MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010334	CAG	2	6	832041	832046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622613
12502	NC_010334	AATTG	2	10	832370	832379	40 %	40 %	20 %	0 %	167622614
12503	NC_010334	TTC	2	6	832402	832407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622614
12504	NC_010334	ACT	2	6	832423	832428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622614
12505	NC_010334	CCA	2	6	832478	832483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622614
12506	NC_010334	GA	3	6	832533	832538	50 %	0 %	50 %	0 %	167622614
12507	NC_010334	AATGTG	2	12	832627	832638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622614
12508	NC_010334	AAAG	2	8	832655	832662	75 %	0 %	25 %	0 %	167622614
12509	NC_010334	CAA	2	6	832665	832670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622614
12510	NC_010334	CAG	2	6	832923	832928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622615
12511	NC_010334	CTT	2	6	832959	832964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622615
12512	NC_010334	GCTG	2	8	833093	833100	0 %	25 %	50 %	25 %	167622615
12513	NC_010334	GCA	2	6	833102	833107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622615
12514	NC_010334	GAG	2	6	833277	833282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622615
12515	NC_010334	TGA	2	6	833399	833404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622615
12516	NC_010334	CATAG	2	10	833936	833945	40 %	20 %	20 %	20 %	167622616
12517	NC_010334	TGC	2	6	834031	834036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622616
12518	NC_010334	GTA	2	6	834062	834067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622616
12519	NC_010334	CTT	2	6	834157	834162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622616
12520	NC_010334	GTT	2	6	834168	834173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622616
12521	NC_010334	ACC	2	6	834197	834202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622616
12522	NC_010334	TAACT	2	10	834218	834227	40 %	40 %	0 %	20 %	167622616
12523	NC_010334	GCT	2	6	834273	834278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622616
12524	NC_010334	GTA	2	6	834284	834289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622616
12525	NC_010334	ATC	2	6	834368	834373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622616
12526	NC_010334	AGT	2	6	834442	834447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622616
12527	NC_010334	CGC	2	6	834526	834531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622616
12528	NC_010334	AGTT	2	8	834634	834641	25 %	50 %	25 %	0 %	167622616
12529	NC_010334	AAC	2	6	834671	834676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622616
12530	NC_010334	TGT	2	6	834682	834687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622616
12531	NC_010334	GTT	2	6	834728	834733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622616
12532	NC_010334	GTT	2	6	834765	834770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622616
12533	NC_010334	GC	3	6	834835	834840	0 %	0 %	50 %	50 %	167622616
12534	NC_010334	AAG	2	6	834844	834849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622616
12535	NC_010334	ATC	2	6	835567	835572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622617
12536	NC_010334	TAGTG	2	10	835620	835629	20 %	40 %	40 %	0 %	167622617
12537	NC_010334	CTG	2	6	835681	835686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622617
12538	NC_010334	GTC	2	6	835768	835773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622617
12539	NC_010334	AAGT	2	8	835829	835836	50 %	25 %	25 %	0 %	167622617
12540	NC_010334	ACC	2	6	835891	835896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622617
12541	NC_010334	CGC	2	6	835929	835934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622617
12542	NC_010334	TAG	2	6	835982	835987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622617
12543	NC_010334	TGT	2	6	836037	836042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622617
12544	NC_010334	CTT	2	6	836067	836072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622617
12545	NC_010334	AGT	2	6	836136	836141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622617
12546	NC_010334	ACC	2	6	836221	836226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622617
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12549	NC_010334	GGC	2	6	836548	836553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622617
12550	NC_010334	TGG	2	6	836568	836573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622617
12551	NC_010334	CAGA	2	8	836574	836581	50 %	0 %	25 %	25 %	167622617
12552	NC_010334	T	7	7	836586	836592	0 %	100 %	0 %	0 %	167622617
12553	NC_010334	AAT	2	6	836981	836986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622618
12554	NC_010334	T	6	6	837059	837064	0 %	100 %	0 %	0 %	167622618
12555	NC_010334	GTT	2	6	837083	837088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622618
12556	NC_010334	CGG	2	6	837094	837099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622618
12557	NC_010334	AAG	2	6	837130	837135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622618
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12559	NC_010334	AGA	2	6	837295	837300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622618
12560	NC_010334	A	6	6	837341	837346	100 %	0 %	0 %	0 %	167622618
12561	NC_010334	GTG	2	6	837368	837373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622618
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12564	NC_010334	GGC	2	6	837461	837466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622618
12565	NC_010334	CGC	2	6	837584	837589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622618
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12570	NC_010334	TCT	2	6	838012	838017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622619
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12572	NC_010334	A	8	8	838035	838042	100 %	0 %	0 %	0 %	167622619
12573	NC_010334	TGC	2	6	838080	838085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622619
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12586	NC_010334	AAG	2	6	839735	839740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622621
12587	NC_010334	ACTC	2	8	839752	839759	25 %	25 %	0 %	50 %	167622621
12588	NC_010334	GCTA	2	8	839773	839780	25 %	25 %	25 %	25 %	167622621
12589	NC_010334	ATA	2	6	840021	840026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622621
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12592	NC_010334	TGG	2	6	841029	841034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622622
12593	NC_010334	CCT	2	6	841065	841070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622622
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12597	NC_010334	T	6	6	841333	841338	0 %	100 %	0 %	0 %	167622623
12598	NC_010334	TTG	2	6	841341	841346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622623
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12601	NC_010334	CAA	2	6	841643	841648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622623
12602	NC_010334	TAA	2	6	841826	841831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622623
12603	NC_010334	ACTC	2	8	841847	841854	25 %	25 %	0 %	50 %	167622623
12604	NC_010334	AAAG	2	8	841890	841897	75 %	0 %	25 %	0 %	167622623
12605	NC_010334	GAA	2	6	841909	841914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622623
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12607	NC_010334	A	7	7	842052	842058	100 %	0 %	0 %	0 %	167622623
12608	NC_010334	AAT	2	6	842083	842088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622623
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12610	NC_010334	ATATT	2	10	842168	842177	40 %	60 %	0 %	0 %	167622623
12611	NC_010334	TAT	2	6	842180	842185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622623
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12615	NC_010334	GAT	2	6	842790	842795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622624
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12979	NC_010334	TGC	2	6	866856	866861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622644
12980	NC_010334	GCA	2	6	866877	866882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622644
12981	NC_010334	CCA	2	6	866921	866926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622644
12982	NC_010334	AG	3	6	867062	867067	50 %	0 %	50 %	0 %	167622644
12983	NC_010334	CAA	2	6	867072	867077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622644
12984	NC_010334	GCC	2	6	867097	867102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622644
12985	NC_010334	TTGC	2	8	867131	867138	0 %	50 %	25 %	25 %	167622644
12986	NC_010334	TGC	2	6	867166	867171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622644
12987	NC_010334	ATC	2	6	867211	867216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622644
12988	NC_010334	AGC	2	6	867275	867280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622644
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12990	NC_010334	CGT	2	6	867474	867479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622644
12991	NC_010334	TGA	2	6	867508	867513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622644
12992	NC_010334	TGC	2	6	867542	867547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622644
12993	NC_010334	AG	3	6	867617	867622	50 %	0 %	50 %	0 %	167622644
12994	NC_010334	ATC	2	6	867625	867630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622644
12995	NC_010334	TC	3	6	867650	867655	0 %	50 %	0 %	50 %	167622644
12996	NC_010334	TTG	2	6	867661	867666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622644
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12999	NC_010334	T	7	7	867894	867900	0 %	100 %	0 %	0 %	167622644
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