MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 49117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076637
2	NC_010475	AAC	3	9	50	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076637
3	NC_010475	ATT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076637
4	NC_010475	GCA	2	6	213	218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
5	NC_010475	AACTC	2	10	329	338	40 %	20 %	0 %	40 %	170076637
6	NC_010475	CCAA	2	8	370	377	50 %	0 %	0 %	50 %	170076637
7	NC_010475	GCG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076637
8	NC_010475	G	7	7	451	457	0 %	0 %	100 %	0 %	170076637
9	NC_010475	TTG	2	6	569	574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076637
10	NC_010475	ACCGC	2	10	614	623	20 %	0 %	20 %	60 %	170076637
11	NC_010475	GAC	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
12	NC_010475	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076637
13	NC_010475	C	6	6	747	752	0 %	0 %	0 %	100 %	170076637
14	NC_010475	CAA	2	6	772	777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076637
15	NC_010475	C	6	6	823	828	0 %	0 %	0 %	100 %	170076637
16	NC_010475	TCC	2	6	851	856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076637
17	NC_010475	AGGCGG	2	12	863	874	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170076637
18	NC_010475	AT	3	6	906	911	50 %	50 %	0 %	0 %	170076637
19	NC_010475	CCAC	2	8	914	921	25 %	0 %	0 %	75 %	170076637
20	NC_010475	CGG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076637
21	NC_010475	CGA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
22	NC_010475	AC	3	6	1179	1184	50 %	0 %	0 %	50 %	170076637
23	NC_010475	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	170076637
24	NC_010475	ATCACC	2	12	1328	1339	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170076637
25	NC_010475	GTG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076638
26	NC_010475	GT	3	6	1556	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	170076638
27	NC_010475	GCG	2	6	1593	1598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
28	NC_010475	AAG	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076638
29	NC_010475	ACCC	2	8	1681	1688	25 %	0 %	0 %	75 %	170076638
30	NC_010475	ATC	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076638
31	NC_010475	CGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076638
32	NC_010475	CAG	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076638
33	NC_010475	ACA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076638
34	NC_010475	GGC	2	6	1942	1947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
35	NC_010475	GCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
36	NC_010475	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
37	NC_010475	CCT	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076638
38	NC_010475	TGG	3	9	2094	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076638
39	NC_010475	TTAT	2	8	2207	2214	25 %	75 %	0 %	0 %	170076638
40	NC_010475	CT	3	6	2336	2341	0 %	50 %	0 %	50 %	170076638
41	NC_010475	CCG	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076639
42	NC_010475	A	6	6	2600	2605	100 %	0 %	0 %	0 %	170076639
43	NC_010475	TAT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076639
44	NC_010475	TCAA	2	8	2678	2685	50 %	25 %	0 %	25 %	170076639
45	NC_010475	AC	3	6	2694	2699	50 %	0 %	0 %	50 %	170076639
46	NC_010475	AAG	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076639
47	NC_010475	ACG	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076640
48	NC_010475	CA	3	6	2937	2942	50 %	0 %	0 %	50 %	170076640
49	NC_010475	GCC	3	9	2953	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076640
50	NC_010475	GGCT	2	8	3196	3203	0 %	25 %	50 %	25 %	170076641
51	NC_010475	CGGGTC	2	12	3264	3275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170076641
52	NC_010475	A	6	6	3313	3318	100 %	0 %	0 %	0 %	170076641
53	NC_010475	CAA	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076642
54	NC_010475	GCA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076642
55	NC_010475	CCT	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076642
56	NC_010475	GTC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076642
57	NC_010475	GGC	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076642
58	NC_010475	CGGG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	170076642
59	NC_010475	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076642
60	NC_010475	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076642
61	NC_010475	G	6	6	3887	3892	0 %	0 %	100 %	0 %	170076642
62	NC_010475	TTGA	2	8	4014	4021	25 %	50 %	25 %	0 %	170076642
63	NC_010475	CGC	2	6	4038	4043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076642
64	NC_010475	AAT	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076642
65	NC_010475	ATCAG	2	10	4120	4129	40 %	20 %	20 %	20 %	170076642
66	NC_010475	CGC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076643
67	NC_010475	CGC	2	6	4283	4288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076643
68	NC_010475	ATG	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076643
69	NC_010475	GC	3	6	4492	4497	0 %	0 %	50 %	50 %	170076643
70	NC_010475	GGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076643
71	NC_010475	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076643
72	NC_010475	GA	3	6	4760	4765	50 %	0 %	50 %	0 %	170076643
73	NC_010475	AAT	2	6	4916	4921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076644
74	NC_010475	ATC	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076644
75	NC_010475	AAT	2	6	5042	5047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076644
76	NC_010475	ACG	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076644
77	NC_010475	CTT	2	6	5179	5184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076644
78	NC_010475	G	6	6	5207	5212	0 %	0 %	100 %	0 %	170076644
79	NC_010475	CCA	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076645
80	NC_010475	ATC	2	6	5406	5411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076645
81	NC_010475	TTTTC	2	10	5417	5426	0 %	80 %	0 %	20 %	170076645
82	NC_010475	TGC	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076645
83	NC_010475	GTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076645
84	NC_010475	T	6	6	5583	5588	0 %	100 %	0 %	0 %	170076645
85	NC_010475	GAC	3	9	5744	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
86	NC_010475	GCTTG	2	10	5778	5787	0 %	40 %	40 %	20 %	170076646
87	NC_010475	CAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
