MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010102	CG	3	6	177987	177992	0 %	0 %	50 %	50 %	161612506
3502	NC_010102	GCG	3	9	177990	177998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612506
3503	NC_010102	GCT	2	6	178129	178134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3504	NC_010102	GCG	2	6	178135	178140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612506
3505	NC_010102	TGC	2	6	178179	178184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3506	NC_010102	TGC	3	9	178194	178202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3507	NC_010102	TGC	3	9	178227	178235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3508	NC_010102	CG	3	6	178248	178253	0 %	0 %	50 %	50 %	161612506
3509	NC_010102	ATT	2	6	178283	178288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612506
3510	NC_010102	TTG	2	6	178310	178315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612506
3511	NC_010102	AAG	2	6	178360	178365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612506
3512	NC_010102	TGC	2	6	178440	178445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3513	NC_010102	CGC	2	6	178459	178464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612506
3514	NC_010102	TGG	2	6	178471	178476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612506
3515	NC_010102	TAT	2	6	178498	178503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612506
3516	NC_010102	TGC	2	6	178539	178544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3517	NC_010102	ATT	2	6	178592	178597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612506
3518	NC_010102	ATTGAT	2	12	178601	178612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161612506
3519	NC_010102	ACC	2	6	178640	178645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612506
3520	NC_010102	ATG	2	6	178646	178651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612506
3521	NC_010102	ATC	3	9	178655	178663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612506
3522	NC_010102	ATG	2	6	178664	178669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612506
3523	NC_010102	GTC	3	9	178670	178678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3524	NC_010102	TGG	2	6	178680	178685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612506
3525	NC_010102	TGA	2	6	178686	178691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612506
3526	NC_010102	TCG	2	6	178692	178697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3527	NC_010102	TGC	2	6	178711	178716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3528	NC_010102	AAC	2	6	178719	178724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612506
3529	NC_010102	GGT	2	6	178730	178735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612506
3530	NC_010102	CTG	2	6	178784	178789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3531	NC_010102	CGG	2	6	178814	178819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612506
3532	NC_010102	ACC	2	6	178878	178883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612506
3533	NC_010102	TGA	2	6	178906	178911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612506
3534	NC_010102	TGG	2	6	178945	178950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612506
3535	NC_010102	GTC	2	6	178953	178958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3536	NC_010102	TGC	2	6	179004	179009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612506
3537	NC_010102	GAGC	2	8	179038	179045	25 %	0 %	50 %	25 %	161612506
3538	NC_010102	CATC	2	8	179065	179072	25 %	25 %	0 %	50 %	161612506
3539	NC_010102	TGGC	2	8	179193	179200	0 %	25 %	50 %	25 %	161612506
3540	NC_010102	GCC	3	9	179424	179432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612506
3541	NC_010102	GCT	2	6	180026	180031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3542	NC_010102	GAA	3	9	180051	180059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612507
3543	NC_010102	TCC	2	6	180089	180094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612507
3544	NC_010102	GCT	2	6	180135	180140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3545	NC_010102	ACC	2	6	180156	180161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612507
3546	NC_010102	CTG	2	6	180195	180200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3547	NC_010102	ACA	2	6	180220	180225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612507
3548	NC_010102	TGAT	2	8	180235	180242	25 %	50 %	25 %	0 %	161612507
3549	NC_010102	CTG	2	6	180297	180302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3550	NC_010102	ACG	2	6	180319	180324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3551	NC_010102	AGA	2	6	180326	180331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612507
3552	NC_010102	CCG	2	6	180408	180413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3553	NC_010102	A	6	6	180421	180426	100 %	0 %	0 %	0 %	161612507
3554	NC_010102	TCACCG	2	12	180427	180438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161612507
3555	NC_010102	CGA	2	6	180467	180472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3556	NC_010102	TC	4	8	180473	180480	0 %	50 %	0 %	50 %	161612507
3557	NC_010102	GTT	2	6	180576	180581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612507
3558	NC_010102	CAAA	2	8	180590	180597	75 %	0 %	0 %	25 %	161612507
3559	NC_010102	A	6	6	180612	180617	100 %	0 %	0 %	0 %	161612507
3560	NC_010102	GTG	2	6	180645	180650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612507
3561	NC_010102	TTC	2	6	180659	180664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612507
3562	NC_010102	GCG	3	9	180733	180741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3563	NC_010102	CGG	2	6	180752	180757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3564	NC_010102	TCT	2	6	180772	180777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612507
