MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_010334	TGT	2	6	1042448	1042453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622779
15503	NC_010334	CTA	2	6	1042626	1042631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622779
15504	NC_010334	CAA	2	6	1042723	1042728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622779
15505	NC_010334	GCGT	2	8	1042729	1042736	0 %	25 %	50 %	25 %	167622779
15506	NC_010334	CTT	2	6	1042759	1042764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622779
15507	NC_010334	ATT	2	6	1042912	1042917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622780
15508	NC_010334	GGT	2	6	1042977	1042982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622780
15509	NC_010334	CT	4	8	1043066	1043073	0 %	50 %	0 %	50 %	167622780
15510	NC_010334	TCG	2	6	1043084	1043089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622780
15511	NC_010334	TGA	2	6	1043171	1043176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622780
15512	NC_010334	GGAAAT	2	12	1043192	1043203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167622780
15513	NC_010334	T	6	6	1043397	1043402	0 %	100 %	0 %	0 %	167622780
15514	NC_010334	TCA	2	6	1043471	1043476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622780
15515	NC_010334	CCT	2	6	1043588	1043593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622780
15516	NC_010334	GGA	2	6	1043837	1043842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622780
15517	NC_010334	ATC	2	6	1043960	1043965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622781
15518	NC_010334	AG	3	6	1044069	1044074	50 %	0 %	50 %	0 %	167622781
15519	NC_010334	G	6	6	1044103	1044108	0 %	0 %	100 %	0 %	167622781
15520	NC_010334	GCA	2	6	1044129	1044134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15521	NC_010334	ATA	2	6	1044251	1044256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622781
15522	NC_010334	CTGC	2	8	1044301	1044308	0 %	25 %	25 %	50 %	167622781
15523	NC_010334	GTTC	2	8	1044333	1044340	0 %	50 %	25 %	25 %	167622781
15524	NC_010334	TTC	2	6	1044449	1044454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622781
15525	NC_010334	CTA	2	6	1044476	1044481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622781
15526	NC_010334	TGC	2	6	1044549	1044554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15527	NC_010334	TGT	2	6	1044558	1044563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622781
15528	NC_010334	TGG	2	6	1044573	1044578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622781
15529	NC_010334	GCA	2	6	1044587	1044592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15530	NC_010334	GGC	2	6	1044706	1044711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622781
15531	NC_010334	CAG	2	6	1044892	1044897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15532	NC_010334	A	7	7	1045003	1045009	100 %	0 %	0 %	0 %	167622781
15533	NC_010334	CGA	2	6	1045104	1045109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15534	NC_010334	ATG	2	6	1045220	1045225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622781
15535	NC_010334	AGC	2	6	1045226	1045231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622781
15536	NC_010334	AG	3	6	1045319	1045324	50 %	0 %	50 %	0 %	167622781
15537	NC_010334	AACT	2	8	1045383	1045390	50 %	25 %	0 %	25 %	167622781
15538	NC_010334	GGC	2	6	1045429	1045434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622781
15539	NC_010334	GGC	2	6	1045452	1045457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622781
15540	NC_010334	TGG	3	9	1045464	1045472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622781
15541	NC_010334	GCTC	2	8	1045486	1045493	0 %	25 %	25 %	50 %	167622781
15542	NC_010334	GCG	2	6	1045540	1045545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622781
15543	NC_010334	TTG	2	6	1045553	1045558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622781
15544	NC_010334	TAGC	2	8	1045566	1045573	25 %	25 %	25 %	25 %	167622781
15545	NC_010334	ATG	2	6	1045714	1045719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622782
15546	NC_010334	AGT	2	6	1045803	1045808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622782
15547	NC_010334	CTTA	2	8	1045823	1045830	25 %	50 %	0 %	25 %	167622782
15548	NC_010334	CCAC	2	8	1045849	1045856	25 %	0 %	0 %	75 %	167622782
15549	NC_010334	CGT	2	6	1045879	1045884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622782
15550	NC_010334	TGCTA	2	10	1045895	1045904	20 %	40 %	20 %	20 %	167622782
15551	NC_010334	GGC	2	6	1045914	1045919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622782
15552	NC_010334	A	7	7	1045992	1045998	100 %	0 %	0 %	0 %	167622782
15553	NC_010334	ATG	2	6	1046062	1046067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622782