88	NC_010475	TC	3	6	5960	5965	0 %	50 %	0 %	50 %	170076646
89	NC_010475	GGC	2	6	6002	6007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076646
90	NC_010475	ATTT	2	8	6027	6034	25 %	75 %	0 %	0 %	170076646
91	NC_010475	G	6	6	6069	6074	0 %	0 %	100 %	0 %	170076646
92	NC_010475	CGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
93	NC_010475	ATG	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076646
94	NC_010475	CTG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076646
95	NC_010475	CAA	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
96	NC_010475	CGA	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
97	NC_010475	CAA	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
98	NC_010475	GGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076646
99	NC_010475	CAAA	2	8	6464	6471	75 %	0 %	0 %	25 %	170076646
100	NC_010475	AAT	2	6	6486	6491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076646
101	NC_010475	ACCC	2	8	6537	6544	25 %	0 %	0 %	75 %	170076646
102	NC_010475	ACG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
103	NC_010475	GGCG	2	8	6615	6622	0 %	0 %	75 %	25 %	170076646
104	NC_010475	TAAT	2	8	6631	6638	50 %	50 %	0 %	0 %	170076646
105	NC_010475	CTC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076646
106	NC_010475	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076646
107	NC_010475	CG	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	170076646
108	NC_010475	GAA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076647
109	NC_010475	GGA	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076647
110	NC_010475	AT	3	6	7127	7132	50 %	50 %	0 %	0 %	170076647
111	NC_010475	G	6	6	7154	7159	0 %	0 %	100 %	0 %	170076647
112	NC_010475	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076647
113	NC_010475	T	6	6	7206	7211	0 %	100 %	0 %	0 %	170076647
114	NC_010475	ATC	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076647
115	NC_010475	TCAAAA	2	12	7255	7266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170076647
116	NC_010475	CAG	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076647
117	NC_010475	CCA	2	6	7330	7335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076647
118	NC_010475	ATT	2	6	7447	7452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076647
119	NC_010475	ACTA	2	8	7521	7528	50 %	25 %	0 %	25 %	170076647
120	NC_010475	AGAA	2	8	7783	7790	75 %	0 %	25 %	0 %	170076648
121	NC_010475	TAG	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076648
122	NC_010475	TC	3	6	8003	8008	0 %	50 %	0 %	50 %	170076648
123	NC_010475	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076648
124	NC_010475	AAG	2	6	8034	8039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076648
125	NC_010475	TAT	2	6	8236	8241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076648
126	NC_010475	GCC	2	6	8273	8278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076648
127	NC_010475	ATA	2	6	8312	8317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
128	NC_010475	TACC	2	8	8370	8377	25 %	25 %	0 %	50 %	170076649
129	NC_010475	TTA	2	6	8435	8440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076649
130	NC_010475	CAGATT	2	12	8444	8455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170076649
131	NC_010475	ATA	2	6	8459	8464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
132	NC_010475	TGCA	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	170076649
133	NC_010475	CTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076649
134	NC_010475	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
135	NC_010475	A	7	7	8608	8614	100 %	0 %	0 %	0 %	170076649
136	NC_010475	A	6	6	8684	8689	100 %	0 %	0 %	0 %	170076649
137	NC_010475	AGC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076649
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139	NC_010475	ATGGA	2	10	8916	8925	40 %	20 %	40 %	0 %	170076649
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142	NC_010475	TTC	2	6	9041	9046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076649
143	NC_010475	CTT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076649
144	NC_010475	GAA	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
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153	NC_010475	A	8	8	9367	9374	100 %	0 %	0 %	0 %	170076649
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155	NC_010475	AAAGA	2	10	9403	9412	80 %	0 %	20 %	0 %	170076649
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158	NC_010475	CTGC	2	8	9485	9492	0 %	25 %	25 %	50 %	170076649
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163	NC_010475	TTGA	2	8	9819	9826	25 %	50 %	25 %	0 %	170076650
164	NC_010475	TTGT	2	8	9885	9892	0 %	75 %	25 %	0 %	170076650
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167	NC_010475	TGA	3	9	10031	10039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076650
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169	NC_010475	GGA	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076650
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252	NC_010475	GGC	2	6	15634	15639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076657
253	NC_010475	TGT	2	6	15651	15656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076657
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257	NC_010475	GAAAT	2	10	15811	15820	60 %	20 %	20 %	0 %	170076657
258	NC_010475	ACTT	2	8	15840	15847	25 %	50 %	0 %	25 %	170076657
259	NC_010475	GAG	2	6	15882	15887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076657
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263	NC_010475	GGT	3	9	16130	16138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076658
264	NC_010475	CAA	2	6	16155	16160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076658
265	NC_010475	TGG	2	6	16204	16209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076658
266	NC_010475	ATT	3	9	16239	16247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076658
267	NC_010475	TGA	2	6	16276	16281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076658
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270	NC_010475	A	6	6	16372	16377	100 %	0 %	0 %	0 %	170076658
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281	NC_010475	CAT	2	6	17000	17005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076658
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291	NC_010475	GCC	2	6	17370	17375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076658
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