MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_010334	GGT	2	6	1142941	1142946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622863
17003	NC_010334	ATT	2	6	1142969	1142974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622863
17004	NC_010334	AGC	2	6	1143012	1143017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17005	NC_010334	AT	3	6	1143031	1143036	50 %	50 %	0 %	0 %	167622863
17006	NC_010334	GTC	2	6	1143062	1143067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17007	NC_010334	TCC	2	6	1143159	1143164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622863
17008	NC_010334	GCA	2	6	1143172	1143177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17009	NC_010334	GAGT	2	8	1143217	1143224	25 %	25 %	50 %	0 %	167622863
17010	NC_010334	ATG	2	6	1143500	1143505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622863
17011	NC_010334	ATTA	2	8	1143520	1143527	50 %	50 %	0 %	0 %	167622863
17012	NC_010334	GGC	3	9	1143565	1143573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622863
17013	NC_010334	CCA	2	6	1143626	1143631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622863
17014	NC_010334	GCT	2	6	1143646	1143651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17015	NC_010334	CGA	2	6	1143693	1143698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17016	NC_010334	GCCAAG	2	12	1143753	1143764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622863
17017	NC_010334	TTTA	2	8	1143901	1143908	25 %	75 %	0 %	0 %	167622864
17018	NC_010334	GAC	2	6	1143912	1143917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622864
17019	NC_010334	GCTG	2	8	1143927	1143934	0 %	25 %	50 %	25 %	167622864
17020	NC_010334	CTT	2	6	1144000	1144005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622864
17021	NC_010334	AAT	2	6	1144027	1144032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622864
17022	NC_010334	CTT	2	6	1144329	1144334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622864
17023	NC_010334	TCT	2	6	1144408	1144413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622864
17024	NC_010334	CAG	2	6	1144467	1144472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622864
17025	NC_010334	CAA	2	6	1144505	1144510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622864
17026	NC_010334	CG	3	6	1144527	1144532	0 %	0 %	50 %	50 %	167622864
17027	NC_010334	CTT	2	6	1144538	1144543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622864
17028	NC_010334	GCA	2	6	1144558	1144563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622864
17029	NC_010334	TCA	2	6	1144613	1144618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622864
17030	NC_010334	AGGC	2	8	1144635	1144642	25 %	0 %	50 %	25 %	167622864
17031	NC_010334	GCT	2	6	1144723	1144728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622864
17032	NC_010334	GCG	2	6	1144731	1144736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622864
17033	NC_010334	GC	3	6	1145044	1145049	0 %	0 %	50 %	50 %	167622864
17034	NC_010334	ATT	2	6	1145396	1145401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622865
17035	NC_010334	TCT	2	6	1145438	1145443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622865
17036	NC_010334	ATC	2	6	1145495	1145500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622865
17037	NC_010334	GCTG	2	8	1145524	1145531	0 %	25 %	50 %	25 %	167622865
17038	NC_010334	TAC	2	6	1145781	1145786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622866
17039	NC_010334	ACCG	2	8	1145860	1145867	25 %	0 %	25 %	50 %	167622866
17040	NC_010334	TCG	2	6	1145889	1145894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622866
17041	NC_010334	TGA	2	6	1145910	1145915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622866
17042	NC_010334	GCG	2	6	1146095	1146100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622866
17043	NC_010334	CGG	2	6	1146235	1146240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622866
17044	NC_010334	GCA	2	6	1146317	1146322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622866
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17046	NC_010334	ATGGT	2	10	1146459	1146468	20 %	40 %	40 %	0 %	167622866
17047	NC_010334	TTG	2	6	1146524	1146529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622866
17048	NC_010334	TGA	2	6	1146541	1146546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622866
17049	NC_010334	TCG	2	6	1146558	1146563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622866
17050	NC_010334	TGA	2	6	1146604	1146609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622866
17051	NC_010334	ATC	2	6	1146617	1146622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622866
17052	NC_010334	TGC	2	6	1146628	1146633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622866
17053	NC_010334	CTGC	2	8	1146671	1146678	0 %	25 %	25 %	50 %	167622866
17054	NC_010334	ATC	2	6	1146718	1146723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622866
17055	NC_010334	TGA	2	6	1146732	1146737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622866
17056	NC_010334	CTG	2	6	1146798	1146803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622866
17057	NC_010334	CGC	2	6	1146817	1146822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622866
17058	NC_010334	GGCT	2	8	1146884	1146891	0 %	25 %	50 %	25 %	167622866
17059	NC_010334	TGC	2	6	1147079	1147084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622867
17060	NC_010334	TCA	2	6	1147103	1147108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622867
17061	NC_010334	GGC	2	6	1147219	1147224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622867
17062	NC_010334	GAC	2	6	1147229	1147234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622867
17063	NC_010334	TGA	2	6	1147490	1147495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622867
