MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010334	TGA	2	6	936436	936441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622696
14002	NC_010334	GCC	2	6	936465	936470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622696
14003	NC_010334	GC	3	6	936488	936493	0 %	0 %	50 %	50 %	167622696
14004	NC_010334	GGT	2	6	936572	936577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622696
14005	NC_010334	ATT	2	6	936596	936601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622696
14006	NC_010334	GCTAGA	2	12	936679	936690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622696
14007	NC_010334	TTG	2	6	936732	936737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622696
14008	NC_010334	CGG	2	6	936834	936839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622696
14009	NC_010334	TGC	2	6	936893	936898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622696
14010	NC_010334	GTC	2	6	936996	937001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622696
14011	NC_010334	ATC	2	6	937052	937057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622696
14012	NC_010334	CGC	2	6	937060	937065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622696
14013	NC_010334	ACTA	2	8	937100	937107	50 %	25 %	0 %	25 %	167622696
14014	NC_010334	GTC	2	6	937251	937256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622696
14015	NC_010334	GGC	2	6	937265	937270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622696
14016	NC_010334	GCGG	2	8	937274	937281	0 %	0 %	75 %	25 %	167622696
14017	NC_010334	TGC	2	6	937291	937296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622696
14018	NC_010334	CGA	2	6	937398	937403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622696
14019	NC_010334	AGA	2	6	937435	937440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622696
14020	NC_010334	CCT	2	6	938022	938027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622697
14021	NC_010334	GCA	2	6	938030	938035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622697
14022	NC_010334	A	6	6	938035	938040	100 %	0 %	0 %	0 %	167622697
14023	NC_010334	CAAT	2	8	938051	938058	50 %	25 %	0 %	25 %	167622697
14024	NC_010334	TGG	2	6	938064	938069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622697
14025	NC_010334	TTG	2	6	938100	938105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622697
14026	NC_010334	AGT	2	6	938139	938144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622697
14027	NC_010334	TCA	2	6	938150	938155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622697
14028	NC_010334	GAT	2	6	938271	938276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622697
14029	NC_010334	T	6	6	938307	938312	0 %	100 %	0 %	0 %	167622697
14030	NC_010334	AGA	2	6	938351	938356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622697
14031	NC_010334	CAA	2	6	938468	938473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622697
14032	NC_010334	CGG	2	6	938506	938511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622697
14033	NC_010334	CGAT	2	8	938524	938531	25 %	25 %	25 %	25 %	167622697
14034	NC_010334	GTG	2	6	938550	938555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622697
14035	NC_010334	AAAT	2	8	938604	938611	75 %	25 %	0 %	0 %	167622697
14036	NC_010334	TCAT	2	8	939017	939024	25 %	50 %	0 %	25 %	167622698
14037	NC_010334	CTT	2	6	939039	939044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622698
14038	NC_010334	TGG	2	6	939082	939087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622698
14039	NC_010334	ATCT	2	8	939127	939134	25 %	50 %	0 %	25 %	167622698
14040	NC_010334	AAG	2	6	939147	939152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622698
14041	NC_010334	AGT	2	6	939164	939169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622698
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14043	NC_010334	CTG	2	6	939456	939461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622699
14044	NC_010334	ATTT	2	8	939616	939623	25 %	75 %	0 %	0 %	167622699
14045	NC_010334	GGC	2	6	939634	939639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622699
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14050	NC_010334	TGGCGC	2	12	940388	940399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167622700
14051	NC_010334	TTA	2	6	940498	940503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622700
14052	NC_010334	AGC	2	6	940543	940548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622700
14053	NC_010334	ATC	2	6	940591	940596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622700
14054	NC_010334	T	6	6	940635	940640	0 %	100 %	0 %	0 %	167622700
14055	NC_010334	AC	3	6	940668	940673	50 %	0 %	0 %	50 %	167622700
14056	NC_010334	TAT	2	6	940707	940712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622700
14057	NC_010334	CTA	2	6	940799	940804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622700
14058	NC_010334	CGAGT	2	10	940812	940821	20 %	20 %	40 %	20 %	167622700
14059	NC_010334	GCAGC	2	10	940936	940945	20 %	0 %	40 %	40 %	167622700
14060	NC_010334	GTC	2	6	940961	940966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622700
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14062	NC_010334	CGA	2	6	941028	941033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622700
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14064	NC_010334	CGG	2	6	941132	941137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622700
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14066	NC_010334	TTGC	2	8	941263	941270	0 %	50 %	25 %	25 %	167622700
14067	NC_010334	AGC	2	6	941273	941278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622700
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14091	NC_010334	AAAG	2	8	942606	942613	75 %	0 %	25 %	0 %	167622701
14092	NC_010334	AAG	2	6	942631	942636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622701
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14239	NC_010334	TGG	2	6	953311	953316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622708
14240	NC_010334	T	6	6	953351	953356	0 %	100 %	0 %	0 %	167622708
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14248	NC_010334	ATTC	2	8	953768	953775	25 %	50 %	0 %	25 %	167622708
14249	NC_010334	GGT	2	6	953801	953806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622708
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14252	NC_010334	CTT	2	6	953959	953964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622708
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14348	NC_010334	GTCA	2	8	959963	959970	25 %	25 %	25 %	25 %	167622712
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14350	NC_010334	AGTC	2	8	960233	960240	25 %	25 %	25 %	25 %	167622712
14351	NC_010334	ATC	2	6	960398	960403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622712
14352	NC_010334	TAA	2	6	960428	960433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622712
14353	NC_010334	A	6	6	960926	960931	100 %	0 %	0 %	0 %	167622713
14354	NC_010334	T	6	6	961015	961020	0 %	100 %	0 %	0 %	167622713
14355	NC_010334	ATG	2	6	961079	961084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622713
14356	NC_010334	GCG	2	6	961119	961124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622713
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14358	NC_010334	GCC	2	6	961155	961160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622713
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14362	NC_010334	TCG	2	6	961287	961292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622713
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14477	NC_010334	ATT	2	6	969536	969541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622717
14478	NC_010334	TTG	2	6	969579	969584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622717
14479	NC_010334	ATG	2	6	970624	970629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622718
14480	NC_010334	CTG	2	6	970646	970651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
14481	NC_010334	TGC	2	6	970680	970685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
14482	NC_010334	CTG	2	6	970706	970711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
14483	NC_010334	ATG	2	6	970829	970834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622718
14484	NC_010334	CGT	2	6	970867	970872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
14485	NC_010334	GTT	3	9	970888	970896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622718
14486	NC_010334	TATG	2	8	970902	970909	25 %	50 %	25 %	0 %	167622718
14487	NC_010334	TTA	2	6	970958	970963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622718
14488	NC_010334	GGC	2	6	971083	971088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622718
14489	NC_010334	TCA	2	6	971144	971149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622718
14490	NC_010334	CTA	2	6	971186	971191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622718
14491	NC_010334	TGC	2	6	971193	971198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
14492	NC_010334	GTG	2	6	971216	971221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622718
14493	NC_010334	GCT	3	9	971269	971277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622718
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14495	NC_010334	TGGTGT	2	12	971286	971297	0 %	50 %	50 %	0 %	167622718
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14497	NC_010334	TACA	2	8	971356	971363	50 %	25 %	0 %	25 %	167622718
14498	NC_010334	TGGT	2	8	971396	971403	0 %	50 %	50 %	0 %	167622718
14499	NC_010334	TTG	2	6	971447	971452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622718
14500	NC_010334	TGA	2	6	971502	971507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622718

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