MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	GCGGGA	2	12	29	40	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170079514
2	NC_010479	CGA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
3	NC_010479	GAA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
4	NC_010479	GCC	2	6	159	164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079514
5	NC_010479	TGAT	2	8	242	249	25 %	50 %	25 %	0 %	170079514
6	NC_010479	TCCAG	2	10	312	321	20 %	20 %	20 %	40 %	170079514
7	NC_010479	GCA	2	6	343	348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
8	NC_010479	TCA	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079514
9	NC_010479	AAG	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
10	NC_010479	A	6	6	628	633	100 %	0 %	0 %	0 %	170079514
11	NC_010479	GAA	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079515
12	NC_010479	AGG	2	6	713	718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079515
13	NC_010479	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079515
14	NC_010479	CAG	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
15	NC_010479	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	170079515
16	NC_010479	GCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
17	NC_010479	GAA	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079516
18	NC_010479	GAAT	2	8	2853	2860	50 %	25 %	25 %	0 %	170079516
19	NC_010479	CTG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079516
20	NC_010479	GGC	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079517
21	NC_010479	C	6	6	3022	3027	0 %	0 %	0 %	100 %	170079517
22	NC_010479	TGT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
23	NC_010479	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
24	NC_010479	ACC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079517
25	NC_010479	CTTGC	2	10	3276	3285	0 %	40 %	20 %	40 %	170079518
26	NC_010479	ACA	2	6	3291	3296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
27	NC_010479	ACA	2	6	3342	3347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
28	NC_010479	TGC	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079518
29	NC_010479	AGA	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079518
30	NC_010479	AGGC	2	8	3672	3679	25 %	0 %	50 %	25 %	170079518
31	NC_010479	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079518
32	NC_010479	TTA	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079518
33	NC_010479	ACT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079518
34	NC_010479	CCTA	2	8	3780	3787	25 %	25 %	0 %	50 %	170079518
35	NC_010479	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079519
36	NC_010479	CAGA	2	8	4005	4012	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
37	NC_010479	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079519
38	NC_010479	TGGA	2	8	4089	4096	25 %	25 %	50 %	0 %	170079519
39	NC_010479	GAAC	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
40	NC_010479	GAACC	2	10	4158	4167	40 %	0 %	20 %	40 %	170079519
41	NC_010479	TGA	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079519
42	NC_010479	AGC	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079520
43	NC_010479	CAC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079520
44	NC_010479	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079520
45	NC_010479	CCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079521
46	NC_010479	CTGCC	2	10	4629	4638	0 %	20 %	20 %	60 %	170079521
47	NC_010479	ATCC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	0 %	50 %	170079521
48	NC_010479	ACC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079522
49	NC_010479	AAGG	2	8	5108	5115	50 %	0 %	50 %	0 %	170079522
50	NC_010479	A	6	6	5286	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
51	NC_010479	A	8	8	5328	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
52	NC_010479	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
53	NC_010479	ACT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079523
54	NC_010479	AGA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
55	NC_010479	GCA	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079523
56	NC_010479	GCG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079523
57	NC_010479	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
58	NC_010479	CCG	2	6	5762	5767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079524
59	NC_010479	T	6	6	5780	5785	0 %	100 %	0 %	0 %	170079524
60	NC_010479	AGA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079524
61	NC_010479	A	6	6	6042	6047	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
62	NC_010479	GAC	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
63	NC_010479	GAC	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
64	NC_010479	GAC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
65	NC_010479	CA	3	6	6143	6148	50 %	0 %	0 %	50 %	170079524
66	NC_010479	CAAT	2	8	6150	6157	50 %	25 %	0 %	25 %	170079524
67	NC_010479	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079524
68	NC_010479	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	170079524
69	NC_010479	AG	5	10	6243	6252	50 %	0 %	50 %	0 %	170079524
70	NC_010479	A	6	6	6272	6277	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
