MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_010334	GGC	2	6	397489	397494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622274
6003	NC_010334	GGTT	2	8	397499	397506	0 %	50 %	50 %	0 %	167622274
6004	NC_010334	TATG	2	8	397510	397517	25 %	50 %	25 %	0 %	167622274
6005	NC_010334	GAA	2	6	397520	397525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622274
6006	NC_010334	GTG	2	6	397560	397565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622274
6007	NC_010334	TGA	2	6	397612	397617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622274
6008	NC_010334	TAC	2	6	397712	397717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622274
6009	NC_010334	GTTA	2	8	397780	397787	25 %	50 %	25 %	0 %	167622274
6010	NC_010334	AGA	2	6	397798	397803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622274
6011	NC_010334	TGA	2	6	397828	397833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622274
6012	NC_010334	TCA	2	6	397900	397905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622274
6013	NC_010334	CCAT	2	8	397911	397918	25 %	25 %	0 %	50 %	167622274
6014	NC_010334	AGA	2	6	397954	397959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622274
6015	NC_010334	ATT	2	6	398026	398031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622274
6016	NC_010334	CTG	2	6	398040	398045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622274
6017	NC_010334	GTG	2	6	398070	398075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622274
6018	NC_010334	TAT	2	6	398341	398346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622275
6019	NC_010334	TGC	2	6	398383	398388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622275
6020	NC_010334	CAG	2	6	398391	398396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622275
6021	NC_010334	GAT	2	6	398402	398407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622275
6022	NC_010334	TGG	2	6	398416	398421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622275
6023	NC_010334	ATT	2	6	398451	398456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622275
6024	NC_010334	TCT	2	6	398462	398467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622275
6025	NC_010334	TGG	2	6	398629	398634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622275
6026	NC_010334	TAA	2	6	398656	398661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622275
6027	NC_010334	TGG	2	6	398681	398686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622275
6028	NC_010334	ATT	2	6	398697	398702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622275
6029	NC_010334	GAT	2	6	398717	398722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622275
6030	NC_010334	TTA	2	6	398781	398786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622275
6031	NC_010334	CGGTA	2	10	398827	398836	20 %	20 %	40 %	20 %	167622275
6032	NC_010334	GAA	2	6	398873	398878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622275
6033	NC_010334	TGCAC	2	10	399010	399019	20 %	20 %	20 %	40 %	167622275
6034	NC_010334	ATG	3	9	399084	399092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622275
6035	NC_010334	GGT	2	6	399131	399136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622275
6036	NC_010334	CTT	2	6	399198	399203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622275
6037	NC_010334	AGA	2	6	399253	399258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622275
6038	NC_010334	TGA	2	6	399262	399267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622275
6039	NC_010334	TATT	2	8	399312	399319	25 %	75 %	0 %	0 %	167622275
6040	NC_010334	TGG	2	6	399358	399363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622275
6041	NC_010334	GAT	3	9	399389	399397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622275
6042	NC_010334	TTA	2	6	399427	399432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622275
6043	NC_010334	TTA	2	6	399597	399602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622276
6044	NC_010334	TGT	2	6	399718	399723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622276
6045	NC_010334	GAT	2	6	399737	399742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622276
6046	NC_010334	CGT	2	6	399978	399983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622276
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6050	NC_010334	TCA	2	6	400221	400226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622276
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6052	NC_010334	CTT	2	6	400349	400354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622276
6053	NC_010334	GCA	2	6	400598	400603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622277
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6055	NC_010334	CGT	2	6	400668	400673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622277
6056	NC_010334	GTG	2	6	400746	400751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622277
6057	NC_010334	GA	3	6	400785	400790	50 %	0 %	50 %	0 %	167622277
6058	NC_010334	GAC	2	6	400800	400805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622277
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6060	NC_010334	TAT	2	6	400886	400891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622277
6061	NC_010334	ATT	2	6	400916	400921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622277
6062	NC_010334	GAT	2	6	400935	400940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622277
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6067	NC_010334	CGC	2	6	401225	401230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622277
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6069	NC_010334	ATT	2	6	401294	401299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622278
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6071	NC_010334	CT	3	6	401375	401380	0 %	50 %	0 %	50 %	167622278
6072	NC_010334	TCG	2	6	401436	401441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622278
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6091	NC_010334	TGC	2	6	402510	402515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622278
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6106	NC_010334	GTTT	2	8	403086	403093	0 %	75 %	25 %	0 %	167622279
6107	NC_010334	GCA	2	6	403138	403143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622279
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6117	NC_010334	TTGC	2	8	403562	403569	0 %	50 %	25 %	25 %	167622280
6118	NC_010334	TAT	2	6	403587	403592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622280
6119	NC_010334	TCA	3	9	403651	403659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622280
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6121	NC_010334	AGA	2	6	403731	403736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622280
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6237	NC_010334	GTACC	2	10	410925	410934	20 %	20 %	20 %	40 %	167622287
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6241	NC_010334	CAA	2	6	411147	411152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622287
6242	NC_010334	GCT	2	6	411159	411164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622287
6243	NC_010334	TGGGT	2	10	411296	411305	0 %	40 %	60 %	0 %	167622287
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6245	NC_010334	TAC	2	6	411488	411493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622288
6246	NC_010334	TCGAT	2	10	411521	411530	20 %	40 %	20 %	20 %	167622288
6247	NC_010334	CGA	2	6	411599	411604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622288
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6250	NC_010334	GAT	2	6	412343	412348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622289
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6254	NC_010334	AGT	3	9	412546	412554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622289
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6256	NC_010334	TAG	2	6	412595	412600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622289
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6261	NC_010334	CT	3	6	413123	413128	0 %	50 %	0 %	50 %	167622290
6262	NC_010334	TA	3	6	413135	413140	50 %	50 %	0 %	0 %	167622290
6263	NC_010334	CTT	2	6	413197	413202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622290
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6265	NC_010334	TTG	2	6	413237	413242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622290
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6352	NC_010334	GGT	2	6	418695	418700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622295
6353	NC_010334	TCTA	2	8	418715	418722	25 %	50 %	0 %	25 %	167622295
6354	NC_010334	TAC	2	6	418738	418743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622295
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6485	NC_010334	TCG	2	6	427354	427359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622302
6486	NC_010334	CTGG	2	8	427363	427370	0 %	25 %	50 %	25 %	167622302
6487	NC_010334	TGT	2	6	427431	427436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622302
6488	NC_010334	GTA	2	6	427464	427469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622302
6489	NC_010334	TCTG	2	8	427492	427499	0 %	50 %	25 %	25 %	167622302
6490	NC_010334	GTG	2	6	427527	427532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622302
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6492	NC_010334	CGAG	2	8	427597	427604	25 %	0 %	50 %	25 %	167622302
6493	NC_010334	GCT	2	6	427608	427613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622302
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6497	NC_010334	GCG	2	6	427770	427775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622302
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