3565	NC_010102	CGA	2	6	180938	180943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3566	NC_010102	ACC	2	6	180990	180995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612507
3567	NC_010102	AGC	2	6	181062	181067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3568	NC_010102	GGTC	2	8	181094	181101	0 %	25 %	50 %	25 %	161612507
3569	NC_010102	GCG	2	6	181108	181113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3570	NC_010102	TCCG	2	8	181123	181130	0 %	25 %	25 %	50 %	161612507
3571	NC_010102	TAC	2	6	181175	181180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612507
3572	NC_010102	CCG	2	6	181231	181236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3573	NC_010102	CAC	2	6	181292	181297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612507
3574	NC_010102	TC	3	6	181339	181344	0 %	50 %	0 %	50 %	161612507
3575	NC_010102	TGC	3	9	181387	181395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3576	NC_010102	CGG	2	6	181412	181417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3577	NC_010102	CGG	2	6	181456	181461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3578	NC_010102	TGG	2	6	181471	181476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612507
3579	NC_010102	TGC	2	6	181481	181486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3580	NC_010102	CTG	2	6	181614	181619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3581	NC_010102	GAA	2	6	181628	181633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612507
3582	NC_010102	TCT	2	6	181648	181653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612507
3583	NC_010102	CCG	2	6	181726	181731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3584	NC_010102	CTG	2	6	181806	181811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3585	NC_010102	GAT	2	6	181817	181822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612507
3586	NC_010102	CGT	2	6	181842	181847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3587	NC_010102	CGT	2	6	181857	181862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3588	NC_010102	TGGC	2	8	181881	181888	0 %	25 %	50 %	25 %	161612507
3589	NC_010102	CTG	2	6	181899	181904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3590	NC_010102	TG	3	6	181975	181980	0 %	50 %	50 %	0 %	161612507
3591	NC_010102	GAC	2	6	181995	182000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3592	NC_010102	CTG	2	6	182007	182012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3593	NC_010102	CGA	2	6	182036	182041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3594	NC_010102	GCC	2	6	182085	182090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3595	NC_010102	GCT	2	6	182096	182101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612507
3596	NC_010102	GCC	2	6	182144	182149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3597	NC_010102	CGC	2	6	182162	182167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612507
3598	NC_010102	GAA	2	6	182178	182183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612507
3599	NC_010102	TAC	2	6	182187	182192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612507
3600	NC_010102	GT	3	6	182194	182199	0 %	50 %	50 %	0 %	161612507
3601	NC_010102	GTT	2	6	182233	182238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612507
3602	NC_010102	GGT	2	6	182282	182287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612507
3603	NC_010102	CTCTAC	2	12	182288	182299	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161612507
3604	NC_010102	GGC	2	6	182360	182365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3605	NC_010102	GGC	2	6	182369	182374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3606	NC_010102	CGG	2	6	182437	182442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612507
3607	NC_010102	CT	3	6	182475	182480	0 %	50 %	0 %	50 %	161612507
3608	NC_010102	GGT	2	6	182782	182787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612508
3609	NC_010102	CG	3	6	182851	182856	0 %	0 %	50 %	50 %	161612508
3610	NC_010102	TGGA	2	8	182912	182919	25 %	25 %	50 %	0 %	161612508
3611	NC_010102	TGA	2	6	182931	182936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612508
3612	NC_010102	TTA	2	6	182989	182994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612508
3613	NC_010102	AG	3	6	183001	183006	50 %	0 %	50 %	0 %	161612508
3614	NC_010102	GGA	2	6	183025	183030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612508
3615	NC_010102	GTC	2	6	183041	183046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612508
3616	NC_010102	T	6	6	183177	183182	0 %	100 %	0 %	0 %	161612509
3617	NC_010102	T	6	6	183195	183200	0 %	100 %	0 %	0 %	161612509
3618	NC_010102	TTA	2	6	183206	183211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612509
3619	NC_010102	TTGA	2	8	183253	183260	25 %	50 %	25 %	0 %	161612509
3620	NC_010102	A	6	6	183322	183327	100 %	0 %	0 %	0 %	161612510
3621	NC_010102	CGG	2	6	183345	183350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612510
3622	NC_010102	ATG	2	6	183352	183357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612510
3623	NC_010102	CGG	2	6	183417	183422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612510
3624	NC_010102	ACC	2	6	183427	183432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612510
3625	NC_010102	CGGCG	2	10	183447	183456	0 %	0 %	60 %	40 %	161612510
3626	NC_010102	CTG	2	6	183475	183480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612510
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3637	NC_010102	GGGC	2	8	183929	183936	0 %	0 %	75 %	25 %	161612510
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3642	NC_010102	GCT	2	6	184147	184152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612510
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3862	NC_010102	ATT	2	6	195857	195862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612521
3863	NC_010102	CAC	2	6	195865	195870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612521