15554	NC_010334	TTA	2	6	1046208	1046213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622782
15555	NC_010334	GCG	2	6	1046251	1046256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622782
15556	NC_010334	ACA	2	6	1046313	1046318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622782
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15558	NC_010334	TGA	2	6	1046678	1046683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622782
15559	NC_010334	GTG	2	6	1046701	1046706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622782
15560	NC_010334	TTTC	2	8	1046726	1046733	0 %	75 %	0 %	25 %	167622782
15561	NC_010334	T	6	6	1046838	1046843	0 %	100 %	0 %	0 %	167622782
15562	NC_010334	CGG	2	6	1046881	1046886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622782
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15567	NC_010334	CT	3	6	1046984	1046989	0 %	50 %	0 %	50 %	167622782
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15582	NC_010334	TGA	2	6	1047932	1047937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622783
15583	NC_010334	TGA	2	6	1047983	1047988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622783
15584	NC_010334	TGC	2	6	1048076	1048081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622783
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15587	NC_010334	TGAG	2	8	1048368	1048375	25 %	25 %	50 %	0 %	167622783
15588	NC_010334	CGC	2	6	1048445	1048450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622783
15589	NC_010334	AACCAT	2	12	1048452	1048463	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167622783
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15598	NC_010334	GGTT	2	8	1049708	1049715	0 %	50 %	50 %	0 %	167622784
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15601	NC_010334	CAC	2	6	1049913	1049918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622784
15602	NC_010334	TGC	3	9	1049935	1049943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622784
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15605	NC_010334	CTAAC	2	10	1050282	1050291	40 %	20 %	0 %	40 %	167622784
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15610	NC_010334	CCAG	2	8	1050547	1050554	25 %	0 %	25 %	50 %	167622784
15611	NC_010334	GAA	2	6	1050637	1050642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622784
15612	NC_010334	CAT	2	6	1050669	1050674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622784
15613	NC_010334	ACCT	2	8	1050693	1050700	25 %	25 %	0 %	50 %	167622784
15614	NC_010334	GGT	2	6	1050743	1050748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622784
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15616	NC_010334	GTA	2	6	1050866	1050871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622784
15617	NC_010334	CAAG	2	8	1050898	1050905	50 %	0 %	25 %	25 %	167622784
15618	NC_010334	GGC	2	6	1051004	1051009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622784
15619	NC_010334	GGC	2	6	1051049	1051054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622784
15620	NC_010334	CTG	2	6	1051058	1051063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622784
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15624	NC_010334	TGA	2	6	1051424	1051429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622785
15625	NC_010334	CTG	2	6	1051440	1051445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622785
15626	NC_010334	GATATC	2	12	1051485	1051496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622785
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15628	NC_010334	CATC	2	8	1051581	1051588	25 %	25 %	0 %	50 %	167622785
15629	NC_010334	ATG	2	6	1051594	1051599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622785
15630	NC_010334	CCA	2	6	1051606	1051611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785
15631	NC_010334	TTA	2	6	1051635	1051640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622785
15632	NC_010334	CAC	2	6	1051676	1051681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785
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15634	NC_010334	CAC	2	6	1051745	1051750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785
15635	NC_010334	CAG	2	6	1051773	1051778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622785
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15646	NC_010334	GATG	2	8	1053135	1053142	25 %	25 %	50 %	0 %	167622786
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15723	NC_010334	GAA	2	6	1058132	1058137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622791
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15728	NC_010334	GCTC	2	8	1058314	1058321	0 %	25 %	25 %	50 %	167622791
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