MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_010334	GAT	2	6	5151691	5151696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626148
77002	NC_010334	CG	3	6	5151702	5151707	0 %	0 %	50 %	50 %	167626148
77003	NC_010334	AGCA	2	8	5151717	5151724	50 %	0 %	25 %	25 %	167626148
77004	NC_010334	CAC	2	6	5151761	5151766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626149
77005	NC_010334	CCA	2	6	5151803	5151808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626149
77006	NC_010334	CTG	2	6	5151834	5151839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626149
77007	NC_010334	CT	3	6	5151841	5151846	0 %	50 %	0 %	50 %	167626149
77008	NC_010334	CAA	2	6	5151858	5151863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626149
77009	NC_010334	GAT	2	6	5151895	5151900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626149
77010	NC_010334	CA	3	6	5152004	5152009	50 %	0 %	0 %	50 %	167626149
77011	NC_010334	GCT	2	6	5152097	5152102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626149
77012	NC_010334	TGC	2	6	5152187	5152192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626149
77013	NC_010334	TATCGA	2	12	5152215	5152226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626150
77014	NC_010334	GTT	2	6	5152293	5152298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626150
77015	NC_010334	TGC	2	6	5152715	5152720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626151
77016	NC_010334	GCG	2	6	5152760	5152765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626151
77017	NC_010334	CAC	2	6	5152812	5152817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626151
77018	NC_010334	CAAT	2	8	5152888	5152895	50 %	25 %	0 %	25 %	167626151
77019	NC_010334	CAC	2	6	5152916	5152921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626151
77020	NC_010334	TTG	2	6	5153145	5153150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626151
77021	NC_010334	TTC	2	6	5153166	5153171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626151
77022	NC_010334	AAC	2	6	5153176	5153181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626151
77023	NC_010334	TGCT	2	8	5153190	5153197	0 %	50 %	25 %	25 %	167626151
77024	NC_010334	CTG	2	6	5153238	5153243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626151
77025	NC_010334	GAG	2	6	5153265	5153270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626151
77026	NC_010334	GCA	2	6	5153470	5153475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626152
77027	NC_010334	GA	3	6	5153525	5153530	50 %	0 %	50 %	0 %	167626152
77028	NC_010334	GCTA	2	8	5153595	5153602	25 %	25 %	25 %	25 %	167626152
77029	NC_010334	AGCA	2	8	5153656	5153663	50 %	0 %	25 %	25 %	167626152
77030	NC_010334	TGCGGG	2	12	5153790	5153801	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167626153
77031	NC_010334	TGA	2	6	5153877	5153882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626153
77032	NC_010334	AAG	2	6	5153933	5153938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626153
77033	NC_010334	CAC	2	6	5153990	5153995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626153
77034	NC_010334	ATC	2	6	5154017	5154022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626153
77035	NC_010334	GAG	2	6	5154073	5154078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626153
77036	NC_010334	ATG	2	6	5154088	5154093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626153
77037	NC_010334	CAGC	2	8	5154095	5154102	25 %	0 %	25 %	50 %	167626153
77038	NC_010334	GCA	2	6	5154150	5154155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626153
77039	NC_010334	AAT	2	6	5154179	5154184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626153
77040	NC_010334	AAT	2	6	5154210	5154215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626154
77041	NC_010334	TAA	2	6	5154224	5154229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626154
77042	NC_010334	TGA	2	6	5154286	5154291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626154
77043	NC_010334	TC	3	6	5154364	5154369	0 %	50 %	0 %	50 %	167626154
77044	NC_010334	GC	3	6	5154392	5154397	0 %	0 %	50 %	50 %	167626154
77045	NC_010334	CAG	2	6	5154533	5154538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626154
77046	NC_010334	TGA	2	6	5154569	5154574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626154
77047	NC_010334	AAG	2	6	5154613	5154618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626154
77048	NC_010334	A	6	6	5154748	5154753	100 %	0 %	0 %	0 %	167626154
77049	NC_010334	ATG	3	9	5154777	5154785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626154
77050	NC_010334	CA	3	6	5154906	5154911	50 %	0 %	0 %	50 %	167626155
77051	NC_010334	TAA	2	6	5154930	5154935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626155
77052	NC_010334	CGG	2	6	5154999	5155004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626155
77053	NC_010334	TGA	2	6	5155025	5155030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626155
77054	NC_010334	CGG	2	6	5155053	5155058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626155
77055	NC_010334	GTC	2	6	5155076	5155081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626155
77056	NC_010334	CTT	2	6	5155110	5155115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626155
77057	NC_010334	GCA	2	6	5155136	5155141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626155
77058	NC_010334	TGA	2	6	5155383	5155388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626155
