MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 37129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_010380	ATCA	2	8	1617067	1617074	50 %	25 %	0 %	25 %	169834047
27003	NC_010380	T	6	6	1617085	1617090	0 %	100 %	0 %	0 %	169834047
27004	NC_010380	GA	3	6	1617114	1617119	50 %	0 %	50 %	0 %	169834047
27005	NC_010380	GCTT	2	8	1617149	1617156	0 %	50 %	25 %	25 %	169834047
27006	NC_010380	GAT	2	6	1617174	1617179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834047
27007	NC_010380	GCT	2	6	1617182	1617187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834047
27008	NC_010380	ACA	2	6	1617287	1617292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834047
27009	NC_010380	GA	3	6	1617316	1617321	50 %	0 %	50 %	0 %	169834047
27010	NC_010380	CTG	2	6	1617348	1617353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834047
27011	NC_010380	GAA	2	6	1617415	1617420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834047
27012	NC_010380	GAT	2	6	1617474	1617479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834047
27013	NC_010380	TTC	2	6	1617502	1617507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834047
27014	NC_010380	AG	3	6	1617511	1617516	50 %	0 %	50 %	0 %	169834047
27015	NC_010380	CAC	2	6	1617517	1617522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834047
27016	NC_010380	CGG	2	6	1617533	1617538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169834047
27017	NC_010380	T	6	6	1617552	1617557	0 %	100 %	0 %	0 %	169834047
27018	NC_010380	TCA	2	6	1617578	1617583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834047
27019	NC_010380	GAG	2	6	1617601	1617606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169834047
27020	NC_010380	GCT	2	6	1617613	1617618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834047
27021	NC_010380	TTC	2	6	1617658	1617663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834047
27022	NC_010380	TAG	2	6	1617668	1617673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834047
27023	NC_010380	AGGA	2	8	1617757	1617764	50 %	0 %	50 %	0 %	169834047
27024	NC_010380	TC	3	6	1617878	1617883	0 %	50 %	0 %	50 %	169834047
27025	NC_010380	GGT	2	6	1617906	1617911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834047
27026	NC_010380	CTT	2	6	1617948	1617953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834047
27027	NC_010380	TGT	2	6	1617973	1617978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834047
27028	NC_010380	CAA	2	6	1618014	1618019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834047
27029	NC_010380	CTG	2	6	1618041	1618046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834047
27030	NC_010380	CTGT	2	8	1618056	1618063	0 %	50 %	25 %	25 %	169834047
27031	NC_010380	CAT	2	6	1618083	1618088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834047
27032	NC_010380	ATC	2	6	1618093	1618098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834047
27033	NC_010380	CAA	2	6	1618483	1618488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169833206
27034	NC_010380	CAT	2	6	1618496	1618501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833206
27035	NC_010380	A	6	6	1618596	1618601	100 %	0 %	0 %	0 %	169833206
27036	NC_010380	A	6	6	1618630	1618635	100 %	0 %	0 %	0 %	169833206
27037	NC_010380	TCAAGG	2	12	1618660	1618671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169833206
27038	NC_010380	CT	3	6	1618705	1618710	0 %	50 %	0 %	50 %	169833206
27039	NC_010380	GAA	2	6	1618736	1618741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833206
27040	NC_010380	TCG	2	6	1618762	1618767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833206
27041	NC_010380	ATC	2	6	1618914	1618919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833206
27042	NC_010380	GA	3	6	1618931	1618936	50 %	0 %	50 %	0 %	169833206
27043	NC_010380	A	6	6	1618941	1618946	100 %	0 %	0 %	0 %	169833206
27044	NC_010380	CAC	2	6	1618971	1618976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169833206
27045	NC_010380	ACT	2	6	1618996	1619001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833206
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27051	NC_010380	CAT	3	9	1619356	1619364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833900
27052	NC_010380	TCT	2	6	1619423	1619428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833900
27053	NC_010380	ATC	2	6	1619444	1619449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833900
27054	NC_010380	TTA	2	6	1619532	1619537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833900
27055	NC_010380	TTC	2	6	1619579	1619584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833900
27056	NC_010380	TGA	2	6	1619608	1619613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833900
