MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_010334	AGCG	2	8	1211411	1211418	25 %	0 %	50 %	25 %	167622924
18002	NC_010334	CCA	2	6	1211500	1211505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622924
18003	NC_010334	GC	3	6	1211583	1211588	0 %	0 %	50 %	50 %	167622924
18004	NC_010334	CAC	2	6	1211594	1211599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622924
18005	NC_010334	AAG	2	6	1211761	1211766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622924
18006	NC_010334	ACAG	2	8	1211788	1211795	50 %	0 %	25 %	25 %	167622924
18007	NC_010334	GCC	2	6	1212105	1212110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622924
18008	NC_010334	CAA	2	6	1212179	1212184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622924
18009	NC_010334	CTT	2	6	1212230	1212235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622924
18010	NC_010334	AC	3	6	1212257	1212262	50 %	0 %	0 %	50 %	167622924
18011	NC_010334	AGGC	2	8	1212267	1212274	25 %	0 %	50 %	25 %	167622924
18012	NC_010334	GCAA	2	8	1212354	1212361	50 %	0 %	25 %	25 %	167622924
18013	NC_010334	ACC	3	9	1212462	1212470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622924
18014	NC_010334	ACT	2	6	1212526	1212531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622924
18015	NC_010334	TCG	2	6	1212562	1212567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622924
18016	NC_010334	ATC	2	6	1212592	1212597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622924
18017	NC_010334	CTTAAA	2	12	1212633	1212644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167622924
18018	NC_010334	AG	3	6	1212742	1212747	50 %	0 %	50 %	0 %	167622924
18019	NC_010334	GCT	2	6	1212758	1212763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622924
18020	NC_010334	GAA	2	6	1212780	1212785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622924
18021	NC_010334	CTG	2	6	1213009	1213014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622925
18022	NC_010334	GGT	2	6	1213031	1213036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622925
18023	NC_010334	AAT	2	6	1213045	1213050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622925
18024	NC_010334	GCAC	2	8	1213061	1213068	25 %	0 %	25 %	50 %	167622925
18025	NC_010334	CCG	2	6	1213151	1213156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622925
18026	NC_010334	ATCA	2	8	1213177	1213184	50 %	25 %	0 %	25 %	167622925
18027	NC_010334	TTTTCA	2	12	1213259	1213270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167622925
18028	NC_010334	GCC	2	6	1213292	1213297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622925
18029	NC_010334	GCA	2	6	1213301	1213306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622925
18030	NC_010334	TCA	2	6	1213388	1213393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622925
18031	NC_010334	GTG	2	6	1213442	1213447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622925
18032	NC_010334	CAC	2	6	1213459	1213464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622925
18033	NC_010334	GCG	2	6	1213634	1213639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622925
18034	NC_010334	GTT	2	6	1213668	1213673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622925
18035	NC_010334	AGGT	2	8	1213750	1213757	25 %	25 %	50 %	0 %	167622925
18036	NC_010334	GCA	2	6	1213770	1213775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622925
18037	NC_010334	TTA	2	6	1213799	1213804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622925
18038	NC_010334	AGA	2	6	1213959	1213964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622925
18039	NC_010334	TTTA	2	8	1213966	1213973	25 %	75 %	0 %	0 %	167622925
18040	NC_010334	ATG	2	6	1214040	1214045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622925
18041	NC_010334	CAC	2	6	1214120	1214125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622925
18042	NC_010334	CTG	2	6	1214130	1214135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622925
18043	NC_010334	TCA	2	6	1214580	1214585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622926
18044	NC_010334	AG	3	6	1214786	1214791	50 %	0 %	50 %	0 %	167622926
18045	NC_010334	GT	3	6	1214805	1214810	0 %	50 %	50 %	0 %	167622926
18046	NC_010334	TGA	2	6	1214844	1214849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622926
18047	NC_010334	TTG	2	6	1214864	1214869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622926
18048	NC_010334	GCT	2	6	1214893	1214898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622926
18049	NC_010334	GCG	2	6	1215071	1215076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622926
18050	NC_010334	TGA	2	6	1215342	1215347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622926
18051	NC_010334	GCGG	2	8	1215389	1215396	0 %	0 %	75 %	25 %	167622926
18052	NC_010334	ATG	2	6	1215420	1215425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622926
18053	NC_010334	GGCT	2	8	1215496	1215503	0 %	25 %	50 %	25 %	167622926
18054	NC_010334	TGG	2	6	1215513	1215518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622926
18055	NC_010334	TGT	2	6	1215616	1215621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622926
18056	NC_010334	ACA	2	6	1215628	1215633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622926
18057	NC_010334	TA	3	6	1215653	1215658	50 %	50 %	0 %	0 %	167622926
18058	NC_010334	TGG	2	6	1215694	1215699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622926
18059	NC_010334	CGGG	2	8	1215720	1215727	0 %	0 %	75 %	25 %	167622926
18060	NC_010334	CGG	2	6	1215876	1215881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622926
18061	NC_010334	CTG	2	6	1215891	1215896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622926
