MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010334	AGC	2	6	730308	730313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622544
11002	NC_010334	ACCCAG	2	12	730376	730387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167622544
11003	NC_010334	AGCT	2	8	730395	730402	25 %	25 %	25 %	25 %	167622544
11004	NC_010334	GC	3	6	730412	730417	0 %	0 %	50 %	50 %	167622544
11005	NC_010334	AGC	2	6	730449	730454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622544
11006	NC_010334	TG	3	6	730458	730463	0 %	50 %	50 %	0 %	167622544
11007	NC_010334	GAT	2	6	730475	730480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622544
11008	NC_010334	GCTTG	2	10	730484	730493	0 %	40 %	40 %	20 %	167622544
11009	NC_010334	TGG	2	6	730508	730513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622544
11010	NC_010334	TGG	2	6	730619	730624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622544
11011	NC_010334	AGT	2	6	730737	730742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622544
11012	NC_010334	ATC	2	6	731007	731012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622545
11013	NC_010334	GAA	2	6	731016	731021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622545
11014	NC_010334	GGC	2	6	731055	731060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622545
11015	NC_010334	ATC	2	6	731061	731066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622545
11016	NC_010334	CTC	2	6	731157	731162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622545
11017	NC_010334	CAC	2	6	731165	731170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622545
11018	NC_010334	CAC	2	6	731172	731177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622545
11019	NC_010334	CTG	2	6	731196	731201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622545
11020	NC_010334	CAA	2	6	731390	731395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622545
11021	NC_010334	ATG	2	6	731398	731403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622545
11022	NC_010334	GATT	2	8	731686	731693	25 %	50 %	25 %	0 %	167622546
11023	NC_010334	T	6	6	731826	731831	0 %	100 %	0 %	0 %	167622546
11024	NC_010334	TCG	2	6	731868	731873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622546
11025	NC_010334	CAG	2	6	731991	731996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622546
11026	NC_010334	AGCCT	2	10	732177	732186	20 %	20 %	20 %	40 %	167622546
11027	NC_010334	TCA	2	6	732290	732295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622546
11028	NC_010334	ATT	2	6	732370	732375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622546
11029	NC_010334	GGCTAA	2	12	732503	732514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622546
11030	NC_010334	GCG	2	6	732642	732647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622546
11031	NC_010334	TGA	2	6	732649	732654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622546
11032	NC_010334	GAT	2	6	732669	732674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622546
11033	NC_010334	TTA	2	6	732886	732891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622547
11034	NC_010334	TTG	2	6	732930	732935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622547
11035	NC_010334	GTCGA	2	10	732946	732955	20 %	20 %	40 %	20 %	167622547
11036	NC_010334	GATC	2	8	732965	732972	25 %	25 %	25 %	25 %	167622547
11037	NC_010334	GCG	2	6	733068	733073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622547
11038	NC_010334	TGA	2	6	733106	733111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622547
11039	NC_010334	GCA	2	6	733164	733169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622547
11040	NC_010334	GCA	2	6	733220	733225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622547
11041	NC_010334	GCC	2	6	733260	733265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622547
11042	NC_010334	ATG	2	6	733315	733320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622547
11043	NC_010334	TGC	2	6	733366	733371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622547
11044	NC_010334	CCT	2	6	733571	733576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622548
11045	NC_010334	GTAA	2	8	733630	733637	50 %	25 %	25 %	0 %	167622548
11046	NC_010334	CTA	2	6	733752	733757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622548
11047	NC_010334	GAG	2	6	733795	733800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622548
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11049	NC_010334	TTG	2	6	733931	733936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622548
11050	NC_010334	CAG	2	6	733961	733966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622548
11051	NC_010334	GAT	2	6	734085	734090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622548
11052	NC_010334	TGGCGA	2	12	734175	734186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167622548
11053	NC_010334	GAA	2	6	734264	734269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622548
11054	NC_010334	ATG	2	6	734290	734295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622548
11055	NC_010334	GCC	2	6	734350	734355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622548
11056	NC_010334	GAT	2	6	734356	734361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622548
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11058	NC_010334	TTGG	2	8	734776	734783	0 %	50 %	50 %	0 %	167622549