27057	NC_010380	TTTCC	2	10	1619791	1619800	0 %	60 %	0 %	40 %	169833900
27058	NC_010380	GCT	2	6	1619888	1619893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833900
27059	NC_010380	TTTC	2	8	1619896	1619903	0 %	75 %	0 %	25 %	169833900
27060	NC_010380	CTT	2	6	1619911	1619916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833900
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27063	NC_010380	TCTT	2	8	1620031	1620038	0 %	75 %	0 %	25 %	169833917
27064	NC_010380	A	7	7	1620071	1620077	100 %	0 %	0 %	0 %	169833917
27065	NC_010380	GTT	2	6	1620105	1620110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833917
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27072	NC_010380	AAAG	2	8	1620555	1620562	75 %	0 %	25 %	0 %	169833917
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27084	NC_010380	CTCAA	2	10	1621228	1621237	40 %	20 %	0 %	40 %	169834510
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27089	NC_010380	GGTGC	2	10	1621326	1621335	0 %	20 %	60 %	20 %	169834510
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27100	NC_010380	TC	3	6	1621951	1621956	0 %	50 %	0 %	50 %	169834468
27101	NC_010380	ATGGTC	2	12	1622024	1622035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169834468
27102	NC_010380	TGAG	2	8	1622040	1622047	25 %	25 %	50 %	0 %	169834468
27103	NC_010380	AAGC	2	8	1622119	1622126	50 %	0 %	25 %	25 %	169834468
27104	NC_010380	TAGC	2	8	1622216	1622223	25 %	25 %	25 %	25 %	169834468
27105	NC_010380	ATAA	2	8	1622233	1622240	75 %	25 %	0 %	0 %	169834468
27106	NC_010380	AGC	2	6	1622266	1622271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834468
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27108	NC_010380	CTG	2	6	1622377	1622382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834468
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27111	NC_010380	ATC	2	6	1622426	1622431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834468
27112	NC_010380	GCCTT	2	10	1622456	1622465	0 %	40 %	20 %	40 %	169834468
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27115	NC_010380	AGAGC	2	10	1622664	1622673	40 %	0 %	40 %	20 %	169834468
27116	NC_010380	TCA	2	6	1622700	1622705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834468
27117	NC_010380	GAC	2	6	1622763	1622768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834468
27118	NC_010380	AGG	2	6	1622815	1622820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169834468
27119	NC_010380	GCT	2	6	1622840	1622845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834468
27120	NC_010380	CCA	2	6	1622868	1622873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834468
27121	NC_010380	AC	3	6	1622886	1622891	50 %	0 %	0 %	50 %	169834468
27122	NC_010380	CAAGA	2	10	1622905	1622914	60 %	0 %	20 %	20 %	169834468
27123	NC_010380	CAC	2	6	1622959	1622964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834468
27124	NC_010380	AAT	2	6	1623006	1623011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834468
27125	NC_010380	TAC	2	6	1623021	1623026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834468
27126	NC_010380	CTA	2	6	1623051	1623056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834468
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27128	NC_010380	TAC	2	6	1623090	1623095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834468
27129	NC_010380	GCT	2	6	1623176	1623181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834468
27130	NC_010380	ACC	2	6	1623262	1623267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834468
27131	NC_010380	GCTT	2	8	1623374	1623381	0 %	50 %	25 %	25 %	169834468
27132	NC_010380	TCT	2	6	1623389	1623394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834468
27133	NC_010380	GCTTG	2	10	1623411	1623420	0 %	40 %	40 %	20 %	169834468
27134	NC_010380	CT	4	8	1623442	1623449	0 %	50 %	0 %	50 %	169834468
27135	NC_010380	AGC	2	6	1623502	1623507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834468
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27138	NC_010380	T	6	6	1623592	1623597	0 %	100 %	0 %	0 %	169834468
27139	NC_010380	TTC	2	6	1623670	1623675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834468
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27142	NC_010380	CTT	2	6	1623897	1623902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834468
27143	NC_010380	CTGA	2	8	1623975	1623982	25 %	25 %	25 %	25 %	169834468
27144	NC_010380	GTC	2	6	1623987	1623992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834468
27145	NC_010380	TTC	2	6	1624120	1624125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834468
27146	NC_010380	GTT	2	6	1624184	1624189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834468
