MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 49117

< Previous12...87888990919293949596979899Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_010475	AAC	2	6	3001776	3001781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079454
49002	NC_010475	ATG	2	6	3001795	3001800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49003	NC_010475	ACG	2	6	3001833	3001838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49004	NC_010475	GAC	2	6	3001854	3001859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49005	NC_010475	ATG	2	6	3001924	3001929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49006	NC_010475	AGC	2	6	3001946	3001951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49007	NC_010475	ATC	2	6	3001974	3001979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
49008	NC_010475	TGA	2	6	3001987	3001992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49009	NC_010475	T	7	7	3002065	3002071	0 %	100 %	0 %	0 %	170079454
49010	NC_010475	GAT	2	6	3002124	3002129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49011	NC_010475	TGA	2	6	3002134	3002139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49012	NC_010475	AATA	2	8	3002187	3002194	75 %	25 %	0 %	0 %	170079454
49013	NC_010475	TGAG	2	8	3002236	3002243	25 %	25 %	50 %	0 %	170079454
49014	NC_010475	GGT	2	6	3002300	3002305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079454
49015	NC_010475	AAG	2	6	3002326	3002331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
49016	NC_010475	TC	3	6	3002360	3002365	0 %	50 %	0 %	50 %	170079454
49017	NC_010475	CTC	2	6	3002388	3002393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079454
49018	NC_010475	ACA	2	6	3002453	3002458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079454
49019	NC_010475	TTC	2	6	3002515	3002520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079454
49020	NC_010475	GAA	2	6	3002559	3002564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
49021	NC_010475	AGA	2	6	3002597	3002602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
49022	NC_010475	GCATCG	2	12	3002629	3002640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49023	NC_010475	TGA	2	6	3002669	3002674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49024	NC_010475	CA	3	6	3002691	3002696	50 %	0 %	0 %	50 %	170079454
49025	NC_010475	GTT	2	6	3002829	3002834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079454
49026	NC_010475	GGT	2	6	3002867	3002872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079454
49027	NC_010475	TGGTT	2	10	3002912	3002921	0 %	60 %	40 %	0 %	170079454
49028	NC_010475	CAAT	2	8	3002927	3002934	50 %	25 %	0 %	25 %	170079454
49029	NC_010475	GAA	2	6	3002949	3002954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
49030	NC_010475	ATC	2	6	3002964	3002969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
49031	NC_010475	GAA	2	6	3002991	3002996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
49032	NC_010475	CGT	2	6	3003012	3003017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49033	NC_010475	ACG	2	6	3003197	3003202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49034	NC_010475	GAT	2	6	3003243	3003248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49035	NC_010475	TTC	2	6	3003263	3003268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079454
49036	NC_010475	GCA	2	6	3003281	3003286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49037	NC_010475	ATC	2	6	3003360	3003365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
49038	NC_010475	ATT	2	6	3003372	3003377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079454
49039	NC_010475	TGA	2	6	3003464	3003469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
49040	NC_010475	GTC	2	6	3003490	3003495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079454
49041	NC_010475	TCT	2	6	3003704	3003709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079455
49042	NC_010475	T	6	6	3003727	3003732	0 %	100 %	0 %	0 %	170079455
49043	NC_010475	AGGA	2	8	3003740	3003747	50 %	0 %	50 %	0 %	170079455
49044	NC_010475	TTGGGC	2	12	3003869	3003880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170079455
49045	NC_010475	CGGT	2	8	3003922	3003929	0 %	25 %	50 %	25 %	170079455
49046	NC_010475	GTT	2	6	3003930	3003935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079455
49047	NC_010475	GTG	2	6	3003947	3003952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079455
49048	NC_010475	G	6	6	3004006	3004011	0 %	0 %	100 %	0 %	170079455
49049	NC_010475	GT	3	6	3004077	3004082	0 %	50 %	50 %	0 %	170079455
49050	NC_010475	TGC	2	6	3004301	3004306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
49051	NC_010475	CCG	3	9	3004388	3004396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
49052	NC_010475	G	6	6	3004482	3004487	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
49053	NC_010475	GCA	2	6	3004508	3004513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079457
49054	NC_010475	ATC	2	6	3004563	3004568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079457
49055	NC_010475	AG	3	6	3004619	3004624	50 %	0 %	50 %	0 %	170079457
49056	NC_010475	GTC	2	6	3004668	3004673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
49057	NC_010475	CAA	2	6	3004713	3004718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079457
49058	NC_010475	GCC	2	6	3004791	3004796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