3864	NC_010102	TAT	2	6	195913	195918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612521
3865	NC_010102	TGG	2	6	195933	195938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612521
3866	NC_010102	TGG	2	6	196047	196052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612521
3867	NC_010102	GAGC	2	8	196117	196124	25 %	0 %	50 %	25 %	161612521
3868	NC_010102	TAA	2	6	196150	196155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612521
3869	NC_010102	GAA	2	6	196169	196174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612521
3870	NC_010102	ATG	2	6	196216	196221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612521
3871	NC_010102	GCC	2	6	196302	196307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612522
3872	NC_010102	TCA	2	6	196310	196315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612522
3873	NC_010102	TAT	2	6	196332	196337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612522
3874	NC_010102	ATG	2	6	196417	196422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612522
3875	NC_010102	TTA	2	6	196427	196432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612522
3876	NC_010102	CGT	2	6	196454	196459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3877	NC_010102	T	6	6	196462	196467	0 %	100 %	0 %	0 %	161612522
3878	NC_010102	CTG	2	6	196498	196503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3879	NC_010102	CGG	3	9	196545	196553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612522
3880	NC_010102	GC	3	6	196558	196563	0 %	0 %	50 %	50 %	161612522
3881	NC_010102	T	6	6	196603	196608	0 %	100 %	0 %	0 %	161612522
3882	NC_010102	CTG	2	6	196687	196692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3883	NC_010102	CGC	2	6	196751	196756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612522
3884	NC_010102	ACCT	2	8	196759	196766	25 %	25 %	0 %	50 %	161612522
3885	NC_010102	CGG	2	6	196767	196772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612522
3886	NC_010102	GCT	2	6	196791	196796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3887	NC_010102	GCC	2	6	196797	196802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612522
3888	NC_010102	ATG	2	6	196880	196885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612522
3889	NC_010102	GAC	2	6	196896	196901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3890	NC_010102	CGC	2	6	196926	196931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612522
3891	NC_010102	CTG	2	6	196939	196944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612522
3892	NC_010102	GCGTGG	2	12	196962	196973	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	161612522
3893	NC_010102	TC	3	6	197100	197105	0 %	50 %	0 %	50 %	161612523
3894	NC_010102	GAATCT	2	12	197109	197120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161612523
3895	NC_010102	GGT	2	6	197167	197172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612523
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3897	NC_010102	TGC	2	6	197199	197204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612523
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3901	NC_010102	CTG	2	6	197588	197593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612523
3902	NC_010102	GTT	2	6	197627	197632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612523
3903	NC_010102	CCG	2	6	197697	197702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612523
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3908	NC_010102	AT	3	6	197780	197785	50 %	50 %	0 %	0 %	161612523
3909	NC_010102	TA	3	6	197803	197808	50 %	50 %	0 %	0 %	161612523
3910	NC_010102	TGCC	2	8	197832	197839	0 %	25 %	25 %	50 %	161612523
3911	NC_010102	GTA	2	6	197866	197871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612523
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3915	NC_010102	CAG	2	6	198157	198162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612523
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3923	NC_010102	ACC	2	6	198469	198474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612524
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3934	NC_010102	CTG	2	6	198855	198860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612524
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3936	NC_010102	TCG	3	9	199036	199044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612524
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3965	NC_010102	TGC	2	6	200669	200674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612524
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3967	NC_010102	AGCGC	2	10	200691	200700	20 %	0 %	40 %	40 %	161612524
3968	NC_010102	ATAA	2	8	200702	200709	75 %	25 %	0 %	0 %	161612524
3969	NC_010102	GTTT	2	8	200769	200776	0 %	75 %	25 %	0 %	161612525
3970	NC_010102	TGA	2	6	200806	200811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612525
3971	NC_010102	GGC	3	9	200834	200842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612525
3972	NC_010102	ATA	2	6	200933	200938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612525
3973	NC_010102	TTC	2	6	200949	200954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612525
3974	NC_010102	TGC	2	6	201097	201102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612525
3975	NC_010102	CCAG	2	8	201121	201128	25 %	0 %	25 %	50 %	161612525
3976	NC_010102	GCC	2	6	201158	201163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612525
3977	NC_010102	GCG	2	6	201214	201219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612525
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3979	NC_010102	CAA	2	6	201411	201416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612525
3980	NC_010102	GCGG	2	8	201568	201575	0 %	0 %	75 %	25 %	161612526
3981	NC_010102	GTC	2	6	201593	201598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612526
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