MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_010334	AGC	2	6	5220304	5220309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626213
78003	NC_010334	CAAG	2	8	5220329	5220336	50 %	0 %	25 %	25 %	167626213
78004	NC_010334	GCT	2	6	5220357	5220362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626213
78005	NC_010334	AT	3	6	5220422	5220427	50 %	50 %	0 %	0 %	167626213
78006	NC_010334	GTT	2	6	5220473	5220478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626213
78007	NC_010334	TTG	2	6	5220589	5220594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626213
78008	NC_010334	AAC	3	9	5220600	5220608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626213
78009	NC_010334	GTG	2	6	5220646	5220651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626213
78010	NC_010334	CT	3	6	5220668	5220673	0 %	50 %	0 %	50 %	167626213
78011	NC_010334	TGA	2	6	5220713	5220718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626213
78012	NC_010334	TGA	2	6	5220737	5220742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626213
78013	NC_010334	AT	3	6	5220806	5220811	50 %	50 %	0 %	0 %	167626213
78014	NC_010334	TCCTTG	2	12	5220839	5220850	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167626213
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78016	NC_010334	GTT	2	6	5220877	5220882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626213
78017	NC_010334	AGA	2	6	5221369	5221374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626214
78018	NC_010334	AGT	2	6	5221422	5221427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626214
78019	NC_010334	CGA	2	6	5221444	5221449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626214
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78021	NC_010334	TAA	2	6	5221493	5221498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626214
78022	NC_010334	A	6	6	5221571	5221576	100 %	0 %	0 %	0 %	167626214
78023	NC_010334	TAG	2	6	5221595	5221600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626214
78024	NC_010334	TTAC	2	8	5221602	5221609	25 %	50 %	0 %	25 %	167626214
78025	NC_010334	CAG	2	6	5221669	5221674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626214
78026	NC_010334	GTA	2	6	5221732	5221737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626214
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78028	NC_010334	GCT	2	6	5221785	5221790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626214
78029	NC_010334	T	6	6	5221847	5221852	0 %	100 %	0 %	0 %	167626214
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78031	NC_010334	CGA	2	6	5221915	5221920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626214
78032	NC_010334	GTA	2	6	5221939	5221944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626214
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78035	NC_010334	AAGT	2	8	5222865	5222872	50 %	25 %	25 %	0 %	167626215
78036	NC_010334	GCT	2	6	5222874	5222879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626215
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78042	NC_010334	GTG	3	9	5223154	5223162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626215
78043	NC_010334	CG	3	6	5223210	5223215	0 %	0 %	50 %	50 %	167626215
78044	NC_010334	T	6	6	5223227	5223232	0 %	100 %	0 %	0 %	167626215
78045	NC_010334	CGG	2	6	5223242	5223247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626215
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78050	NC_010334	CTA	2	6	5223596	5223601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626215
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78052	NC_010334	TGG	2	6	5223668	5223673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626215
78053	NC_010334	TCAT	2	8	5223721	5223728	25 %	50 %	0 %	25 %	167626215
78054	NC_010334	CCG	2	6	5223820	5223825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626215
78055	NC_010334	CGC	2	6	5223908	5223913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626215
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78084	NC_010334	ATC	2	6	5225131	5225136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626216
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78102	NC_010334	T	6	6	5226231	5226236	0 %	100 %	0 %	0 %	167626218
78103	NC_010334	GTT	2	6	5226275	5226280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626218
78104	NC_010334	GGA	2	6	5226315	5226320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626218

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.