18062	NC_010334	ATG	2	6	1215960	1215965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622926
18063	NC_010334	GCG	2	6	1215966	1215971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622926
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18065	NC_010334	TTGG	2	8	1216066	1216073	0 %	50 %	50 %	0 %	167622926
18066	NC_010334	CTG	2	6	1216375	1216380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622927
18067	NC_010334	GCCAA	2	10	1216415	1216424	40 %	0 %	20 %	40 %	167622927
18068	NC_010334	GCA	2	6	1216473	1216478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622927
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18070	NC_010334	TAC	2	6	1216547	1216552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622927
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18072	NC_010334	AG	3	6	1216603	1216608	50 %	0 %	50 %	0 %	167622927
18073	NC_010334	GA	3	6	1216641	1216646	50 %	0 %	50 %	0 %	167622927
18074	NC_010334	C	6	6	1216673	1216678	0 %	0 %	0 %	100 %	167622927
18075	NC_010334	TGA	2	6	1216697	1216702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622927
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18078	NC_010334	CAAA	2	8	1217073	1217080	75 %	0 %	0 %	25 %	167622927
18079	NC_010334	TG	4	8	1217091	1217098	0 %	50 %	50 %	0 %	167622927
18080	NC_010334	GGT	2	6	1217155	1217160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622927
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18082	NC_010334	AT	3	6	1217205	1217210	50 %	50 %	0 %	0 %	167622927
18083	NC_010334	AGC	2	6	1217251	1217256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622927
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18085	NC_010334	TTGA	2	8	1217359	1217366	25 %	50 %	25 %	0 %	167622927
18086	NC_010334	ATT	2	6	1217399	1217404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622927
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18088	NC_010334	ATG	2	6	1217443	1217448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622927
18089	NC_010334	AGA	2	6	1217540	1217545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622927
18090	NC_010334	TGA	2	6	1217804	1217809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622928
18091	NC_010334	GCTG	2	8	1217843	1217850	0 %	25 %	50 %	25 %	167622928
18092	NC_010334	CAT	2	6	1217888	1217893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622928
18093	NC_010334	ATTT	2	8	1217897	1217904	25 %	75 %	0 %	0 %	167622928
18094	NC_010334	ACT	3	9	1218028	1218036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622928
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18099	NC_010334	GCT	3	9	1218157	1218165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622928
18100	NC_010334	GT	3	6	1218166	1218171	0 %	50 %	50 %	0 %	167622928
18101	NC_010334	TAA	2	6	1218179	1218184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622928
18102	NC_010334	AGTC	3	12	1218307	1218318	25 %	25 %	25 %	25 %	167622929
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18105	NC_010334	GT	3	6	1218653	1218658	0 %	50 %	50 %	0 %	167622929
18106	NC_010334	CAT	2	6	1218754	1218759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622929
18107	NC_010334	GAT	2	6	1218764	1218769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622929
18108	NC_010334	GAGCT	2	10	1218792	1218801	20 %	20 %	40 %	20 %	167622929
18109	NC_010334	AGC	2	6	1218837	1218842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622929
18110	NC_010334	GTA	2	6	1218861	1218866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622929
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18112	NC_010334	TTA	2	6	1218977	1218982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622930
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18117	NC_010334	T	6	6	1219157	1219162	0 %	100 %	0 %	0 %	167622930
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18231	NC_010334	TGG	2	6	1227823	1227828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622937
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18234	NC_010334	GCT	2	6	1227925	1227930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622937
18235	NC_010334	GAA	2	6	1227990	1227995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622937
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18240	NC_010334	TAC	2	6	1228334	1228339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622938
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18334	NC_010334	TCT	2	6	1233525	1233530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622942
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18338	NC_010334	ATCTT	2	10	1235059	1235068	20 %	60 %	0 %	20 %	167622943
18339	NC_010334	GA	3	6	1235138	1235143	50 %	0 %	50 %	0 %	167622943
18340	NC_010334	TTG	2	6	1235155	1235160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622943
18341	NC_010334	CTTG	2	8	1235197	1235204	0 %	50 %	25 %	25 %	167622943
18342	NC_010334	CCA	2	6	1235238	1235243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622943
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18345	NC_010334	TCTT	2	8	1235407	1235414	0 %	75 %	0 %	25 %	167622943
18346	NC_010334	ACG	2	6	1235418	1235423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622943
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18348	NC_010334	CGAA	2	8	1235534	1235541	50 %	0 %	25 %	25 %	167622943
18349	NC_010334	TTC	2	6	1235583	1235588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622943
18350	NC_010334	TGC	2	6	1235603	1235608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622943
18351	NC_010334	TTC	2	6	1235641	1235646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622943
