MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010658	GCG	2	6	302691	302696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731576
5002	NC_010658	GGGC	2	8	302714	302721	0 %	0 %	75 %	25 %	187731576
5003	NC_010658	TGGA	2	8	302774	302781	25 %	25 %	50 %	0 %	187731576
5004	NC_010658	TCG	2	6	302881	302886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731576
5005	NC_010658	GAA	2	6	302933	302938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731576
5006	NC_010658	CAT	2	6	303107	303112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731463
5007	NC_010658	CGT	2	6	303132	303137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5008	NC_010658	GTA	2	6	303194	303199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
5009	NC_010658	GCG	2	6	303225	303230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731463
5010	NC_010658	AAC	2	6	303243	303248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731463
5011	NC_010658	TTA	2	6	303264	303269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731463
5012	NC_010658	AGC	2	6	303341	303346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5013	NC_010658	GAG	2	6	303389	303394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731463
5014	NC_010658	TGA	2	6	303511	303516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
5015	NC_010658	TAC	2	6	303539	303544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731463
5016	NC_010658	ACG	3	9	303567	303575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5017	NC_010658	CTG	2	6	303604	303609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5018	NC_010658	CTT	2	6	303659	303664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731463
5019	NC_010658	AGCGA	2	10	303672	303681	40 %	0 %	40 %	20 %	187731463
5020	NC_010658	CCG	2	6	303721	303726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731463
5021	NC_010658	ATC	3	9	303827	303835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731463
5022	NC_010658	GCGT	2	8	303886	303893	0 %	25 %	50 %	25 %	187731463
5023	NC_010658	ATG	2	6	303927	303932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
5024	NC_010658	GCG	2	6	303983	303988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731463
5025	NC_010658	GCTG	2	8	304065	304072	0 %	25 %	50 %	25 %	187731463
5026	NC_010658	CAA	2	6	304075	304080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731463
5027	NC_010658	CAG	2	6	304082	304087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5028	NC_010658	TGT	2	6	304098	304103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731463
5029	NC_010658	GTTT	2	8	304129	304136	0 %	75 %	25 %	0 %	187731463
5030	NC_010658	TCG	2	6	304137	304142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
5031	NC_010658	CGG	2	6	304560	304565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731565
5032	NC_010658	GCG	2	6	304610	304615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731565
5033	NC_010658	A	6	6	304649	304654	100 %	0 %	0 %	0 %	187731565
5034	NC_010658	CCG	2	6	304825	304830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732035
5035	NC_010658	CAG	2	6	304856	304861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5036	NC_010658	ACG	2	6	304864	304869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5037	NC_010658	GCA	2	6	304875	304880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5038	NC_010658	GGCA	2	8	304895	304902	25 %	0 %	50 %	25 %	187732035
5039	NC_010658	CAT	2	6	304937	304942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
5040	NC_010658	ACC	2	6	304943	304948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732035
5041	NC_010658	TAA	2	6	305006	305011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732035
5042	NC_010658	GTA	2	6	305032	305037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732035
5043	NC_010658	AAT	2	6	305067	305072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732035
5044	NC_010658	CAA	2	6	305079	305084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732035
5045	NC_010658	GTT	2	6	305106	305111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732035
5046	NC_010658	GCC	2	6	305117	305122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732035
5047	NC_010658	CAG	2	6	305138	305143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5048	NC_010658	AGTC	2	8	305161	305168	25 %	25 %	25 %	25 %	187732035
5049	NC_010658	CTG	2	6	305170	305175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5050	NC_010658	GTG	2	6	305185	305190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732035
5051	NC_010658	CAT	2	6	305252	305257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
5052	NC_010658	CAT	2	6	305297	305302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
5053	NC_010658	AC	3	6	305332	305337	50 %	0 %	0 %	50 %	187732035
5054	NC_010658	TGG	2	6	305353	305358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732035
5055	NC_010658	CTTTC	2	10	305414	305423	0 %	60 %	0 %	40 %	187732035
5056	NC_010658	TCG	2	6	305427	305432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5057	NC_010658	CGG	3	9	305593	305601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732035
5058	NC_010658	A	6	6	305651	305656	100 %	0 %	0 %	0 %	187732035
5059	NC_010658	AG	3	6	305714	305719	50 %	0 %	50 %	0 %	187732035
5060	NC_010658	CCA	2	6	305752	305757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732035
5061	NC_010658	ACA	2	6	305761	305766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732035
5062	NC_010658	TGAG	2	8	305776	305783	25 %	25 %	50 %	0 %	187732035
5063	NC_010658	GAT	2	6	305804	305809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732035
5064	NC_010658	ACC	3	9	305820	305828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732035
5065	NC_010658	ATA	2	6	305837	305842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732035
5066	NC_010658	GCA	2	6	305859	305864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732035
5067	NC_010658	CAAAC	2	10	305933	305942	60 %	0 %	0 %	40 %	187732035
5068	NC_010658	T	6	6	305969	305974	0 %	100 %	0 %	0 %	187732035
5069	NC_010658	CAT	2	6	305980	305985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
5070	NC_010658	ACC	2	6	305990	305995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732035
5071	NC_010658	TCA	2	6	306299	306304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732182
5072	NC_010658	AGCGCC	3	18	306350	306367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187732182
5073	NC_010658	CGC	2	6	306387	306392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732182
5074	NC_010658	CTGC	2	8	306423	306430	0 %	25 %	25 %	50 %	187732182
5075	NC_010658	CAA	2	6	306438	306443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732182
