MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010658	TCT	2	6	330134	330139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733566
5502	NC_010658	ATT	2	6	330142	330147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733566
5503	NC_010658	GGC	2	6	330165	330170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733566
5504	NC_010658	GCC	2	6	330300	330305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733566
5505	NC_010658	ACT	2	6	330358	330363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733566
5506	NC_010658	CGC	2	6	330388	330393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733566
5507	NC_010658	GGCA	2	8	330406	330413	25 %	0 %	50 %	25 %	187733566
5508	NC_010658	TC	3	6	330443	330448	0 %	50 %	0 %	50 %	187733566
5509	NC_010658	GCG	2	6	330496	330501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733566
5510	NC_010658	TGC	2	6	330520	330525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733566
5511	NC_010658	GCGCT	2	10	330567	330576	0 %	20 %	40 %	40 %	187733566
5512	NC_010658	CT	3	6	330582	330587	0 %	50 %	0 %	50 %	187733566
5513	NC_010658	CCG	2	6	330697	330702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733566
5514	NC_010658	TGA	2	6	330914	330919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730102
5515	NC_010658	TGG	2	6	330947	330952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730102
5516	NC_010658	TCA	2	6	330987	330992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730102
5517	NC_010658	GCA	2	6	331025	331030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730102
5518	NC_010658	GCC	2	6	331102	331107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730102
5519	NC_010658	GGC	2	6	331180	331185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730102
5520	NC_010658	GAT	2	6	331201	331206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730102
5521	NC_010658	TCA	2	6	331251	331256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730102
5522	NC_010658	CTA	2	6	331346	331351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730569
5523	NC_010658	TCA	2	6	331429	331434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730569
5524	NC_010658	TTC	2	6	331440	331445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730569
5525	NC_010658	CAA	2	6	331488	331493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730569
5526	NC_010658	TTC	2	6	331530	331535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730569
5527	NC_010658	CTTT	2	8	331582	331589	0 %	75 %	0 %	25 %	187730569
5528	NC_010658	TCA	2	6	331609	331614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730569
5529	NC_010658	CCT	2	6	331697	331702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730569
5530	NC_010658	GCA	2	6	331715	331720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5531	NC_010658	CTT	2	6	331730	331735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730569
5532	NC_010658	TGA	2	6	331836	331841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730569
5533	NC_010658	CGT	2	6	331877	331882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5534	NC_010658	GTC	2	6	331977	331982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5535	NC_010658	TGG	2	6	332048	332053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730569
5536	NC_010658	ACG	2	6	332070	332075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5537	NC_010658	GCT	2	6	332112	332117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5538	NC_010658	GCC	2	6	332157	332162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730569
5539	NC_010658	GCT	2	6	332190	332195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5540	NC_010658	CT	3	6	332194	332199	0 %	50 %	0 %	50 %	187730569
5541	NC_010658	TGC	2	6	332309	332314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730569
5542	NC_010658	GCCA	2	8	332368	332375	25 %	0 %	25 %	50 %	187732272
5543	NC_010658	CGG	2	6	332399	332404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732272
5544	NC_010658	GC	3	6	332422	332427	0 %	0 %	50 %	50 %	187732272
5545	NC_010658	TTC	2	6	332430	332435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732272
5546	NC_010658	CAGG	2	8	332462	332469	25 %	0 %	50 %	25 %	187732272
5547	NC_010658	CTGC	2	8	332527	332534	0 %	25 %	25 %	50 %	187732272
5548	NC_010658	TCT	2	6	332554	332559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732272
5549	NC_010658	GGC	2	6	332583	332588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732272
5550	NC_010658	TCA	2	6	332608	332613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732272
5551	NC_010658	CGC	2	6	332670	332675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732272
5552	NC_010658	ACG	2	6	332721	332726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732272
5553	NC_010658	GCG	2	6	332762	332767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732272
5554	NC_010658	AG	3	6	332913	332918	50 %	0 %	50 %	0 %	187732272
5555	NC_010658	CAA	2	6	332954	332959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732272
5556	NC_010658	CG	3	6	332964	332969	0 %	0 %	50 %	50 %	187732272
5557	NC_010658	GCA	2	6	333014	333019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732272
5558	NC_010658	CCA	2	6	333076	333081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732272
5559	NC_010658	CGG	2	6	333092	333097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732272
