MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010334	CTA	2	6	267543	267548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622162
4002	NC_010334	CGT	2	6	267561	267566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622162
4003	NC_010334	GTA	2	6	267589	267594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622162
4004	NC_010334	TCA	2	6	267601	267606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622162
4005	NC_010334	TGC	2	6	267611	267616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622162
4006	NC_010334	TCG	2	6	267685	267690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622162
4007	NC_010334	AAGC	2	8	267716	267723	50 %	0 %	25 %	25 %	167622162
4008	NC_010334	TGT	2	6	267753	267758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622162
4009	NC_010334	AGA	2	6	267785	267790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622162
4010	NC_010334	CTAA	2	8	267870	267877	50 %	25 %	0 %	25 %	167622162
4011	NC_010334	CCAA	2	8	267922	267929	50 %	0 %	0 %	50 %	167622162
4012	NC_010334	GAA	2	6	268013	268018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622162
4013	NC_010334	GGC	2	6	268031	268036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622162
4014	NC_010334	GGT	2	6	268143	268148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622162
4015	NC_010334	GGT	2	6	268215	268220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622162
4016	NC_010334	TGA	2	6	268223	268228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622162
4017	NC_010334	TAA	2	6	268275	268280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622162
4018	NC_010334	AAAT	2	8	268546	268553	75 %	25 %	0 %	0 %	167622163
4019	NC_010334	T	6	6	268596	268601	0 %	100 %	0 %	0 %	167622163
4020	NC_010334	TGCA	2	8	268740	268747	25 %	25 %	25 %	25 %	167622163
4021	NC_010334	ACA	2	6	268805	268810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622163
4022	NC_010334	CGT	2	6	268850	268855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622163
4023	NC_010334	AGTT	2	8	268893	268900	25 %	50 %	25 %	0 %	167622163
4024	NC_010334	ACA	2	6	268962	268967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622163
4025	NC_010334	TGCC	2	8	269025	269032	0 %	25 %	25 %	50 %	167622163
4026	NC_010334	ACC	2	6	269072	269077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622163
4027	NC_010334	GCG	2	6	269087	269092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622163
4028	NC_010334	TGC	2	6	269154	269159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622163
4029	NC_010334	ATG	2	6	269177	269182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622163
4030	NC_010334	GGC	2	6	269195	269200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622163
4031	NC_010334	TAC	2	6	269237	269242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622163
4032	NC_010334	TA	3	6	269256	269261	50 %	50 %	0 %	0 %	167622163
4033	NC_010334	TTG	2	6	269292	269297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622163
4034	NC_010334	TGG	2	6	269350	269355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622163
4035	NC_010334	GAA	2	6	269459	269464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622163
4036	NC_010334	CTG	2	6	269676	269681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622163
4037	NC_010334	TAA	2	6	269840	269845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622164
4038	NC_010334	TGC	2	6	269867	269872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622164
4039	NC_010334	AAAT	2	8	269914	269921	75 %	25 %	0 %	0 %	167622164
4040	NC_010334	CTTAG	2	10	269940	269949	20 %	40 %	20 %	20 %	167622164
4041	NC_010334	TAA	2	6	269954	269959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622164
4042	NC_010334	TA	3	6	269983	269988	50 %	50 %	0 %	0 %	167622164
4043	NC_010334	ATTT	2	8	269999	270006	25 %	75 %	0 %	0 %	167622164
4044	NC_010334	CTG	2	6	270008	270013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622164
4045	NC_010334	TAA	2	6	270053	270058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622164
4046	NC_010334	ATT	2	6	270087	270092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622164
4047	NC_010334	TGT	2	6	270113	270118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622164
4048	NC_010334	AATA	2	8	270176	270183	75 %	25 %	0 %	0 %	167622164
4049	NC_010334	TAG	2	6	270287	270292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622164
4050	NC_010334	GAT	2	6	270417	270422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622164
4051	NC_010334	ATTT	2	8	270423	270430	25 %	75 %	0 %	0 %	167622164
4052	NC_010334	ATG	2	6	270435	270440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622164
4053	NC_010334	GAT	2	6	270587	270592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622164
4054	NC_010334	TGT	2	6	270655	270660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622164
4055	NC_010334	GAG	2	6	270780	270785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622164
4056	NC_010334	GAC	2	6	270805	270810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622164
4057	NC_010334	GGTTA	2	10	270814	270823	20 %	40 %	40 %	0 %	167622164
4058	NC_010334	CTA	2	6	270923	270928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622164
4059	NC_010334	GAA	2	6	270948	270953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622164
4060	NC_010334	TTATT	2	10	271014	271023	20 %	80 %	0 %	0 %	167622164
4061	NC_010334	AGT	2	6	271074	271079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622164
4062	NC_010334	GCC	2	6	271122	271127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622164
4063	NC_010334	GT	3	6	271192	271197	0 %	50 %	50 %	0 %	167622164
4064	NC_010334	TTG	2	6	271264	271269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622164
