MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010658	CAC	2	6	520699	520704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732087
8502	NC_010658	CAA	2	6	520773	520778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732087
8503	NC_010658	CAGC	2	8	520810	520817	25 %	0 %	25 %	50 %	187732087
8504	NC_010658	TGT	2	6	522267	522272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733462
8505	NC_010658	TCAGAT	2	12	522274	522285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187733462
8506	NC_010658	GCCA	2	8	522361	522368	25 %	0 %	25 %	50 %	187733462
8507	NC_010658	CAG	2	6	522401	522406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733462
8508	NC_010658	AGA	2	6	522411	522416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733462
8509	NC_010658	TCC	2	6	522466	522471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733462
8510	NC_010658	CAGC	2	8	522494	522501	25 %	0 %	25 %	50 %	187733462
8511	NC_010658	ATCAC	2	10	522558	522567	40 %	20 %	0 %	40 %	187733462
8512	NC_010658	T	6	6	522608	522613	0 %	100 %	0 %	0 %	187733462
8513	NC_010658	CAC	2	6	522811	522816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734161
8514	NC_010658	AGGA	2	8	522834	522841	50 %	0 %	50 %	0 %	187734161
8515	NC_010658	ATGGAA	2	12	522848	522859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734161
8516	NC_010658	GCA	2	6	522909	522914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8517	NC_010658	GTT	2	6	522997	523002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732488
8518	NC_010658	TGA	2	6	523025	523030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732488
8519	NC_010658	AAAC	2	8	523031	523038	75 %	0 %	0 %	25 %	187732488
8520	NC_010658	TCA	2	6	523045	523050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732488
8521	NC_010658	ACA	2	6	523056	523061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732488
8522	NC_010658	C	6	6	523137	523142	0 %	0 %	0 %	100 %	187732488
8523	NC_010658	AT	3	6	523167	523172	50 %	50 %	0 %	0 %	187732488
8524	NC_010658	ATA	2	6	523190	523195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732488
8525	NC_010658	CTC	2	6	523223	523228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187732488
8526	NC_010658	CTG	2	6	523235	523240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8527	NC_010658	GCT	2	6	523258	523263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8528	NC_010658	TTCA	2	8	523283	523290	25 %	50 %	0 %	25 %	187732488
8529	NC_010658	GCCA	2	8	523461	523468	25 %	0 %	25 %	50 %	187732488
8530	NC_010658	GCG	2	6	523469	523474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8531	NC_010658	CTCA	2	8	523481	523488	25 %	25 %	0 %	50 %	187732488
8532	NC_010658	CGG	2	6	523541	523546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8533	NC_010658	CGC	2	6	523570	523575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732488
8534	NC_010658	CTG	2	6	523580	523585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8535	NC_010658	GCG	2	6	523604	523609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8536	NC_010658	TGA	2	6	523648	523653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732488
8537	NC_010658	CGC	2	6	523797	523802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732488
8538	NC_010658	GGTG	2	8	523924	523931	0 %	25 %	75 %	0 %	187732488
8539	NC_010658	TCA	2	6	523935	523940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732488
8540	NC_010658	GGT	2	6	524147	524152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8541	NC_010658	GGT	2	6	524174	524179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8542	NC_010658	GCTGTA	2	12	524180	524191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732488
8543	NC_010658	GCT	2	6	524210	524215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8544	NC_010658	GCG	2	6	524339	524344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8545	NC_010658	CCA	2	6	524380	524385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732488
8546	NC_010658	GT	3	6	524389	524394	0 %	50 %	50 %	0 %	187732488
8547	NC_010658	TGCC	2	8	524407	524414	0 %	25 %	25 %	50 %	187732488
8548	NC_010658	GCCA	2	8	524433	524440	25 %	0 %	25 %	50 %	187732488
8549	NC_010658	CGG	2	6	524446	524451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8550	NC_010658	TGC	2	6	524514	524519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8551	NC_010658	TCA	2	6	524583	524588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732488
8552	NC_010658	TGTC	2	8	524635	524642	0 %	50 %	25 %	25 %	187732488
8553	NC_010658	AGCC	2	8	524643	524650	25 %	0 %	25 %	50 %	187732488
8554	NC_010658	CGGTG	2	10	524692	524701	0 %	20 %	60 %	20 %	187732488
8555	NC_010658	GTG	2	6	524783	524788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8556	NC_010658	TG	3	6	524796	524801	0 %	50 %	50 %	0 %	187732488
8557	NC_010658	GGT	2	6	524855	524860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8558	NC_010658	GCA	2	6	524901	524906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8559	NC_010658	CTG	2	6	524985	524990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8560	NC_010658	CGG	2	6	525007	525012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8561	NC_010658	CGG	2	6	525022	525027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8562	NC_010658	CCG	2	6	525133	525138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732488
8563	NC_010658	GGTCAT	2	12	525154	525165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732488
8564	NC_010658	TG	3	6	525277	525282	0 %	50 %	50 %	0 %	187732488
8565	NC_010658	GAT	2	6	525302	525307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732488
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8567	NC_010658	TGG	2	6	525408	525413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8568	NC_010658	GTG	2	6	525447	525452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732488
8569	NC_010658	TGA	2	6	525460	525465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732488
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8571	NC_010658	TGT	2	6	525494	525499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732488
8572	NC_010658	CAC	2	6	525587	525592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732488
8573	NC_010658	GCA	2	6	525622	525627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732488
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8575	NC_010658	GGTGAT	2	12	525650	525661	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187732488
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8577	NC_010658	GTAACG	2	12	525737	525748	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187732488
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8579	NC_010658	CCA	2	6	525778	525783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732488
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8581	NC_010658	GTAA	2	8	525806	525813	50 %	25 %	25 %	0 %	187732488
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8585	NC_010658	GCG	2	6	525889	525894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8586	NC_010658	CAGA	2	8	525943	525950	50 %	0 %	25 %	25 %	187732488
8587	NC_010658	CCG	2	6	526020	526025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732488
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8591	NC_010658	CGG	2	6	526138	526143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
8592	NC_010658	TG	3	6	526161	526166	0 %	50 %	50 %	0 %	187732488
8593	NC_010658	CCA	2	6	526180	526185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732488
8594	NC_010658	CGG	2	6	526205	526210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732488
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8602	NC_010658	GT	3	6	526489	526494	0 %	50 %	50 %	0 %	187732488
8603	NC_010658	CTG	2	6	526581	526586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732488
8604	NC_010658	CGGGC	2	10	526613	526622	0 %	0 %	60 %	40 %	187732488
8605	NC_010658	TCCA	2	8	527093	527100	25 %	25 %	0 %	50 %	187731204
8606	NC_010658	T	7	7	527486	527492	0 %	100 %	0 %	0 %	187733155
8607	NC_010658	CCCG	2	8	527497	527504	0 %	0 %	25 %	75 %	187733155
8608	NC_010658	TTA	2	6	527617	527622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733155
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8613	NC_010658	GCC	2	6	528087	528092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734056
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8985	NC_010658	TCT	2	6	548795	548800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730563
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