17064	NC_010334	GAT	2	6	1147552	1147557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622867
17065	NC_010334	GAG	2	6	1147589	1147594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622867
17066	NC_010334	TGA	2	6	1147602	1147607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622867
17067	NC_010334	GAT	2	6	1147639	1147644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622867
17068	NC_010334	TGC	2	6	1147715	1147720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622867
17069	NC_010334	CAG	2	6	1147734	1147739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622867
17070	NC_010334	TC	3	6	1147745	1147750	0 %	50 %	0 %	50 %	167622867
17071	NC_010334	TCA	2	6	1147801	1147806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622867
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17075	NC_010334	AGC	2	6	1148050	1148055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622867
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17080	NC_010334	TGCTT	2	10	1148409	1148418	0 %	60 %	20 %	20 %	167622867
17081	NC_010334	TGA	2	6	1148426	1148431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622867
17082	NC_010334	GTG	2	6	1148449	1148454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622867
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17086	NC_010334	TGC	2	6	1148780	1148785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622868
17087	NC_010334	CCA	2	6	1148821	1148826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622868
17088	NC_010334	TCA	2	6	1148884	1148889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622868
17089	NC_010334	CTG	2	6	1148918	1148923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622868
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17091	NC_010334	TGG	2	6	1149012	1149017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622868
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17095	NC_010334	ATG	2	6	1149418	1149423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622869
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17099	NC_010334	TAC	2	6	1149717	1149722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622870
17100	NC_010334	CAT	2	6	1149783	1149788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622870
17101	NC_010334	GA	3	6	1149822	1149827	50 %	0 %	50 %	0 %	167622870
17102	NC_010334	ATA	2	6	1149836	1149841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622870
17103	NC_010334	ATG	2	6	1149900	1149905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622870
17104	NC_010334	AT	3	6	1149919	1149924	50 %	50 %	0 %	0 %	167622870
17105	NC_010334	TGG	2	6	1149962	1149967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622870
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17108	NC_010334	CATCT	2	10	1150108	1150117	20 %	40 %	0 %	40 %	167622870
17109	NC_010334	AAG	2	6	1150118	1150123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622870
17110	NC_010334	GCA	2	6	1150167	1150172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622870
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17112	NC_010334	GT	3	6	1150335	1150340	0 %	50 %	50 %	0 %	167622870
17113	NC_010334	TTGGC	2	10	1150346	1150355	0 %	40 %	40 %	20 %	167622870
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17115	NC_010334	AAT	2	6	1150433	1150438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622870
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17122	NC_010334	AATT	2	8	1150862	1150869	50 %	50 %	0 %	0 %	167622871
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17129	NC_010334	ATA	2	6	1151414	1151419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622871
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17131	NC_010334	ATC	2	6	1151530	1151535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622871
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17142	NC_010334	CGA	2	6	1152232	1152237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622873
17143	NC_010334	GCA	2	6	1152264	1152269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622873
17144	NC_010334	TGT	2	6	1152298	1152303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622873
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17228	NC_010334	ATG	2	6	1158841	1158846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622881
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17231	NC_010334	TGC	2	6	1158947	1158952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622881
17232	NC_010334	ACT	2	6	1158981	1158986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622881
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17462	NC_010334	CAA	2	6	1174894	1174899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622893
17463	NC_010334	TAT	2	6	1174951	1174956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622893
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17474	NC_010334	GCT	2	6	1175643	1175648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622893
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17488	NC_010334	CTG	2	6	1176852	1176857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622895
17489	NC_010334	ATC	2	6	1176864	1176869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622895
17490	NC_010334	ATG	2	6	1176871	1176876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622895
17491	NC_010334	TAT	2	6	1176985	1176990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622895
17492	NC_010334	GAC	2	6	1177063	1177068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622895
17493	NC_010334	TTG	2	6	1177077	1177082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622895
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17495	NC_010334	GTG	2	6	1177308	1177313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622895
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