MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_33

Total Repeats: 599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010657	TA	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
2	NC_010657	ATC	2	6	167	172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729984
3	NC_010657	TAA	2	6	180	185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187729984
4	NC_010657	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187729984
5	NC_010657	AGGA	2	8	297	304	50 %	0 %	50 %	0 %	187729984
6	NC_010657	A	6	6	337	342	100 %	0 %	0 %	0 %	187729984
7	NC_010657	TAC	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729984
8	NC_010657	TA	3	6	360	365	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
9	NC_010657	TA	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
10	NC_010657	GAT	3	9	424	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729984
11	NC_010657	TTCA	2	8	494	501	25 %	50 %	0 %	25 %	187729984
12	NC_010657	CCAG	2	8	520	527	25 %	0 %	25 %	50 %	187729984
13	NC_010657	TTA	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187729984
14	NC_010657	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729984
15	NC_010657	TG	3	6	582	587	0 %	50 %	50 %	0 %	187729984
16	NC_010657	CTTC	2	8	609	616	0 %	50 %	0 %	50 %	187729984
17	NC_010657	AGA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729984
18	NC_010657	TGG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730005
19	NC_010657	ATG	2	6	814	819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730005
20	NC_010657	CCG	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730005
21	NC_010657	TGA	3	9	1052	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730005
22	NC_010657	TTG	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730005
23	NC_010657	ACA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730005
24	NC_010657	TCTG	2	8	1304	1311	0 %	50 %	25 %	25 %	187730005
25	NC_010657	TAC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730005
26	NC_010657	GTG	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730005
27	NC_010657	GCA	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730005
28	NC_010657	TGA	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730005
29	NC_010657	A	7	7	1566	1572	100 %	0 %	0 %	0 %	187730005
30	NC_010657	A	6	6	1645	1650	100 %	0 %	0 %	0 %	187730005
31	NC_010657	CAA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730005
32	NC_010657	TGA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730005
33	NC_010657	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730005
34	NC_010657	AAAGC	2	10	1813	1822	60 %	0 %	20 %	20 %	187730005
35	NC_010657	CGA	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730005
36	NC_010657	GTTCA	2	10	1944	1953	20 %	40 %	20 %	20 %	187730005
37	NC_010657	GTG	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730005
38	NC_010657	AAC	2	6	2030	2035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730005
39	NC_010657	AGA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730005
40	NC_010657	ATG	2	6	2098	2103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730005
41	NC_010657	GAC	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730005
42	NC_010657	AAG	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730005
43	NC_010657	GAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730005
44	NC_010657	AAC	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730005
45	NC_010657	CCG	3	9	2190	2198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730005
46	NC_010657	CCT	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730005
47	NC_010657	TGCT	2	8	2218	2225	0 %	50 %	25 %	25 %	187730005
48	NC_010657	A	6	6	2268	2273	100 %	0 %	0 %	0 %	187730005
49	NC_010657	TTG	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730005
50	NC_010657	AAGGAT	2	12	2280	2291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187730005
51	NC_010657	A	6	6	2298	2303	100 %	0 %	0 %	0 %	187730005
52	NC_010657	TGG	2	6	2312	2317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730005
53	NC_010657	GAA	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730005
54	NC_010657	CCTG	2	8	2435	2442	0 %	25 %	25 %	50 %	187730005
55	NC_010657	TTA	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730005
56	NC_010657	CAG	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730005
57	NC_010657	GAGT	2	8	2714	2721	25 %	25 %	50 %	0 %	187730005
58	NC_010657	GTG	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730005
59	NC_010657	AAG	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730005
60	NC_010657	ATCAGA	2	12	2986	2997	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187729969
61	NC_010657	ATC	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729969
62	NC_010657	TGA	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729969
63	NC_010657	GTAC	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	187729969
64	NC_010657	AGA	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729974
65	NC_010657	ATG	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729974
66	NC_010657	GTT	3	9	3241	3249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729974
