	682371	682376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730348
11026	NC_010658	CTT	2	6	682423	682428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730348
11027	NC_010658	GCCAG	2	10	682597	682606	20 %	0 %	40 %	40 %	187730348
11028	NC_010658	GCG	2	6	682607	682612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730348
11029	NC_010658	ACG	2	6	682670	682675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11030	NC_010658	CAA	2	6	682681	682686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730348
11031	NC_010658	GCG	2	6	682898	682903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730348
11032	NC_010658	TAG	2	6	682917	682922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730348
11033	NC_010658	GGA	2	6	682949	682954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730348
11034	NC_010658	GTC	2	6	682962	682967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730348
11035	NC_010658	TGT	2	6	682975	682980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730348
11036	NC_010658	AAG	2	6	683139	683144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730348
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11038	NC_010658	CTG	2	6	683981	683986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733369
11039	NC_010658	GCA	2	6	683996	684001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733369
11040	NC_010658	GCT	2	6	684005	684010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733369
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11042	NC_010658	CAA	2	6	684031	684036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733369
11043	NC_010658	ACA	2	6	684081	684086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733369
11044	NC_010658	AGA	2	6	684091	684096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733369
11045	NC_010658	ACA	2	6	684207	684212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733369
11046	NC_010658	GTT	2	6	684296	684301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733369
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11051	NC_010658	CAA	2	6	684496	684501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733369
11052	NC_010658	CGG	2	6	684538	684543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733369
11053	NC_010658	TGC	2	6	684580	684585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733369
11054	NC_010658	TGA	2	6	684607	684612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733369
11055	NC_010658	TGG	2	6	684688	684693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733369
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11058	NC_010658	GCT	2	6	684725	684730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733369
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11060	NC_010658	TCA	2	6	684882	684887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733369
11061	NC_010658	ACG	3	9	684900	684908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733369
11062	NC_010658	ATGTTG	2	12	684924	684935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187733369
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11065	NC_010658	CTG	2	6	684992	684997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733369
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11067	NC_010658	CTG	2	6	685214	685219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730105
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11069	NC_010658	GTTG	2	8	685238	685245	0 %	50 %	50 %	0 %	187730105
11070	NC_010658	AAAGA	2	10	685370	685379	80 %	0 %	20 %	0 %	187730105
11071	NC_010658	CGA	2	6	685399	685404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730105
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11077	NC_010658	GCG	2	6	685757	685762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730105
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11084	NC_010658	A	7	7	686232	686238	100 %	0 %	0 %	0 %	187730105
11085	NC_010658	CAC	2	6	686411	686416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732139
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11090	NC_010658	GC	3	6	686720	686725	0 %	0 %	50 %	50 %	187732139
11091	NC_010658	GAC	2	6	686765	686770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732139
11092	NC_010658	CAG	3	9	686798	686806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732139
11093	NC_010658	TAC	2	6	686808	686813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732139
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11095	NC_010658	TGG	2	6	686920	686925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732139
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11100	NC_010658	CGC	2	6	687088	687093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732139
11101	NC_010658	CAA	2	6	687132	687137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732139
11102	NC_010658	GGCA	2	8	687142	687149	25 %	0 %	50 %	25 %	187732139
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11106	NC_010658	CGC	2	6	687351	687356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732139
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11110	NC_010658	GAC	2	6	687586	687591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731684
11111	NC_010658	CAAA	2	8	687629	687636	75 %	0 %	0 %	25 %	187731684
11112	NC_010658	CGG	3	9	687693	687701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731684
11113	NC_010658	CCAG	2	8	687715	687722	25 %	0 %	25 %	50 %	187731684
11114	NC_010658	GC	4	8	687796	687803	0 %	0 %	50 %	50 %	187731684
11115	NC_010658	TGTTTC	2	12	687808	687819	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	187731684
11116	NC_010658	TGG	2	6	687847	687852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731684
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11118	NC_010658	TGG	2	6	687903	687908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731684
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11223	NC_010658	ATCG	2	8	693825	693832	25 %	25 %	25 %	25 %	187732303
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11231	NC_010658	CTAC	2	8	694130	694137	25 %	25 %	0 %	50 %	187732303
11232	NC_010658	CAT	2	6	694170	694175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732303
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11357	NC_010658	GTG	2	6	700334	700339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732266
11358	NC_010658	ATT	2	6	700349	700354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732266
11359	NC_010658	GTG	2	6	700369	700374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732266
11360	NC_010658	GCA	2	6	700405	700410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732266
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11362	NC_010658	ACGCTG	2	12	700478	700489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187732266
11363	NC_010658	CCGT	2	8	700528	700535	0 %	25 %	25 %	50 %	187732266
11364	NC_010658	GTGA	2	8	700538	700545	25 %	25 %	50 %	0 %	187732266
11365	NC_010658	GAAT	2	8	700593	700600	50 %	25 %	25 %	0 %	187733911
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11367	NC_010658	CTGG	2	8	700632	700639	0 %	25 %	50 %	25 %	187733911
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11463	NC_010658	A	7	7	704392	704398	100 %	0 %	0 %	0 %	187730638
11464	NC_010658	GCA	2	6	704517	704522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730638
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11472	NC_010658	TAAA	2	8	704792	704799	75 %	25 %	0 %	0 %	187730638
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11474	NC_010658	TGG	2	6	704865	704870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730582
11475	NC_010658	GCA	2	6	704901	704906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730582
11476	NC_010658	TCT	2	6	705035	705040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730582
11477	NC_010658	TCACGT	2	12	705056	705067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187730582
11478	NC_010658	TGC	2	6	705099	705104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730582
11479	NC_010658	ATA	2	6	705227	705232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730582
11480	NC_010658	GATC	2	8	705342	705349	25 %	25 %	25 %	25 %	187730582
11481	NC_010658	GAT	2	6	705435	705440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730582
11482	NC_010658	ATC	2	6	705449	705454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730582
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11486	NC_010658	GCCA	2	8	705867	705874	25 %	0 %	25 %	50 %	187731658
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11499	NC_010658	ATG	2	6	707519	707524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733636
11500	NC_010658	TCA	2	6	707543	707548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733636

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