71	NC_010479	TGC	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079524
72	NC_010479	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079524
73	NC_010479	TTA	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079524
74	NC_010479	TGGT	2	8	6501	6508	0 %	50 %	50 %	0 %	170079524
75	NC_010479	TC	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	170079524
76	NC_010479	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
77	NC_010479	ACC	3	9	6903	6911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
78	NC_010479	GC	3	6	6933	6938	0 %	0 %	50 %	50 %	170079525
79	NC_010479	GGAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	75 %	0 %	170079525
80	NC_010479	TTC	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079525
81	NC_010479	CTA	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
82	NC_010479	CAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
83	NC_010479	TCA	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
84	NC_010479	CAGG	2	8	7080	7087	25 %	0 %	50 %	25 %	170079525
85	NC_010479	AAC	2	6	7250	7255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
86	NC_010479	CGC	2	6	7268	7273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079525
87	NC_010479	TAT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079525
88	NC_010479	GGCGAT	2	12	7431	7442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079525
89	NC_010479	GCG	2	6	7581	7586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
90	NC_010479	CAC	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
91	NC_010479	CAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
92	NC_010479	AAC	3	9	8026	8034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079526
93	NC_010479	GTG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079526
94	NC_010479	ACT	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079526
95	NC_010479	CCAG	2	8	8244	8251	25 %	0 %	25 %	50 %	170079526
96	NC_010479	T	6	6	8671	8676	0 %	100 %	0 %	0 %	170079527
97	NC_010479	AAG	2	6	8691	8696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
98	NC_010479	CTA	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079527
99	NC_010479	TCG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079527
100	NC_010479	AAG	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
101	NC_010479	CAG	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079527
102	NC_010479	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
103	NC_010479	TGA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
104	NC_010479	TGA	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
105	NC_010479	CAGTC	2	10	9064	9073	20 %	20 %	20 %	40 %	170079527
106	NC_010479	GACT	2	8	9202	9209	25 %	25 %	25 %	25 %	170079527
107	NC_010479	GAA	2	6	9238	9243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
108	NC_010479	TTC	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079527
109	NC_010479	CGC	2	6	9326	9331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079527
110	NC_010479	CGC	2	6	9379	9384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079527
111	NC_010479	GCCA	2	8	9389	9396	25 %	0 %	25 %	50 %	170079527
112	NC_010479	ACA	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079528
113	NC_010479	CGG	2	6	9677	9682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079528
114	NC_010479	GGA	2	6	9915	9920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079528
115	NC_010479	A	7	7	9926	9932	100 %	0 %	0 %	0 %	170079528
116	NC_010479	ATC	3	9	10078	10086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079528
117	NC_010479	CGG	2	6	10158	10163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079528
118	NC_010479	ATG	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079529
119	NC_010479	ATT	2	6	10336	10341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
120	NC_010479	CAC	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079529
121	NC_010479	GTG	2	6	10384	10389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079529
122	NC_010479	ATT	2	6	10402	10407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
123	NC_010479	TGG	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079529
124	NC_010479	T	8	8	10457	10464	0 %	100 %	0 %	0 %	170079529
125	NC_010479	ACCGT	2	10	10499	10508	20 %	20 %	20 %	40 %	170079529
126	NC_010479	GCCTT	2	10	10597	10606	0 %	40 %	20 %	40 %	170079529
127	NC_010479	TCT	2	6	10625	10630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079529
128	NC_010479	GCG	2	6	10707	10712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079529
129	NC_010479	CCTGAA	2	12	10773	10784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170079529
130	NC_010479	AAT	2	6	10792	10797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079529
131	NC_010479	TCAA	2	8	10931	10938	50 %	25 %	0 %	25 %	170079529
132	NC_010479	ATT	2	6	11020	11025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
133	NC_010479	TAA	2	6	11052	11057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079529
134	NC_010479	ATG	2	6	11090	11095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079529
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