MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_010334	CAG	2	6	1111045	1111050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622831
16502	NC_010334	AAG	2	6	1111057	1111062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622831
16503	NC_010334	ATG	3	9	1111630	1111638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622832
16504	NC_010334	TAA	2	6	1111646	1111651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622832
16505	NC_010334	CATA	2	8	1111742	1111749	50 %	25 %	0 %	25 %	167622832
16506	NC_010334	GAA	2	6	1111760	1111765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622832
16507	NC_010334	TGG	2	6	1111780	1111785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622832
16508	NC_010334	AG	3	6	1111854	1111859	50 %	0 %	50 %	0 %	167622832
16509	NC_010334	CAC	2	6	1111913	1111918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622832
16510	NC_010334	ATA	2	6	1111957	1111962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622832
16511	NC_010334	ATG	2	6	1111975	1111980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622832
16512	NC_010334	GCT	2	6	1112000	1112005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622832
16513	NC_010334	ACA	2	6	1112017	1112022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622832
16514	NC_010334	GCCT	2	8	1112026	1112033	0 %	25 %	25 %	50 %	167622832
16515	NC_010334	CGC	2	6	1112062	1112067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622832
16516	NC_010334	G	6	6	1112092	1112097	0 %	0 %	100 %	0 %	167622832
16517	NC_010334	CAC	2	6	1112230	1112235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622832
16518	NC_010334	CTT	2	6	1112240	1112245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622832
16519	NC_010334	ATT	2	6	1112307	1112312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622832
16520	NC_010334	CAA	2	6	1112367	1112372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622832
16521	NC_010334	CAT	2	6	1112399	1112404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622832
16522	NC_010334	TAG	2	6	1112426	1112431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622832
16523	NC_010334	GAT	2	6	1112463	1112468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622832
16524	NC_010334	GCA	2	6	1112472	1112477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622832
16525	NC_010334	TTGA	2	8	1112529	1112536	25 %	50 %	25 %	0 %	167622832
16526	NC_010334	GACG	2	8	1112588	1112595	25 %	0 %	50 %	25 %	167622832
16527	NC_010334	GCT	2	6	1112624	1112629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622832
16528	NC_010334	GTT	2	6	1112649	1112654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622832
16529	NC_010334	ATT	2	6	1112736	1112741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622833
16530	NC_010334	AATTA	2	10	1112797	1112806	60 %	40 %	0 %	0 %	167622833
16531	NC_010334	TCA	2	6	1112847	1112852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622833
16532	NC_010334	A	6	6	1113250	1113255	100 %	0 %	0 %	0 %	167622834
16533	NC_010334	TGA	2	6	1113275	1113280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16534	NC_010334	AG	3	6	1113346	1113351	50 %	0 %	50 %	0 %	167622834
16535	NC_010334	ATT	2	6	1113362	1113367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622834
16536	NC_010334	CT	3	6	1113435	1113440	0 %	50 %	0 %	50 %	167622834
16537	NC_010334	CAT	2	6	1113518	1113523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622834
16538	NC_010334	GA	3	6	1113533	1113538	50 %	0 %	50 %	0 %	167622834
16539	NC_010334	GAGC	2	8	1113561	1113568	25 %	0 %	50 %	25 %	167622834
16540	NC_010334	CATTT	2	10	1113622	1113631	20 %	60 %	0 %	20 %	167622834
16541	NC_010334	AGG	2	6	1113644	1113649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622834
16542	NC_010334	CGA	2	6	1113724	1113729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622834
16543	NC_010334	GCT	2	6	1113797	1113802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622834
16544	NC_010334	TAT	2	6	1113830	1113835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622834
16545	NC_010334	TAA	2	6	1113944	1113949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622834
16546	NC_010334	ATG	2	6	1113973	1113978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16547	NC_010334	TAT	2	6	1114055	1114060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622834
16548	NC_010334	GGC	2	6	1114091	1114096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622834
16549	NC_010334	ATG	2	6	1114099	1114104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16550	NC_010334	ATG	2	6	1114155	1114160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16551	NC_010334	TTAT	2	8	1114164	1114171	25 %	75 %	0 %	0 %	167622834
16552	NC_010334	GA	3	6	1114201	1114206	50 %	0 %	50 %	0 %	167622834
16553	NC_010334	GTG	2	6	1114210	1114215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622834
16554	NC_010334	TGCCAA	2	12	1114277	1114288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167622834
16555	NC_010334	GAT	2	6	1114362	1114367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16556	NC_010334	GCG	2	6	1114417	1114422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622834
