MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_33

Total Repeats: 599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010657	GA	3	6	27931	27936	50 %	0 %	50 %	0 %	187729994
502	NC_010657	A	7	7	28032	28038	100 %	0 %	0 %	0 %	187729994
503	NC_010657	GAT	2	6	28051	28056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729994
504	NC_010657	CTT	2	6	28060	28065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729994
505	NC_010657	GCT	2	6	28090	28095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729994
506	NC_010657	AGC	2	6	28113	28118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729994
507	NC_010657	ACA	2	6	28162	28167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729994
508	NC_010657	T	6	6	28243	28248	0 %	100 %	0 %	0 %	187729994
509	NC_010657	T	6	6	28271	28276	0 %	100 %	0 %	0 %	187729994
510	NC_010657	CAG	2	6	28316	28321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729994
511	NC_010657	CAT	2	6	28473	28478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729994
512	NC_010657	TTC	2	6	28535	28540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729994
513	NC_010657	TTG	2	6	28568	28573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729994
514	NC_010657	TAA	2	6	28648	28653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187729994
515	NC_010657	TTG	2	6	28686	28691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729997
516	NC_010657	ATTT	2	8	28711	28718	25 %	75 %	0 %	0 %	187729997
517	NC_010657	GGAT	2	8	28794	28801	25 %	25 %	50 %	0 %	187729997
518	NC_010657	ACAG	2	8	28808	28815	50 %	0 %	25 %	25 %	187729997
519	NC_010657	TGT	2	6	28828	28833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729997
520	NC_010657	TTG	2	6	28860	28865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729997
521	NC_010657	ATC	2	6	28895	28900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729997
522	NC_010657	GCG	2	6	28907	28912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187729997
523	NC_010657	GAA	2	6	28930	28935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729997
524	NC_010657	CAA	2	6	28965	28970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729997
525	NC_010657	ATA	2	6	29054	29059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187729997
526	NC_010657	AGC	2	6	29071	29076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729997
527	NC_010657	TCA	2	6	29127	29132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729997
528	NC_010657	TGG	2	6	29150	29155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187729997
529	NC_010657	TTA	2	6	29160	29165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187729997
530	NC_010657	TAT	2	6	29285	29290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187729997
531	NC_010657	ATT	2	6	29342	29347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187729997
532	NC_010657	TAA	2	6	29389	29394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187729997
533	NC_010657	CGG	2	6	29397	29402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187729997
534	NC_010657	GTG	2	6	29403	29408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187729997
535	NC_010657	TCT	2	6	29490	29495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729997
536	NC_010657	TCT	2	6	29542	29547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729997
537	NC_010657	TTCA	2	8	29548	29555	25 %	50 %	0 %	25 %	187729997
538	NC_010657	CATT	2	8	29628	29635	25 %	50 %	0 %	25 %	187729997
539	NC_010657	GGA	2	6	29641	29646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187729997
540	NC_010657	TGATTT	2	12	29734	29745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187729997
541	NC_010657	A	6	6	29759	29764	100 %	0 %	0 %	0 %	187729997
542	NC_010657	ATTT	2	8	29774	29781	25 %	75 %	0 %	0 %	187729997
543	NC_010657	A	6	6	29814	29819	100 %	0 %	0 %	0 %	187729997
544	NC_010657	TTTC	2	8	29830	29837	0 %	75 %	0 %	25 %	187729997
545	NC_010657	GAT	2	6	29876	29881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729997
546	NC_010657	TTG	2	6	29990	29995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729997
547	NC_010657	GCAG	2	8	30041	30048	25 %	0 %	50 %	25 %	187729997
548	NC_010657	AGTCGT	2	12	30170	30181	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187729997
549	NC_010657	GGA	2	6	30182	30187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187729997
550	NC_010657	AAC	2	6	30232	30237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729997
551	NC_010657	ACT	2	6	30244	30249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729997
552	NC_010657	GAA	2	6	30266	30271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729997
553	NC_010657	CTA	2	6	30319	30324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729997
554	NC_010657	GAA	2	6	30391	30396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729997
555	NC_010657	TCG	2	6	30441	30446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729997
556	NC_010657	ATG	2	6	30508	30513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729986
557	NC_010657	AAG	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729986
558	NC_010657	GTT	2	6	30551	30556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729986
559	NC_010657	GGT	2	6	30756	30761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187729986
560	NC_010657	ACA	2	6	30766	30771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729986
561	NC_010657	ATG	2	6	30773	30778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729986
562	NC_010657	CAG	2	6	30827	30832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729986
563	NC_010657	T	6	6	30858	30863	0 %	100 %	0 %	0 %	187729986
564	NC_010657	A	6	6	30922	30927	100 %	0 %	0 %	0 %	187729986
565	NC_010657	CAA	2	6	30969	30974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729968
566	NC_010657	GGAG	2	8	31040	31047	25 %	0 %	75 %	0 %	187729968
567	NC_010657	T	7	7	31072	31078	0 %	100 %	0 %	0 %	187729968
568	NC_010657	GAAAAA	2	12	31087	31098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187729968
569	NC_010657	CTG	2	6	31170	31175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729968
570	NC_010657	TTAA	2	8	31216	31223	50 %	50 %	0 %	0 %	187729968
571	NC_010657	AAG	2	6	31323	31328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729998
572	NC_010657	TGA	3	9	31336	31344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729998
573	NC_010657	CCAG	2	8	31382	31389	25 %	0 %	25 %	50 %	187729998
574	NC_010657	AAG	2	6	31419	31424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729998
575	NC_010657	GTG	2	6	31435	31440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187729998
576	NC_010657	GAA	2	6	31472	31477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729998
577	NC_010657	GTT	2	6	31745	31750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730000
578	NC_010657	GAT	2	6	31763	31768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730000
579	NC_010657	AGTTG	2	10	31810	31819	20 %	40 %	40 %	0 %	187730000
580	NC_010657	CTTC	2	8	31832	31839	0 %	50 %	0 %	50 %	187730000
581	NC_010657	GGGA	2	8	31905	31912	25 %	0 %	75 %	0 %	187730000
582	NC_010657	TGT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729985
583	NC_010657	TG	3	6	31976	31981	0 %	50 %	50 %	0 %	187729985
584	NC_010657	TTG	2	6	32057	32062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729985
585	NC_010657	AAC	2	6	32117	32122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729985
586	NC_010657	CAA	2	6	32138	32143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729985
587	NC_010657	CAGA	2	8	32194	32201	50 %	0 %	25 %	25 %	187729985
588	NC_010657	GT	3	6	32225	32230	0 %	50 %	50 %	0 %	187729985
589	NC_010657	ACG	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729985
590	NC_010657	TAAC	2	8	32409	32416	50 %	25 %	0 %	25 %	187729985
591	NC_010657	AAAGA	2	10	32446	32455	80 %	0 %	20 %	0 %	187729975
592	NC_010657	ACA	2	6	32463	32468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187729975
593	NC_010657	TAC	2	6	32486	32491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729975
594	NC_010657	TA	3	6	32528	32533	50 %	50 %	0 %	0 %	187729975
595	NC_010657	AATTT	2	10	32534	32543	40 %	60 %	0 %	0 %	187729975
596	NC_010657	GAT	2	6	32709	32714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729975
597	NC_010657	AAAC	2	8	32758	32765	75 %	0 %	0 %	25 %	187729975
598	NC_010657	TTC	2	6	32774	32779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729975
599	NC_010657	ACGATT	2	12	32798	32809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187729975

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