11059	NC_010334	CTA	2	6	734804	734809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622549
11060	NC_010334	TTGA	2	8	734823	734830	25 %	50 %	25 %	0 %	167622549
11061	NC_010334	GCG	2	6	734859	734864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622549
11062	NC_010334	TACGCT	2	12	734879	734890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622549
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11064	NC_010334	AGCC	2	8	734926	734933	25 %	0 %	25 %	50 %	167622549
11065	NC_010334	GCC	2	6	735015	735020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622549
11066	NC_010334	AGT	2	6	735056	735061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622549
11067	NC_010334	GAT	2	6	735078	735083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622549
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11071	NC_010334	GGTT	2	8	735265	735272	0 %	50 %	50 %	0 %	167622549
11072	NC_010334	TGG	2	6	735458	735463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622549
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11088	NC_010334	TGA	2	6	736312	736317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622549
11089	NC_010334	TAA	2	6	736374	736379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622549
11090	NC_010334	ATGC	2	8	736412	736419	25 %	25 %	25 %	25 %	167622549
11091	NC_010334	TCA	2	6	736444	736449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622549
11092	NC_010334	GCT	2	6	736508	736513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622549
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11097	NC_010334	TTGC	2	8	736803	736810	0 %	50 %	25 %	25 %	167622550
11098	NC_010334	AG	3	6	736837	736842	50 %	0 %	50 %	0 %	167622550
11099	NC_010334	GCG	2	6	736859	736864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622550
11100	NC_010334	CA	3	6	736984	736989	50 %	0 %	0 %	50 %	167622550
11101	NC_010334	TA	3	6	737031	737036	50 %	50 %	0 %	0 %	167622550
11102	NC_010334	GCA	2	6	737155	737160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622550
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11109	NC_010334	TGG	2	6	737984	737989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622551
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11113	NC_010334	T	6	6	738109	738114	0 %	100 %	0 %	0 %	167622551
11114	NC_010334	AG	3	6	738122	738127	50 %	0 %	50 %	0 %	167622551
11115	NC_010334	ACC	2	6	738210	738215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622551
11116	NC_010334	AG	3	6	738293	738298	50 %	0 %	50 %	0 %	167622551
11117	NC_010334	TAGC	2	8	738355	738362	25 %	25 %	25 %	25 %	167622551
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11119	NC_010334	CT	3	6	738464	738469	0 %	50 %	0 %	50 %	167622551
11120	NC_010334	CTA	2	6	738510	738515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622551
11121	NC_010334	AGC	2	6	738544	738549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622551
11122	NC_010334	TTG	2	6	738558	738563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622551
11123	NC_010334	AGA	2	6	738611	738616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622551
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11134	NC_010334	CTG	2	6	739138	739143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622552
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11225	NC_010334	ATC	2	6	745475	745480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622557
11226	NC_010334	GTG	2	6	745485	745490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622557
11227	NC_010334	AGT	2	6	745497	745502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622557
11228	NC_010334	CAT	2	6	745543	745548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622557
11229	NC_010334	TAG	2	6	745600	745605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622557
11230	NC_010334	TGA	2	6	745660	745665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622557
11231	NC_010334	CAG	2	6	745759	745764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622557
11232	NC_010334	AGC	2	6	745816	745821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622557
11233	NC_010334	GCG	2	6	745940	745945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622557
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11236	NC_010334	GTT	2	6	746276	746281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622558
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11238	NC_010334	CAT	2	6	746418	746423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622558
11239	NC_010334	TGA	2	6	746448	746453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622558
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11241	NC_010334	GAG	2	6	746509	746514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622558
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11243	NC_010334	CAT	2	6	746755	746760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622558
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11358	NC_010334	TCG	2	6	753242	753247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622563
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11477	NC_010334	TCA	2	6	761188	761193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622571
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11479	NC_010334	GTA	2	6	761609	761614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622571
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