MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010658	CGG	2	6	611687	611692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
10002	NC_010658	GGC	2	6	611699	611704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
10003	NC_010658	GCG	3	9	611712	611720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
10004	NC_010658	CAG	2	6	611760	611765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734213
10005	NC_010658	ACCAC	2	10	611776	611785	40 %	0 %	0 %	60 %	187734213
10006	NC_010658	GAA	2	6	611819	611824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734213
10007	NC_010658	GGT	2	6	611837	611842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734213
10008	NC_010658	CCA	2	6	611941	611946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734213
10009	NC_010658	GTG	2	6	612082	612087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734213
10010	NC_010658	CTG	2	6	612099	612104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734213
10011	NC_010658	AACA	2	8	612105	612112	75 %	0 %	0 %	25 %	187734213
10012	NC_010658	TGG	2	6	612172	612177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734213
10013	NC_010658	CAT	2	6	612185	612190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734213
10014	NC_010658	GAAACT	2	12	612242	612253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187734213
10015	NC_010658	ACC	2	6	612256	612261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734213
10016	NC_010658	AAG	2	6	612268	612273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734213
10017	NC_010658	ATG	2	6	612375	612380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734213
10018	NC_010658	GTT	2	6	612444	612449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734213
10019	NC_010658	GGC	2	6	612510	612515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
10020	NC_010658	GCT	2	6	612521	612526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734213
10021	NC_010658	TGG	2	6	612532	612537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734213
10022	NC_010658	TCTGCA	2	12	612557	612568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187734213
10023	NC_010658	AAT	2	6	612654	612659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734213
10024	NC_010658	GCA	2	6	612710	612715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734213
10025	NC_010658	GC	3	6	612922	612927	0 %	0 %	50 %	50 %	187734213
10026	NC_010658	TGA	3	9	612953	612961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734213
10027	NC_010658	CCG	2	6	613053	613058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734213
10028	NC_010658	TACT	2	8	613067	613074	25 %	50 %	0 %	25 %	187734213
10029	NC_010658	TGA	2	6	613133	613138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732898
10030	NC_010658	GAA	2	6	613173	613178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732898
10031	NC_010658	ATG	2	6	613188	613193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732898
10032	NC_010658	CTG	2	6	613194	613199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732898
10033	NC_010658	GAAAGA	2	12	613217	613228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732898
10034	NC_010658	CCG	2	6	613244	613249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732898
10035	NC_010658	GT	3	6	613264	613269	0 %	50 %	50 %	0 %	187732898
10036	NC_010658	AAG	2	6	613350	613355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732898
10037	NC_010658	TGG	2	6	613399	613404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732898
10038	NC_010658	AAT	2	6	613458	613463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732898
10039	NC_010658	AGC	2	6	613504	613509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732898
10040	NC_010658	TGT	2	6	613551	613556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732898
10041	NC_010658	TGG	2	6	613578	613583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732898
10042	NC_010658	GCC	2	6	613666	613671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732898
10043	NC_010658	CAT	2	6	613715	613720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732898
10044	NC_010658	CG	3	6	613759	613764	0 %	0 %	50 %	50 %	187732898
10045	NC_010658	TGT	2	6	613786	613791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732898
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10049	NC_010658	CT	3	6	614151	614156	0 %	50 %	0 %	50 %	187731274
10050	NC_010658	CTT	2	6	614195	614200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731274
10051	NC_010658	CAG	2	6	614244	614249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731274
10052	NC_010658	CCG	2	6	614306	614311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731274
10053	NC_010658	GCA	2	6	614453	614458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731274
10054	NC_010658	GCT	2	6	614573	614578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
10055	NC_010658	GAA	2	6	614643	614648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731274
10056	NC_010658	CG	3	6	614682	614687	0 %	0 %	50 %	50 %	187731274
10057	NC_010658	A	6	6	614706	614711	100 %	0 %	0 %	0 %	187731274
10058	NC_010658	CTT	2	6	614714	614719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731274
10059	NC_010658	CCG	2	6	614731	614736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731274
10060	NC_010658	GAT	2	6	614831	614836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731274
10061	NC_010658	GTC	2	6	614893	614898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
10062	NC_010658	A	6	6	614925	614930	100 %	0 %	0 %	0 %	187731274
10063	NC_010658	CGA	2	6	614945	614950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10065	NC_010658	CTGGCG	2	12	615048	615059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187731274
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10068	NC_010658	TGC	2	6	615154	615159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10070	NC_010658	CGGTA	2	10	615251	615260	20 %	20 %	40 %	20 %	187731274
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10083	NC_010658	TGC	2	6	616258	616263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10085	NC_010658	CG	3	6	616301	616306	0 %	0 %	50 %	50 %	187731274
10086	NC_010658	TGC	2	6	616387	616392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
10087	NC_010658	GTC	2	6	616393	616398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10089	NC_010658	CTG	2	6	616449	616454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10092	NC_010658	CGA	2	6	616526	616531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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10100	NC_010658	CAA	2	6	616872	616877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731274
10101	NC_010658	AATA	2	8	616906	616913	75 %	25 %	0 %	0 %	187731274
10102	NC_010658	CCTG	2	8	616954	616961	0 %	25 %	25 %	50 %	187730708
10103	NC_010658	A	6	6	616997	617002	100 %	0 %	0 %	0 %	187730708
10104	NC_010658	TGA	2	6	617023	617028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730708
10105	NC_010658	CAG	2	6	617079	617084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730708
10106	NC_010658	CAG	2	6	617228	617233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730708
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10108	NC_010658	GCTG	2	8	617287	617294	0 %	25 %	50 %	25 %	187730708
10109	NC_010658	GTGG	2	8	617333	617340	0 %	25 %	75 %	0 %	187730708
10110	NC_010658	GCT	2	6	617411	617416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730708
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10357	NC_010658	GAA	2	6	631464	631469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732995
10358	NC_010658	GAA	2	6	631557	631562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732995
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10476	NC_010658	TGA	2	6	637977	637982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731340
10477	NC_010658	TGT	2	6	638007	638012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731340
10478	NC_010658	ATT	2	6	638018	638023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731340
10479	NC_010658	CGT	2	6	638035	638040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731340
10480	NC_010658	CAT	2	6	638083	638088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731340
10481	NC_010658	GC	3	6	638154	638159	0 %	0 %	50 %	50 %	187731340
10482	NC_010658	TGA	2	6	638174	638179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732863
10483	NC_010658	TTCA	2	8	638200	638207	25 %	50 %	0 %	25 %	187732863
10484	NC_010658	TGG	2	6	638250	638255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732863
10485	NC_010658	CAA	2	6	638302	638307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732863
10486	NC_010658	ATCGTG	2	12	638311	638322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732863
10487	NC_010658	TCA	2	6	638349	638354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732863
10488	NC_010658	CCAT	2	8	638370	638377	25 %	25 %	0 %	50 %	187732863
10489	NC_010658	ACG	2	6	638425	638430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732863
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10491	NC_010658	ATTC	2	8	638475	638482	25 %	50 %	0 %	25 %	187732863
10492	NC_010658	GA	3	6	638540	638545	50 %	0 %	50 %	0 %	187732863
10493	NC_010658	CAG	2	6	638553	638558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732863
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10499	NC_010658	CAT	3	9	638734	638742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732863
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