49059	NC_010475	TGT	2	6	3004832	3004837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079457
49060	NC_010475	GCT	2	6	3004874	3004879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
49061	NC_010475	GTT	2	6	3005028	3005033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079457
49062	NC_010475	CCG	2	6	3005054	3005059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
49063	NC_010475	CCT	2	6	3005060	3005065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079457
49064	NC_010475	CAC	2	6	3005087	3005092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079457
49065	NC_010475	CCG	2	6	3005093	3005098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
49066	NC_010475	GCC	2	6	3005128	3005133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
49067	NC_010475	TCC	2	6	3005215	3005220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079457
49068	NC_010475	ATTC	2	8	3005228	3005235	25 %	50 %	0 %	25 %	170079457
49069	NC_010475	CAG	2	6	3005259	3005264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079457
49070	NC_010475	TCAT	2	8	3005281	3005288	25 %	50 %	0 %	25 %	170079457
49071	NC_010475	G	6	6	3005325	3005330	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
49072	NC_010475	GGA	2	6	3005372	3005377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079457
49073	NC_010475	ATC	2	6	3005473	3005478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079457
49074	NC_010475	TCC	2	6	3005479	3005484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079457
49075	NC_010475	CAT	2	6	3005516	3005521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079457
49076	NC_010475	TAGA	2	8	3005576	3005583	50 %	25 %	25 %	0 %	170079457
49077	NC_010475	TCT	2	6	3005632	3005637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079457
49078	NC_010475	GA	3	6	3005641	3005646	50 %	0 %	50 %	0 %	170079457
49079	NC_010475	G	6	6	3005717	3005722	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
49080	NC_010475	CATC	2	8	3005729	3005736	25 %	25 %	0 %	50 %	170079457
49081	NC_010475	AACA	2	8	3005794	3005801	75 %	0 %	0 %	25 %	170079457
49082	NC_010475	GAG	3	9	3005808	3005816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079457
49083	NC_010475	GAT	2	6	3005848	3005853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079457
49084	NC_010475	GAA	2	6	3005881	3005886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079456
49085	NC_010475	A	6	6	3005932	3005937	100 %	0 %	0 %	0 %	170079456
49086	NC_010475	CTG	2	6	3006101	3006106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49087	NC_010475	CACG	2	8	3006141	3006148	25 %	0 %	25 %	50 %	170079458
49088	NC_010475	GAC	2	6	3006234	3006239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49089	NC_010475	A	6	6	3006265	3006270	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49090	NC_010475	CGA	2	6	3006347	3006352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49091	NC_010475	AAC	2	6	3006409	3006414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079458
49092	NC_010475	CT	3	6	3006483	3006488	0 %	50 %	0 %	50 %	170079458
49093	NC_010475	A	6	6	3006555	3006560	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49094	NC_010475	GCC	2	6	3006591	3006596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079458
49095	NC_010475	GTC	2	6	3006637	3006642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49096	NC_010475	G	6	6	3006710	3006715	0 %	0 %	100 %	0 %	170079458
49097	NC_010475	CAC	2	6	3006735	3006740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079458
49098	NC_010475	A	6	6	3006829	3006834	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49099	NC_010475	TCA	2	6	3006856	3006861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079458
49100	NC_010475	GCT	2	6	3006872	3006877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49101	NC_010475	A	6	6	3006879	3006884	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49102	NC_010475	TCC	2	6	3006913	3006918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079458
49103	NC_010475	CGA	2	6	3006950	3006955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079458
49104	NC_010475	ATG	2	6	3006994	3006999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079458
49105	NC_010475	TTTG	2	8	3007004	3007011	0 %	75 %	25 %	0 %	170079458
49106	NC_010475	CCG	2	6	3007042	3007047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079458
49107	NC_010475	TTG	2	6	3007078	3007083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079458
49108	NC_010475	GGC	2	6	3007104	3007109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079458
49109	NC_010475	A	6	6	3007143	3007148	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49110	NC_010475	CCTC	2	8	3007204	3007211	0 %	25 %	0 %	75 %	170079458
49111	NC_010475	TGG	2	6	3007396	3007401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079458
49112	NC_010475	A	7	7	3007438	3007444	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
49113	NC_010475	CGCTG	2	10	3007559	3007568	0 %	20 %	40 %	40 %	170079459
49114	NC_010475	GAT	2	6	3007575	3007580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079459
49115	NC_010475	A	6	6	3007652	3007657	100 %	0 %	0 %	0 %	170079459
49116	NC_010475	CTG	2	6	3007688	3007693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079459
49117	NC_010475	GTC	2	6	3007907	3007912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079459

< Previous12...87888990919293949596979899Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.