5560	NC_010658	CGC	2	6	333225	333230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732272
5561	NC_010658	CCG	2	6	333277	333282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732272
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5564	NC_010658	TTC	2	6	333424	333429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732272
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5569	NC_010658	T	6	6	333585	333590	0 %	100 %	0 %	0 %	187732272
5570	NC_010658	AGC	2	6	333628	333633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732272
5571	NC_010658	GTT	2	6	333645	333650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732272
5572	NC_010658	GC	3	6	333653	333658	0 %	0 %	50 %	50 %	187732272
5573	NC_010658	TCGTTG	2	12	333682	333693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187732272
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5576	NC_010658	GCA	2	6	333817	333822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732272
5577	NC_010658	TGA	2	6	333855	333860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732272
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5579	NC_010658	GCC	2	6	333918	333923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732272
5580	NC_010658	GCG	2	6	334116	334121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732272
5581	NC_010658	TCG	2	6	334126	334131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732272
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5583	NC_010658	TCA	2	6	334223	334228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732272
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5587	NC_010658	TCG	2	6	334345	334350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730884
5588	NC_010658	TTC	2	6	334366	334371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730884
5589	NC_010658	GGTA	2	8	334400	334407	25 %	25 %	50 %	0 %	187730884
5590	NC_010658	AAGGC	2	10	334495	334504	40 %	0 %	40 %	20 %	187730884
5591	NC_010658	CT	3	6	334510	334515	0 %	50 %	0 %	50 %	187730884
5592	NC_010658	ACG	2	6	334542	334547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730884
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5594	NC_010658	ACC	2	6	334680	334685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730884
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5597	NC_010658	ATC	2	6	334896	334901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730884
5598	NC_010658	CGG	2	6	334934	334939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730884
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5600	NC_010658	TAA	2	6	335025	335030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730884
5601	NC_010658	TGC	2	6	335134	335139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730884
5602	NC_010658	AG	3	6	335178	335183	50 %	0 %	50 %	0 %	187732404
5603	NC_010658	CAG	2	6	335201	335206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732404
5604	NC_010658	TTG	2	6	335228	335233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732404
5605	NC_010658	CGC	2	6	335266	335271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732404
5606	NC_010658	GCTC	2	8	335341	335348	0 %	25 %	25 %	50 %	187732404
5607	NC_010658	TTC	2	6	335382	335387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732404
5608	NC_010658	GCT	2	6	335540	335545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734263
5609	NC_010658	GCC	2	6	335592	335597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734263
5610	NC_010658	TGCGCT	2	12	335650	335661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731644
5611	NC_010658	ATG	2	6	335707	335712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731644
5612	NC_010658	CGCT	2	8	335716	335723	0 %	25 %	25 %	50 %	187731644
5613	NC_010658	GTC	2	6	335724	335729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731644
5614	NC_010658	CCA	2	6	335816	335821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731644
5615	NC_010658	TCGAAG	2	12	335827	335838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187731644
5616	NC_010658	CGG	3	9	335981	335989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731644
5617	NC_010658	CG	4	8	336011	336018	0 %	0 %	50 %	50 %	187731644
5618	NC_010658	TGGAAG	2	12	336052	336063	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187731644
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5620	NC_010658	GGT	2	6	336153	336158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731644
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5983	NC_010658	CTA	2	6	356726	356731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732708
5984	NC_010658	CAT	2	6	356780	356785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732708
5985	NC_010658	TGA	2	6	356822	356827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732708
5986	NC_010658	TGC	2	6	356849	356854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732708
5987	NC_010658	CGG	2	6	356897	356902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732708
5988	NC_010658	AGA	2	6	356918	356923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732708
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5999	NC_010658	GC	3	6	357304	357309	0 %	0 %	50 %	50 %	187732708
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