MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010334	GAA	2	6	868163	868168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622645
13002	NC_010334	AAG	2	6	868173	868178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622645
13003	NC_010334	GTC	2	6	868201	868206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622645
13004	NC_010334	ATC	2	6	868328	868333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622645
13005	NC_010334	ACA	2	6	868552	868557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622645
13006	NC_010334	CAA	2	6	868745	868750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622645
13007	NC_010334	CGT	2	6	868759	868764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622645
13008	NC_010334	A	6	6	868829	868834	100 %	0 %	0 %	0 %	167622645
13009	NC_010334	GC	3	6	868837	868842	0 %	0 %	50 %	50 %	167622645
13010	NC_010334	TTC	2	6	868901	868906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622645
13011	NC_010334	GA	3	6	868966	868971	50 %	0 %	50 %	0 %	167622645
13012	NC_010334	AAC	2	6	868985	868990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622645
13013	NC_010334	CAT	2	6	869003	869008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622645
13014	NC_010334	AGCAG	2	10	869214	869223	40 %	0 %	40 %	20 %	167622646
13015	NC_010334	AGCA	2	8	869257	869264	50 %	0 %	25 %	25 %	167622646
13016	NC_010334	AGA	2	6	869274	869279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622646
13017	NC_010334	CAT	2	6	869409	869414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13018	NC_010334	GGC	2	6	869764	869769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622646
13019	NC_010334	CGC	3	9	869781	869789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622646
13020	NC_010334	AGA	2	6	869913	869918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622646
13021	NC_010334	CAT	2	6	869946	869951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13022	NC_010334	ATC	2	6	870004	870009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13023	NC_010334	AGC	2	6	870010	870015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13024	NC_010334	AGC	2	6	870033	870038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13025	NC_010334	AGA	2	6	870060	870065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622646
13026	NC_010334	AAC	2	6	870160	870165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622646
13027	NC_010334	CTTG	2	8	870297	870304	0 %	50 %	25 %	25 %	167622646
13028	NC_010334	AGCAAG	2	12	870314	870325	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167622646
13029	NC_010334	TGA	2	6	870417	870422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622646
13030	NC_010334	AAC	2	6	870556	870561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622646
13031	NC_010334	ATA	2	6	870698	870703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622646
13032	NC_010334	CGT	2	6	870732	870737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13033	NC_010334	ATG	2	6	870769	870774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622646
13034	NC_010334	ACTT	2	8	870991	870998	25 %	50 %	0 %	25 %	167622646
13035	NC_010334	GAA	2	6	871033	871038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622646
13036	NC_010334	GTC	2	6	871082	871087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13037	NC_010334	TAC	2	6	871145	871150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13038	NC_010334	TTC	2	6	871201	871206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622646
13039	NC_010334	GGC	2	6	871416	871421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622646
13040	NC_010334	ATTG	2	8	871443	871450	25 %	50 %	25 %	0 %	167622646
13041	NC_010334	GGT	2	6	871495	871500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622646
13042	NC_010334	TGC	2	6	871518	871523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13043	NC_010334	TGT	2	6	871542	871547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622646
13044	NC_010334	TGG	2	6	871620	871625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622646
13045	NC_010334	TTA	2	6	871665	871670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622646
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13049	NC_010334	TTG	2	6	871865	871870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622646
13050	NC_010334	GAA	2	6	871921	871926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622646
13051	NC_010334	GGT	2	6	872125	872130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622646
13052	NC_010334	TGC	2	6	872244	872249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13053	NC_010334	CAA	2	6	872259	872264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622646
13054	NC_010334	GAC	2	6	872301	872306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622646
13055	NC_010334	GCGA	2	8	872413	872420	25 %	0 %	50 %	25 %	167622646
13056	NC_010334	GGT	2	6	872455	872460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622646
13057	NC_010334	GTT	2	6	872479	872484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622646
13058	NC_010334	TAC	2	6	872609	872614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13059	NC_010334	AAC	2	6	872671	872676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622646
13060	NC_010334	AGC	2	6	872726	872731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622646
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13062	NC_010334	ATC	2	6	873088	873093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13063	NC_010334	TAC	2	6	873127	873132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13064	NC_010334	ATC	2	6	873151	873156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622646
13065	NC_010334	GTG	2	6	873161	873166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622646
13066	NC_010334	GAT	2	6	873345	873350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622646
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13068	NC_010334	AAGG	2	8	873493	873500	50 %	0 %	50 %	0 %	167622646
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13084	NC_010334	CGA	2	6	874316	874321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622647
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13089	NC_010334	CCA	2	6	874543	874548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622647
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13092	NC_010334	CGG	2	6	874685	874690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622647
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13101	NC_010334	CTG	2	6	875608	875613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622648
13102	NC_010334	CT	3	6	875618	875623	0 %	50 %	0 %	50 %	167622648
13103	NC_010334	TCGA	2	8	875634	875641	25 %	25 %	25 %	25 %	167622648
13104	NC_010334	CT	3	6	875679	875684	0 %	50 %	0 %	50 %	167622648
13105	NC_010334	ATA	2	6	875786	875791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622648
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13108	NC_010334	TCT	2	6	876077	876082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622648
13109	NC_010334	CCA	2	6	876119	876124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622648
13110	NC_010334	CTTG	2	8	876154	876161	0 %	50 %	25 %	25 %	167622648
13111	NC_010334	TGT	2	6	876214	876219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622648
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13115	NC_010334	TCT	2	6	876494	876499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622648
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13240	NC_010334	TGT	2	6	884581	884586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622655
13241	NC_010334	TGT	2	6	884593	884598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622655
13242	NC_010334	TCA	2	6	884647	884652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622655
13243	NC_010334	TCG	2	6	884766	884771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
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13245	NC_010334	GAT	2	6	884827	884832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622655
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13350	NC_010334	ACT	2	6	891865	891870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622660
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13352	NC_010334	GGA	2	6	892108	892113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622660
13353	NC_010334	GCT	2	6	892126	892131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622660
13354	NC_010334	TGAT	2	8	892215	892222	25 %	50 %	25 %	0 %	167622660
13355	NC_010334	AGTG	2	8	892225	892232	25 %	25 %	50 %	0 %	167622660
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13476	NC_010334	CGCTA	2	10	899643	899652	20 %	20 %	20 %	40 %	167622663
13477	NC_010334	CAAC	2	8	899740	899747	50 %	0 %	0 %	50 %	167622663
13478	NC_010334	TGA	2	6	899750	899755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622663
13479	NC_010334	ATA	2	6	899771	899776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622663
13480	NC_010334	CTT	2	6	899777	899782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622663
13481	NC_010334	TGG	2	6	899920	899925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622663
13482	NC_010334	CAG	2	6	899937	899942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622663
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