4065	NC_010334	A	6	6	271274	271279	100 %	0 %	0 %	0 %	167622164
4066	NC_010334	A	8	8	271312	271319	100 %	0 %	0 %	0 %	167622164
4067	NC_010334	CTT	2	6	271320	271325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622164
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4069	NC_010334	CTT	2	6	271567	271572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622165
4070	NC_010334	GGT	3	9	271712	271720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622165
4071	NC_010334	TTA	2	6	271838	271843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622165
4072	NC_010334	TGA	3	9	271866	271874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622165
4073	NC_010334	GAA	2	6	271895	271900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622165
4074	NC_010334	GTG	2	6	271916	271921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622165
4075	NC_010334	TGG	2	6	272077	272082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622165
4076	NC_010334	TG	3	6	272161	272166	0 %	50 %	50 %	0 %	167622165
4077	NC_010334	TGC	2	6	272437	272442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622166
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4079	NC_010334	CTA	2	6	272547	272552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622166
4080	NC_010334	GTT	2	6	272578	272583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622166
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4083	NC_010334	GGC	2	6	272714	272719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622166
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4085	NC_010334	TTG	2	6	272739	272744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622166
4086	NC_010334	GC	4	8	272755	272762	0 %	0 %	50 %	50 %	167622166
4087	NC_010334	GTC	2	6	272919	272924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622166
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4089	NC_010334	CTAA	2	8	272984	272991	50 %	25 %	0 %	25 %	167622166
4090	NC_010334	GAT	2	6	273038	273043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622166
4091	NC_010334	GATG	2	8	273064	273071	25 %	25 %	50 %	0 %	167622166
4092	NC_010334	AGT	2	6	273225	273230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622167
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4094	NC_010334	TGT	2	6	273296	273301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622167
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4096	NC_010334	AG	3	6	273421	273426	50 %	0 %	50 %	0 %	167622167
4097	NC_010334	GTA	2	6	273427	273432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622167
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4101	NC_010334	GAAT	2	8	273556	273563	50 %	25 %	25 %	0 %	167622167
4102	NC_010334	GGT	2	6	273566	273571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622167
4103	NC_010334	GATG	2	8	273572	273579	25 %	25 %	50 %	0 %	167622167
4104	NC_010334	TCG	2	6	273604	273609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622167
4105	NC_010334	CAG	2	6	273795	273800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622167
4106	NC_010334	GCA	2	6	273851	273856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622167
4107	NC_010334	CAA	2	6	274079	274084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622168
4108	NC_010334	ATGA	2	8	274148	274155	50 %	25 %	25 %	0 %	167622168
4109	NC_010334	GACGAA	2	12	274159	274170	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167622168
4110	NC_010334	GAGT	2	8	274273	274280	25 %	25 %	50 %	0 %	167622168
4111	NC_010334	GGT	2	6	274318	274323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622168
4112	NC_010334	ATTA	2	8	274394	274401	50 %	50 %	0 %	0 %	167622168
4113	NC_010334	TCCCA	2	10	274426	274435	20 %	20 %	0 %	60 %	167622168
4114	NC_010334	GGT	2	6	274532	274537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622168
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4121	NC_010334	TGC	2	6	275245	275250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622169
4122	NC_010334	TC	3	6	275280	275285	0 %	50 %	0 %	50 %	167622169
4123	NC_010334	GCT	2	6	275296	275301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622169
4124	NC_010334	CTT	2	6	275311	275316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622169
4125	NC_010334	CTGA	2	8	275354	275361	25 %	25 %	25 %	25 %	167622169
4126	NC_010334	T	6	6	275397	275402	0 %	100 %	0 %	0 %	167622169
4127	NC_010334	GT	4	8	275415	275422	0 %	50 %	50 %	0 %	167622169
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4154	NC_010334	GATT	2	8	276940	276947	25 %	50 %	25 %	0 %	167622171
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4225	NC_010334	AGGT	2	8	280772	280779	25 %	25 %	50 %	0 %	167622174
4226	NC_010334	TGCAG	2	10	280786	280795	20 %	20 %	40 %	20 %	167622174
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4229	NC_010334	CAA	2	6	280879	280884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622174
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4232	NC_010334	CTT	2	6	281140	281145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622175
4233	NC_010334	CCAA	2	8	281158	281165	50 %	0 %	0 %	50 %	167622175
4234	NC_010334	CAC	2	6	281256	281261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622175
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4242	NC_010334	GATC	2	8	281508	281515	25 %	25 %	25 %	25 %	167622175
4243	NC_010334	AGA	2	6	281610	281615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622175
4244	NC_010334	CTC	2	6	281640	281645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622175
4245	NC_010334	TGC	2	6	281741	281746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622175