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27149	NC_010380	A	6	6	1624283	1624288	100 %	0 %	0 %	0 %	169834468
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27155	NC_010380	GCTGG	2	10	1624639	1624648	0 %	20 %	60 %	20 %	169832778
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27204	NC_010380	CAC	2	6	1631224	1631229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169832458
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27213	NC_010380	CAGCC	2	10	1631731	1631740	20 %	0 %	20 %	60 %	169832458
27214	NC_010380	AAT	2	6	1631763	1631768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832458
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27216	NC_010380	CAG	2	6	1631800	1631805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169832458
27217	NC_010380	GTATCT	2	12	1631898	1631909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169832458
27218	NC_010380	TTG	2	6	1631934	1631939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832458
27219	NC_010380	ATGACC	2	12	1632007	1632018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169832458
27220	NC_010380	CAC	2	6	1632034	1632039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169832458
27221	NC_010380	TTA	2	6	1632054	1632059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832458
27222	NC_010380	GCT	2	6	1632087	1632092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832458
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27224	NC_010380	GAAC	2	8	1632333	1632340	50 %	0 %	25 %	25 %	169832458
27225	NC_010380	CAT	2	6	1632409	1632414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832458
27226	NC_010380	GAC	2	6	1632451	1632456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169832458
27227	NC_010380	TTC	2	6	1632929	1632934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169832932
27228	NC_010380	CTT	2	6	1632966	1632971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834249
27229	NC_010380	GGAGTT	2	12	1632992	1633003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169834249
27230	NC_010380	TTC	2	6	1633075	1633080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834249
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27232	NC_010380	TTC	3	9	1633120	1633128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834249
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27467	NC_010380	GAT	2	6	1645894	1645899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834086
27468	NC_010380	TCT	2	6	1645903	1645908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834086
27469	NC_010380	CAA	2	6	1645909	1645914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834086
27470	NC_010380	GCT	2	6	1645942	1645947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834086
27471	NC_010380	ATTT	2	8	1645992	1645999	25 %	75 %	0 %	0 %	169834086
27472	NC_010380	CCAA	2	8	1646030	1646037	50 %	0 %	0 %	50 %	169834086
27473	NC_010380	AACA	2	8	1646096	1646103	75 %	0 %	0 %	25 %	169834086
27474	NC_010380	TTGA	2	8	1646110	1646117	25 %	50 %	25 %	0 %	169834086
27475	NC_010380	CTT	2	6	1646172	1646177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834086
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27480	NC_010380	CCT	2	6	1646468	1646473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834086
27481	NC_010380	CTT	2	6	1646508	1646513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834086
27482	NC_010380	GATTT	2	10	1646518	1646527	20 %	60 %	20 %	0 %	169834086
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27484	NC_010380	A	6	6	1646564	1646569	100 %	0 %	0 %	0 %	169834086
27485	NC_010380	A	6	6	1646593	1646598	100 %	0 %	0 %	0 %	169834086
27486	NC_010380	ATA	2	6	1646680	1646685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169833467
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27492	NC_010380	TGCATA	2	12	1647047	1647058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169833467
27493	NC_010380	ACC	2	6	1647121	1647126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169833467
27494	NC_010380	CAT	2	6	1647213	1647218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833467
27495	NC_010380	TTC	2	6	1647247	1647252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833467
27496	NC_010380	CCA	2	6	1647330	1647335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169833467
27497	NC_010380	CAG	2	6	1647339	1647344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833467
27498	NC_010380	AAG	2	6	1647463	1647468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833467
27499	NC_010380	AACCA	2	10	1647484	1647493	60 %	0 %	0 %	40 %	169833467
27500	NC_010380	GTA	2	6	1647529	1647534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833467

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