77059	NC_010334	TAC	2	6	5155462	5155467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626155
77060	NC_010334	ATG	2	6	5155504	5155509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626155
77061	NC_010334	GGC	2	6	5155534	5155539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626155
77062	NC_010334	CGG	2	6	5155620	5155625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626155
77063	NC_010334	AAC	2	6	5155687	5155692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626155
77064	NC_010334	GAT	2	6	5155747	5155752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626155
77065	NC_010334	AGC	2	6	5155790	5155795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626155
77066	NC_010334	CAA	2	6	5155854	5155859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626155
77067	NC_010334	CAA	2	6	5155871	5155876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626155
77068	NC_010334	GGC	2	6	5155936	5155941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626155
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77070	NC_010334	GCA	2	6	5156049	5156054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626155
77071	NC_010334	AT	3	6	5156098	5156103	50 %	50 %	0 %	0 %	167626156
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77073	NC_010334	GCA	2	6	5156119	5156124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626156
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77075	NC_010334	CTG	2	6	5156366	5156371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626156
77076	NC_010334	TGA	2	6	5156502	5156507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626156
77077	NC_010334	CAT	2	6	5156520	5156525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626156
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77081	NC_010334	CGC	2	6	5156718	5156723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626156
77082	NC_010334	GCC	2	6	5156735	5156740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626156
77083	NC_010334	TGA	2	6	5156762	5156767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626156
77084	NC_010334	ACC	2	6	5156916	5156921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626157
77085	NC_010334	CAA	2	6	5156927	5156932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626157
77086	NC_010334	TGG	2	6	5157014	5157019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626157
77087	NC_010334	GAAT	2	8	5157035	5157042	50 %	25 %	25 %	0 %	167626157
77088	NC_010334	GTC	2	6	5157078	5157083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626157
77089	NC_010334	ACCA	2	8	5157123	5157130	50 %	0 %	0 %	50 %	167626157
77090	NC_010334	AGCTA	2	10	5157190	5157199	40 %	20 %	20 %	20 %	167626157
77091	NC_010334	GAA	2	6	5157288	5157293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626157
77092	NC_010334	CAGA	2	8	5157348	5157355	50 %	0 %	25 %	25 %	167626157
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77096	NC_010334	GC	3	6	5157569	5157574	0 %	0 %	50 %	50 %	167626157
77097	NC_010334	GAC	2	6	5157609	5157614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626157
77098	NC_010334	TCAA	2	8	5157628	5157635	50 %	25 %	0 %	25 %	167626157
77099	NC_010334	TAC	2	6	5157750	5157755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626158
77100	NC_010334	CAC	2	6	5157816	5157821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626158
77101	NC_010334	GC	3	6	5157904	5157909	0 %	0 %	50 %	50 %	167626158
77102	NC_010334	ACG	2	6	5158022	5158027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626158
77103	NC_010334	CAG	2	6	5158033	5158038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626158
77104	NC_010334	GCG	2	6	5158050	5158055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626158
77105	NC_010334	CTG	2	6	5158163	5158168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626158
77106	NC_010334	TGA	2	6	5158204	5158209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626158
77107	NC_010334	GAT	2	6	5158241	5158246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626158
77108	NC_010334	ACA	2	6	5158257	5158262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626158
77109	NC_010334	TCA	2	6	5158268	5158273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626158
77110	NC_010334	GGT	2	6	5158304	5158309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626158
77111	NC_010334	TGGGC	2	10	5158338	5158347	0 %	20 %	60 %	20 %	167626158
77112	NC_010334	CGCT	2	8	5158348	5158355	0 %	25 %	25 %	50 %	167626158
77113	NC_010334	ATC	2	6	5158384	5158389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626158
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77115	NC_010334	AGTC	2	8	5158617	5158624	25 %	25 %	25 %	25 %	167626159
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77230	NC_010334	GA	3	6	5166702	5166707	50 %	0 %	50 %	0 %	167626166
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77463	NC_010334	CAC	2	6	5186850	5186855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626183
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77466	NC_010334	TAT	2	6	5186979	5186984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626183
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77488	NC_010334	A	6	6	5188326	5188331	100 %	0 %	0 %	0 %	167626185
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77492	NC_010334	ATT	2	6	5189333	5189338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626186
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