MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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68002	NC_010334	TCTTT	2	10	4553269	4553278	0 %	80 %	0 %	20 %	167625656
68003	NC_010334	GTAC	2	8	4553290	4553297	25 %	25 %	25 %	25 %	167625656
68004	NC_010334	TCA	2	6	4553380	4553385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
68005	NC_010334	TGT	2	6	4553393	4553398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625656
68006	NC_010334	TTA	2	6	4553404	4553409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625656
68007	NC_010334	ATC	2	6	4553488	4553493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
68008	NC_010334	TCAA	2	8	4553506	4553513	50 %	25 %	0 %	25 %	167625656
68009	NC_010334	ATC	2	6	4553593	4553598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
68010	NC_010334	ATC	3	9	4553704	4553712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
68011	NC_010334	TAA	2	6	4553744	4553749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
68012	NC_010334	AAT	2	6	4553793	4553798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
68013	NC_010334	TGCTGT	2	12	4553830	4553841	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167625656
68014	NC_010334	ACC	2	6	4553898	4553903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625656
68015	NC_010334	AACC	2	8	4553973	4553980	50 %	0 %	0 %	50 %	167625656
68016	NC_010334	GA	3	6	4554021	4554026	50 %	0 %	50 %	0 %	167625656
68017	NC_010334	TGG	2	6	4554060	4554065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625656
68018	NC_010334	ATA	3	9	4554124	4554132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
68019	NC_010334	TTA	2	6	4554137	4554142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625656
68020	NC_010334	TAT	2	6	4554671	4554676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625657
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68022	NC_010334	TGA	3	9	4554785	4554793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625657
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68024	NC_010334	TCAAC	2	10	4554875	4554884	40 %	20 %	0 %	40 %	167625657
68025	NC_010334	CAA	2	6	4554887	4554892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625657
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68028	NC_010334	CTTC	2	8	4555001	4555008	0 %	50 %	0 %	50 %	167625657
68029	NC_010334	AAC	2	6	4555062	4555067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625657
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68031	NC_010334	TCAA	2	8	4555138	4555145	50 %	25 %	0 %	25 %	167625657
68032	NC_010334	TGC	2	6	4555172	4555177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625657
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68034	NC_010334	GC	3	6	4555408	4555413	0 %	0 %	50 %	50 %	167625657
68035	NC_010334	ATA	2	6	4555440	4555445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625657
68036	NC_010334	TAA	2	6	4555518	4555523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625657
68037	NC_010334	ATG	2	6	4555629	4555634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625658
68038	NC_010334	TAG	2	6	4555683	4555688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625658
68039	NC_010334	AGT	2	6	4555754	4555759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625658
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68041	NC_010334	GCA	2	6	4555840	4555845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625658
68042	NC_010334	TGA	2	6	4556004	4556009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625658
68043	NC_010334	TTGGT	2	10	4556031	4556040	0 %	60 %	40 %	0 %	167625658
68044	NC_010334	TGCCTA	2	12	4556077	4556088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167625658
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68052	NC_010334	GCA	2	6	4556637	4556642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625659
68053	NC_010334	TAGC	2	8	4556745	4556752	25 %	25 %	25 %	25 %	167625659
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68056	NC_010334	GTT	2	6	4556998	4557003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625659
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68058	NC_010334	TGA	2	6	4557059	4557064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625659
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68082	NC_010334	GTC	2	6	4558364	4558369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625660
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68106	NC_010334	GCTCT	2	10	4559485	4559494	0 %	40 %	20 %	40 %	167625660
68107	NC_010334	CT	4	8	4559491	4559498	0 %	50 %	0 %	50 %	167625660
68108	NC_010334	GCT	2	6	4559551	4559556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625660
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68111	NC_010334	T	6	6	4559706	4559711	0 %	100 %	0 %	0 %	167625660
68112	NC_010334	CCAG	2	8	4559732	4559739	25 %	0 %	25 %	50 %	167625660
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68114	NC_010334	TCG	2	6	4559901	4559906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625660
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68467	NC_010334	GTT	2	6	4585376	4585381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625681
68468	NC_010334	CAA	2	6	4585384	4585389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625681
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68470	NC_010334	TTGC	2	8	4585506	4585513	0 %	50 %	25 %	25 %	167625681
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68472	NC_010334	CTT	2	6	4585552	4585557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625681
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68482	NC_010334	ACG	2	6	4585925	4585930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625681
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68494	NC_010334	TCT	2	6	4586589	4586594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625681
68495	NC_010334	TAC	2	6	4586663	4586668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625681
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68497	NC_010334	CTT	2	6	4586764	4586769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625681
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68500	NC_010334	TCT	2	6	4586928	4586933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625682

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