4246	NC_010334	ATA	2	6	281753	281758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622175
4247	NC_010334	GATT	2	8	281815	281822	25 %	50 %	25 %	0 %	167622176
4248	NC_010334	CTT	2	6	282019	282024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622176
4249	NC_010334	GTA	2	6	282040	282045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622176
4250	NC_010334	TCT	2	6	282069	282074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622176
4251	NC_010334	GGT	2	6	282128	282133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622176
4252	NC_010334	TGC	2	6	282162	282167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622176
4253	NC_010334	CAG	2	6	282168	282173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622176
4254	NC_010334	ACT	2	6	282248	282253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622176
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4256	NC_010334	TGC	2	6	282346	282351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622176
4257	NC_010334	T	7	7	282366	282372	0 %	100 %	0 %	0 %	167622176
4258	NC_010334	TTG	2	6	283124	283129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622177
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4260	NC_010334	TCAG	2	8	283140	283147	25 %	25 %	25 %	25 %	167622177
4261	NC_010334	GGTGC	2	10	283207	283216	0 %	20 %	60 %	20 %	167622177
4262	NC_010334	CAAT	2	8	283352	283359	50 %	25 %	0 %	25 %	167622177
4263	NC_010334	AGA	2	6	283449	283454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622177
4264	NC_010334	AT	3	6	283488	283493	50 %	50 %	0 %	0 %	167622177
4265	NC_010334	GAA	2	6	283533	283538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622177
4266	NC_010334	GGTCA	2	10	283616	283625	20 %	20 %	40 %	20 %	167622177
4267	NC_010334	GCCA	2	8	283659	283666	25 %	0 %	25 %	50 %	167622177
4268	NC_010334	TGG	2	6	283732	283737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622177
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4271	NC_010334	AACAT	2	10	283925	283934	60 %	20 %	0 %	20 %	167622177
4272	NC_010334	GGCTAA	2	12	283965	283976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622177
4273	NC_010334	TG	3	6	284058	284063	0 %	50 %	50 %	0 %	167622177
4274	NC_010334	GTTT	2	8	284128	284135	0 %	75 %	25 %	0 %	167622177
4275	NC_010334	TAT	2	6	284271	284276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622177
4276	NC_010334	CTTT	2	8	284278	284285	0 %	75 %	0 %	25 %	167622177
4277	NC_010334	TCA	2	6	284289	284294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622177
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4279	NC_010334	GT	4	8	284432	284439	0 %	50 %	50 %	0 %	167622177
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4282	NC_010334	GCA	2	6	284613	284618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622177
4283	NC_010334	GGT	2	6	284716	284721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622177
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4302	NC_010334	AGTC	2	8	285988	285995	25 %	25 %	25 %	25 %	167622179
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4307	NC_010334	TGA	2	6	286200	286205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622179
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4309	NC_010334	TG	3	6	286271	286276	0 %	50 %	50 %	0 %	167622179
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4353	NC_010334	A	6	6	289725	289730	100 %	0 %	0 %	0 %	167622182
4354	NC_010334	AAT	2	6	289813	289818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622182
4355	NC_010334	CAA	2	6	290030	290035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622183
4356	NC_010334	TGG	2	6	290110	290115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
4357	NC_010334	TCG	2	6	290179	290184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
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4362	NC_010334	AT	3	6	290407	290412	50 %	50 %	0 %	0 %	167622183
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4364	NC_010334	AGAA	2	8	290571	290578	75 %	0 %	25 %	0 %	167622183
4365	NC_010334	TGC	2	6	290652	290657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
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4484	NC_010334	A	7	7	297114	297120	100 %	0 %	0 %	0 %	167622187
4485	NC_010334	ATCAG	2	10	297397	297406	40 %	20 %	20 %	20 %	167622188
4486	NC_010334	CGTAT	2	10	297469	297478	20 %	40 %	20 %	20 %	167622188
4487	NC_010334	GAC	2	6	297503	297508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622188
4488	NC_010334	TGAATT	2	12	297511	297522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167622188
4489	NC_010334	TGA	2	6	297544	297549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622188
4490	NC_010334	A	6	6	297549	297554	100 %	0 %	0 %	0 %	167622188
4491	NC_010334	GAA	2	6	297569	297574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622188
4492	NC_010334	TGA	2	6	297655	297660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622188
4493	NC_010334	CAT	2	6	297736	297741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622188
4494	NC_010334	TGG	2	6	297784	297789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622188
4495	NC_010334	GTT	2	6	297801	297806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622188
4496	NC_010334	ACT	2	6	297847	297852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622188
4497	NC_010334	CAGTGA	2	12	298055	298066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622189
4498	NC_010334	AGC	2	6	298087	298092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4499	NC_010334	AGC	2	6	298202	298207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4500	NC_010334	CT	3	6	298292	298297	0 %	50 %	0 %	50 %	167622189

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