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5077	NC_010658	TGC	2	6	306644	306649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5079	NC_010658	GCT	2	6	306693	306698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
5080	NC_010658	GTG	2	6	306719	306724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732182
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5086	NC_010658	GCC	2	6	307086	307091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732182
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5088	NC_010658	ATC	2	6	307129	307134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732182
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5090	NC_010658	TGC	2	6	307211	307216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5093	NC_010658	GCT	3	9	307311	307319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5097	NC_010658	GCT	2	6	307569	307574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5101	NC_010658	GC	3	6	307780	307785	0 %	0 %	50 %	50 %	187732182
5102	NC_010658	TGC	2	6	307820	307825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
5103	NC_010658	TCTTT	2	10	307827	307836	0 %	80 %	0 %	20 %	187732182
5104	NC_010658	TTG	2	6	307930	307935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732182
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5107	NC_010658	TGC	2	6	308087	308092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
5108	NC_010658	TTG	2	6	308122	308127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732182
5109	NC_010658	GTT	2	6	308158	308163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732182
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5120	NC_010658	CGG	2	6	308462	308467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732182
5121	NC_010658	CTT	2	6	308472	308477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732182
5122	NC_010658	TTG	2	6	308515	308520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732182
5123	NC_010658	TGC	3	9	308525	308533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5131	NC_010658	GCA	2	6	308768	308773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732182
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5135	NC_010658	CGG	2	6	309015	309020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732182
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5141	NC_010658	TGC	2	6	309292	309297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732912
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5149	NC_010658	TCA	2	6	309703	309708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732912
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5158	NC_010658	TGC	2	6	309991	309996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732912
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5161	NC_010658	AGCAC	2	10	310064	310073	40 %	0 %	20 %	40 %	187732912
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5239	NC_010658	GGT	2	6	314629	314634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732047
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5241	NC_010658	GCC	2	6	314689	314694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732047
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5355	NC_010658	CGAA	2	8	322285	322292	50 %	0 %	25 %	25 %	187731876
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5359	NC_010658	CTG	2	6	322425	322430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
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5363	NC_010658	AACG	2	8	322617	322624	50 %	0 %	25 %	25 %	187731876
5364	NC_010658	AGA	2	6	322631	322636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731876
5365	NC_010658	TGA	2	6	322670	322675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731876
5366	NC_010658	CAC	2	6	322718	322723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731876
5367	NC_010658	TCA	2	6	322735	322740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731876
5368	NC_010658	TAC	2	6	322784	322789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731876
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5370	NC_010658	AAG	2	6	322875	322880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731876
5371	NC_010658	GAG	2	6	322891	322896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731876
5372	NC_010658	AAC	2	6	322925	322930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730856
5373	NC_010658	ACT	2	6	322970	322975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730856
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5382	NC_010658	CGG	2	6	323217	323222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730856
5383	NC_010658	CCA	2	6	323264	323269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730856
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5385	NC_010658	TCG	2	6	323300	323305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730856
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5387	NC_010658	GCT	2	6	323361	323366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730856
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5392	NC_010658	TAC	2	6	323661	323666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730856
5393	NC_010658	GGT	2	6	323698	323703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730856
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5399	NC_010658	GTTT	2	8	324101	324108	0 %	75 %	25 %	0 %	187731497
5400	NC_010658	CAC	2	6	324135	324140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731497
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5403	NC_010658	TCAGAT	2	12	324510	324521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187732094
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5405	NC_010658	CAG	2	6	324637	324642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732094
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5409	NC_010658	ATCAC	2	10	324794	324803	40 %	20 %	0 %	40 %	187732094
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5435	NC_010658	G	6	6	326731	326736	0 %	0 %	100 %	0 %	187732956
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5442	NC_010658	TCG	2	6	327040	327045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732956
5443	NC_010658	AGC	2	6	327072	327077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732956
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5468	NC_010658	GCA	2	6	328363	328368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734040
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5484	NC_010658	TGG	2	6	329102	329107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732381
5485	NC_010658	GCAA	2	8	329109	329116	50 %	0 %	25 %	25 %	187732381
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