18352	NC_010334	CAT	2	6	1235709	1235714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
18353	NC_010334	CTT	2	6	1235891	1235896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622943
18354	NC_010334	CTT	2	6	1235924	1235929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622943
18355	NC_010334	TCA	3	9	1235932	1235940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
18356	NC_010334	TCA	2	6	1235944	1235949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
18357	NC_010334	TCA	2	6	1235953	1235958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
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18360	NC_010334	CGA	2	6	1236038	1236043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622943
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18362	NC_010334	ATC	2	6	1236106	1236111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
18363	NC_010334	CTT	2	6	1236161	1236166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622943
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18368	NC_010334	GCA	2	6	1236307	1236312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622943
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18371	NC_010334	TCA	2	6	1236346	1236351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
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18375	NC_010334	ATC	2	6	1236541	1236546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622943
18376	NC_010334	CTT	2	6	1236713	1236718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622944
18377	NC_010334	TTC	3	9	1236727	1236735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622944
18378	NC_010334	GTT	2	6	1236755	1236760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622944
18379	NC_010334	TGA	2	6	1236829	1236834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622944
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18455	NC_010334	GCTT	2	8	1242423	1242430	0 %	50 %	25 %	25 %	167622950
18456	NC_010334	GCG	2	6	1242464	1242469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622950
18457	NC_010334	TGA	2	6	1242475	1242480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622950
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18459	NC_010334	TGA	2	6	1242630	1242635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622950
18460	NC_010334	TGG	2	6	1242855	1242860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622951
18461	NC_010334	AAG	2	6	1242947	1242952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622951
18462	NC_010334	TTAGAT	2	12	1242968	1242979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167622951
18463	NC_010334	TGT	3	9	1242981	1242989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622951
18464	NC_010334	ACCC	2	8	1243091	1243098	25 %	0 %	0 %	75 %	167622951
18465	NC_010334	TGT	2	6	1243099	1243104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622951
18466	NC_010334	TTA	2	6	1243367	1243372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622952
18467	NC_010334	CGC	2	6	1243391	1243396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622952
18468	NC_010334	AG	3	6	1243456	1243461	50 %	0 %	50 %	0 %	167622952
18469	NC_010334	TGG	2	6	1243472	1243477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622952
18470	NC_010334	ATT	2	6	1243478	1243483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622952
18471	NC_010334	TTG	2	6	1243506	1243511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622952
18472	NC_010334	ACC	2	6	1243571	1243576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622952
18473	NC_010334	ATT	2	6	1243577	1243582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622952
18474	NC_010334	CTA	2	6	1243589	1243594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622952
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18481	NC_010334	GTCA	2	8	1244097	1244104	25 %	25 %	25 %	25 %	167622953
18482	NC_010334	A	6	6	1244201	1244206	100 %	0 %	0 %	0 %	167622953
18483	NC_010334	CTG	2	6	1244325	1244330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622953
18484	NC_010334	CTT	2	6	1244371	1244376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622953
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18486	NC_010334	TCA	2	6	1244830	1244835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622953
18487	NC_010334	TTA	2	6	1244877	1244882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622953
18488	NC_010334	TGA	2	6	1244886	1244891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622953
18489	NC_010334	AAT	2	6	1244898	1244903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622953
18490	NC_010334	TGA	2	6	1244954	1244959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622954
18491	NC_010334	TGT	2	6	1244972	1244977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622954
18492	NC_010334	CGT	2	6	1245069	1245074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622954
18493	NC_010334	TTC	2	6	1245088	1245093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622954
18494	NC_010334	CAATA	2	10	1245109	1245118	60 %	20 %	0 %	20 %	167622954
18495	NC_010334	TGC	2	6	1245209	1245214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622954
18496	NC_010334	AAG	2	6	1245287	1245292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622954
18497	NC_010334	AGCA	2	8	1245393	1245400	50 %	0 %	25 %	25 %	167622954
18498	NC_010334	GCG	2	6	1245425	1245430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622954
18499	NC_010334	CT	3	6	1245493	1245498	0 %	50 %	0 %	50 %	167622954
18500	NC_010334	TAT	2	6	1245639	1245644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622954

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