16557	NC_010334	TTGA	2	8	1114581	1114588	25 %	50 %	25 %	0 %	167622834
16558	NC_010334	GGA	2	6	1114622	1114627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622834
16559	NC_010334	TGG	2	6	1114685	1114690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622834
16560	NC_010334	GTG	2	6	1114729	1114734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622834
16561	NC_010334	AGC	2	6	1114738	1114743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622834
16562	NC_010334	TGA	2	6	1114793	1114798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622834
16563	NC_010334	GTT	2	6	1114905	1114910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622834
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16565	NC_010334	CGC	2	6	1114979	1114984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622834
16566	NC_010334	CAG	2	6	1115016	1115021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622834
16567	NC_010334	CT	3	6	1115495	1115500	0 %	50 %	0 %	50 %	167622835
16568	NC_010334	AT	3	6	1115508	1115513	50 %	50 %	0 %	0 %	167622835
16569	NC_010334	GCG	2	6	1116171	1116176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622836
16570	NC_010334	TC	3	6	1116197	1116202	0 %	50 %	0 %	50 %	167622836
16571	NC_010334	TTAAG	2	10	1116248	1116257	40 %	40 %	20 %	0 %	167622836
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16575	NC_010334	ACCTA	2	10	1116366	1116375	40 %	20 %	0 %	40 %	167622836
16576	NC_010334	CCA	2	6	1116410	1116415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622836
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16580	NC_010334	CAT	2	6	1116714	1116719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622836
16581	NC_010334	TGA	2	6	1116776	1116781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622836
16582	NC_010334	GAT	2	6	1116798	1116803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622836
16583	NC_010334	CAA	2	6	1116814	1116819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622836
16584	NC_010334	GA	3	6	1116880	1116885	50 %	0 %	50 %	0 %	167622836
16585	NC_010334	GACT	2	8	1117134	1117141	25 %	25 %	25 %	25 %	167622837
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16588	NC_010334	A	6	6	1117271	1117276	100 %	0 %	0 %	0 %	167622837
16589	NC_010334	ATG	2	6	1117292	1117297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622837
16590	NC_010334	GTTG	2	8	1117360	1117367	0 %	50 %	50 %	0 %	167622837
16591	NC_010334	TGCC	2	8	1117383	1117390	0 %	25 %	25 %	50 %	167622837
16592	NC_010334	AGT	2	6	1117391	1117396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622837
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16594	NC_010334	CGTA	2	8	1117468	1117475	25 %	25 %	25 %	25 %	167622837
16595	NC_010334	AGAC	2	8	1117492	1117499	50 %	0 %	25 %	25 %	167622837
16596	NC_010334	CAT	2	6	1117616	1117621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622837
16597	NC_010334	AGTG	2	8	1117711	1117718	25 %	25 %	50 %	0 %	167622837
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16600	NC_010334	CGA	2	6	1118029	1118034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622837
16601	NC_010334	GCT	2	6	1118069	1118074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622837
16602	NC_010334	AAGTT	2	10	1118091	1118100	40 %	40 %	20 %	0 %	167622837
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16605	NC_010334	AGTC	2	8	1118362	1118369	25 %	25 %	25 %	25 %	167622838
16606	NC_010334	GTG	2	6	1118458	1118463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622838
16607	NC_010334	TTA	2	6	1118474	1118479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622838
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16611	NC_010334	AGCCA	2	10	1118788	1118797	40 %	0 %	20 %	40 %	167622838
16612	NC_010334	GCG	2	6	1118878	1118883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622838
16613	NC_010334	CGG	3	9	1118900	1118908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622838
16614	NC_010334	CAGT	2	8	1118918	1118925	25 %	25 %	25 %	25 %	167622838
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16616	NC_010334	CAT	2	6	1119012	1119017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622838
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16624	NC_010334	TGC	2	6	1119555	1119560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622838
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16964	NC_010334	GAT	2	6	1140677	1140682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622860
16965	NC_010334	AGC	2	6	1140791	1140796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622860
16966	NC_010334	GCTTG	2	10	1140828	1140837	0 %	40 %	40 %	20 %	167622860
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16987	NC_010334	GTG	2	6	1141881	1141886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622861
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16999	NC_010334	CAT	2	6	1142712	1142717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622862
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