67	NC_010657	GAA	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729974
68	NC_010657	CGT	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729974
69	NC_010657	CAG	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729974
70	NC_010657	CAT	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729974
71	NC_010657	CAG	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729974
72	NC_010657	GCTT	2	8	3492	3499	0 %	50 %	25 %	25 %	187729974
73	NC_010657	GCT	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729974
74	NC_010657	TGA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729974
75	NC_010657	AATAA	2	10	3572	3581	80 %	20 %	0 %	0 %	187729974
76	NC_010657	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730013
77	NC_010657	ATCAA	2	10	3686	3695	60 %	20 %	0 %	20 %	187730013
78	NC_010657	A	7	7	3694	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	187730013
79	NC_010657	TTG	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730013
80	NC_010657	TAA	2	6	3766	3771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730013
81	NC_010657	AAAT	2	8	3918	3925	75 %	25 %	0 %	0 %	187730013
82	NC_010657	TTA	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730013
83	NC_010657	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730013
84	NC_010657	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	187730013
85	NC_010657	CCA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730013
86	NC_010657	GAT	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730013
87	NC_010657	AAAC	2	8	4277	4284	75 %	0 %	0 %	25 %	187730013
88	NC_010657	ATG	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730013
89	NC_010657	CTG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730013
90	NC_010657	TGT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730006
91	NC_010657	A	7	7	4865	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	187730006
92	NC_010657	A	6	6	4886	4891	100 %	0 %	0 %	0 %	187730006
93	NC_010657	CT	3	6	4952	4957	0 %	50 %	0 %	50 %	187730006
94	NC_010657	GCA	2	6	4988	4993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730006
95	NC_010657	TC	3	6	5047	5052	0 %	50 %	0 %	50 %	187730006
96	NC_010657	GAT	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730006
97	NC_010657	GTAT	2	8	5076	5083	25 %	50 %	25 %	0 %	187730006
98	NC_010657	GTG	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730006
99	NC_010657	AGAA	2	8	5224	5231	75 %	0 %	25 %	0 %	187730006
100	NC_010657	ACC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730006
101	NC_010657	CCA	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730006
102	NC_010657	CTG	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730006
103	NC_010657	TG	3	6	5395	5400	0 %	50 %	50 %	0 %	187730006
104	NC_010657	GACA	2	8	5415	5422	50 %	0 %	25 %	25 %	187730006
105	NC_010657	TCC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730006
106	NC_010657	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730006
107	NC_010657	AAG	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730006
108	NC_010657	T	6	6	5613	5618	0 %	100 %	0 %	0 %	187730006
109	NC_010657	ATG	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730006
110	NC_010657	TAA	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730006
111	NC_010657	GGC	2	6	5854	5859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187729976
112	NC_010657	TGTT	2	8	6071	6078	0 %	75 %	25 %	0 %	187729976
113	NC_010657	CATT	2	8	6143	6150	25 %	50 %	0 %	25 %	187729976
114	NC_010657	ATG	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729976
115	NC_010657	A	6	6	6373	6378	100 %	0 %	0 %	0 %	187729976
116	NC_010657	GAT	2	6	6412	6417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729976
117	NC_010657	GA	3	6	6440	6445	50 %	0 %	50 %	0 %	187729976
118	NC_010657	CTG	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729993
119	NC_010657	GAT	3	9	6700	6708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729993
120	NC_010657	AGC	2	6	6768	6773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729993
121	NC_010657	CAG	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729993
122	NC_010657	TGA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729993
123	NC_010657	AATA	2	8	6868	6875	75 %	25 %	0 %	0 %	187729993
124	NC_010657	GT	3	6	6876	6881	0 %	50 %	50 %	0 %	187729993
125	NC_010657	TGT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729989
126	NC_010657	TTTG	2	8	7073	7080	0 %	75 %	25 %	0 %	187729989
127	NC_010657	TA	3	6	7086	7091	50 %	50 %	0 %	0 %	187729989
128	NC_010657	AGA	3	9	7115	7123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729989
129	NC_010657	AGA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729989
130	NC_010657	ATC	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730018
131	NC_010657	TAG	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730018
132	NC_010657	GCTG	2	8	7314	7321	0 %	25 %	50 %	25 %	187730018
133	NC_010657	TAATC	2	10	7350	7359	40 %	40 %	0 %	20 %	187730018
134	NC_010657	AAC	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730018
135	NC_010657	TCA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730010
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